Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165HWJ5

Protein Details
Accession A0A165HWJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-96APKANRQRKDSQQTNGRISKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-479KKKK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7.5, cyto_mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATTVSATPPQPARPAQPSQAAGKMKRPSQPASQSAANSAPGNSSSTTSPTMSKKTAPGSKQPPNATANGTTPNGIAPKANRQRKDSQQTNGRISKNAGRRFSGEGGKSSGRNSPPPLVRTTAHILRKYRDAPPSLIIHLHPTHFRFDQQDGSFGYNSPMRVILEHIKAQTVPYDMLEEMFAAGVKFYDGCLIVQIHDHRSATPSPAGVASNATKGEKKTPFSLHNYNEHLTPSPYVPFPTADQGAKKEGADETNVANVETAKSQTQTNDAQPAADQAPDGQADGTVRGPKIYTTVLHSTQLSLHAEMTIYATTPDLRGTGKRQSQAQAASGGAQSGQHPAKRQKMMLDDRNFADFEAKVLHHTHSRLFLDPVETPLEAQRLLHALRDPLHSSRPPPPKVRKRTVAELAADEAQAAEEERFMLIMDERLAPGVTAGAGAKAAAAADGQAGAGSFEPRFSRFKALENIKMQYEEKEKKKKEKELQEQLVKRQQQEQLERERRKEMEEKARQEHQMREMQMRQQQQQQARLLQAQQQQAAQAQQQQQQQQQQAAVAQQQQQQQQQQQAAQAASHAHPPQQHLPQQIPAGQGSPPVVRNQTPLNSSPLVGSMMTGAASVPMNITASQTGGSPPRPPSAAQHAHPAVAAAMAHQLSQQRSQAPSRNGTPQMPHGTPNLQQATPVVRHVTPTPRMSQASPAAAALSHTPVMNQNIMMATPQMQSAHLTPQQQAALLQRQQQQQFIQQLQQQQQQQQQQQMHGSPTQMNQMTPQQFAQLQAQQQQLQAQQGQQPQGQMPNNSQQQQYQAQLARQTAAMMNSVAANQQAAAAAAAAGNPNPAAAAAGGMQMPGPAGAARTFQQQQQQQLQLQAQKMHYQQMMQRLAHQYGGVQSIPPQLIQRVRQQAMGMTMNPQQMQHMLQQQQQQQQMLAQMGRGMMPAGGMQGMGGMAGMQGQGQGQGRGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.49
3 0.49
4 0.53
5 0.53
6 0.51
7 0.55
8 0.55
9 0.51
10 0.54
11 0.55
12 0.53
13 0.57
14 0.58
15 0.55
16 0.58
17 0.64
18 0.61
19 0.6
20 0.59
21 0.54
22 0.52
23 0.49
24 0.41
25 0.33
26 0.28
27 0.24
28 0.19
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.22
36 0.26
37 0.29
38 0.34
39 0.36
40 0.38
41 0.4
42 0.46
43 0.53
44 0.53
45 0.57
46 0.61
47 0.67
48 0.72
49 0.7
50 0.67
51 0.62
52 0.6
53 0.54
54 0.47
55 0.41
56 0.38
57 0.35
58 0.3
59 0.26
60 0.26
61 0.23
62 0.21
63 0.21
64 0.19
65 0.3
66 0.39
67 0.48
68 0.5
69 0.55
70 0.64
71 0.71
72 0.79
73 0.75
74 0.75
75 0.76
76 0.79
77 0.81
78 0.8
79 0.71
80 0.63
81 0.6
82 0.59
83 0.58
84 0.58
85 0.54
86 0.49
87 0.5
88 0.53
89 0.54
90 0.53
91 0.46
92 0.41
93 0.42
94 0.42
95 0.4
96 0.36
97 0.37
98 0.34
99 0.37
100 0.39
101 0.42
102 0.45
103 0.47
104 0.49
105 0.46
106 0.43
107 0.43
108 0.45
109 0.45
110 0.45
111 0.49
112 0.49
113 0.48
114 0.56
115 0.55
116 0.54
117 0.53
118 0.49
119 0.46
120 0.47
121 0.47
122 0.41
123 0.39
124 0.33
125 0.32
126 0.3
127 0.3
128 0.3
129 0.28
130 0.31
131 0.3
132 0.32
133 0.3
134 0.3
135 0.36
136 0.32
137 0.35
138 0.31
139 0.34
140 0.32
141 0.28
142 0.28
143 0.21
144 0.21
145 0.18
146 0.18
147 0.14
148 0.14
149 0.18
150 0.22
151 0.24
152 0.27
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.26
157 0.25
158 0.2
159 0.16
160 0.13
161 0.15
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.22
185 0.22
186 0.2
187 0.24
188 0.25
189 0.24
190 0.23
191 0.19
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.15
196 0.17
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.2
203 0.28
204 0.3
205 0.32
206 0.36
207 0.41
208 0.46
209 0.5
210 0.58
211 0.53
212 0.55
213 0.56
214 0.51
215 0.46
216 0.42
217 0.36
218 0.28
219 0.25
220 0.2
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.2
228 0.21
229 0.21
230 0.23
231 0.24
232 0.26
233 0.26
234 0.24
235 0.21
236 0.19
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.14
241 0.16
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.17
254 0.19
255 0.21
256 0.25
257 0.24
258 0.23
259 0.22
260 0.24
261 0.2
262 0.16
263 0.13
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.13
279 0.14
280 0.13
281 0.16
282 0.21
283 0.22
284 0.24
285 0.24
286 0.22
287 0.21
288 0.23
289 0.19
290 0.15
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.14
307 0.23
308 0.27
309 0.3
310 0.33
311 0.35
312 0.38
313 0.37
314 0.35
315 0.28
316 0.23
317 0.22
318 0.18
319 0.15
320 0.11
321 0.09
322 0.08
323 0.12
324 0.14
325 0.14
326 0.2
327 0.26
328 0.34
329 0.37
330 0.38
331 0.37
332 0.44
333 0.51
334 0.54
335 0.53
336 0.48
337 0.46
338 0.46
339 0.42
340 0.33
341 0.26
342 0.16
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.15
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.2
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.2
357 0.2
358 0.19
359 0.19
360 0.16
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.14
374 0.17
375 0.18
376 0.18
377 0.22
378 0.21
379 0.24
380 0.31
381 0.38
382 0.4
383 0.47
384 0.56
385 0.62
386 0.71
387 0.76
388 0.76
389 0.72
390 0.74
391 0.72
392 0.65
393 0.56
394 0.47
395 0.41
396 0.32
397 0.27
398 0.19
399 0.12
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.04
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.03
434 0.03
435 0.02
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.06
443 0.08
444 0.11
445 0.12
446 0.17
447 0.18
448 0.22
449 0.29
450 0.32
451 0.37
452 0.38
453 0.38
454 0.33
455 0.34
456 0.3
457 0.25
458 0.29
459 0.29
460 0.34
461 0.43
462 0.46
463 0.54
464 0.61
465 0.67
466 0.69
467 0.72
468 0.75
469 0.75
470 0.79
471 0.78
472 0.73
473 0.68
474 0.66
475 0.57
476 0.48
477 0.43
478 0.39
479 0.37
480 0.41
481 0.41
482 0.45
483 0.53
484 0.55
485 0.52
486 0.52
487 0.46
488 0.44
489 0.45
490 0.42
491 0.43
492 0.48
493 0.51
494 0.51
495 0.54
496 0.54
497 0.51
498 0.47
499 0.41
500 0.38
501 0.35
502 0.35
503 0.33
504 0.34
505 0.36
506 0.37
507 0.35
508 0.36
509 0.39
510 0.39
511 0.43
512 0.41
513 0.38
514 0.35
515 0.34
516 0.29
517 0.3
518 0.31
519 0.27
520 0.25
521 0.23
522 0.22
523 0.22
524 0.22
525 0.17
526 0.16
527 0.19
528 0.23
529 0.26
530 0.3
531 0.33
532 0.37
533 0.38
534 0.34
535 0.3
536 0.25
537 0.23
538 0.2
539 0.19
540 0.17
541 0.18
542 0.21
543 0.25
544 0.28
545 0.31
546 0.34
547 0.34
548 0.35
549 0.34
550 0.31
551 0.29
552 0.28
553 0.24
554 0.2
555 0.17
556 0.15
557 0.13
558 0.16
559 0.15
560 0.14
561 0.16
562 0.2
563 0.24
564 0.28
565 0.32
566 0.3
567 0.31
568 0.33
569 0.33
570 0.31
571 0.27
572 0.21
573 0.18
574 0.16
575 0.15
576 0.13
577 0.14
578 0.12
579 0.13
580 0.15
581 0.14
582 0.16
583 0.19
584 0.2
585 0.22
586 0.22
587 0.25
588 0.23
589 0.23
590 0.21
591 0.18
592 0.16
593 0.13
594 0.11
595 0.07
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.04
604 0.05
605 0.05
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.07
612 0.08
613 0.1
614 0.11
615 0.15
616 0.17
617 0.18
618 0.19
619 0.2
620 0.23
621 0.3
622 0.35
623 0.32
624 0.38
625 0.37
626 0.36
627 0.35
628 0.3
629 0.2
630 0.15
631 0.13
632 0.05
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.08
637 0.11
638 0.13
639 0.16
640 0.18
641 0.19
642 0.22
643 0.26
644 0.33
645 0.34
646 0.37
647 0.38
648 0.42
649 0.42
650 0.41
651 0.39
652 0.38
653 0.4
654 0.36
655 0.35
656 0.3
657 0.3
658 0.3
659 0.35
660 0.32
661 0.26
662 0.25
663 0.25
664 0.27
665 0.25
666 0.25
667 0.2
668 0.16
669 0.18
670 0.22
671 0.28
672 0.29
673 0.3
674 0.32
675 0.33
676 0.35
677 0.34
678 0.37
679 0.33
680 0.29
681 0.27
682 0.24
683 0.19
684 0.17
685 0.17
686 0.12
687 0.1
688 0.09
689 0.08
690 0.09
691 0.12
692 0.15
693 0.15
694 0.13
695 0.12
696 0.12
697 0.12
698 0.12
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.09
704 0.09
705 0.11
706 0.12
707 0.18
708 0.19
709 0.21
710 0.21
711 0.24
712 0.24
713 0.23
714 0.23
715 0.21
716 0.25
717 0.26
718 0.32
719 0.35
720 0.41
721 0.42
722 0.45
723 0.42
724 0.41
725 0.45
726 0.4
727 0.39
728 0.36
729 0.41
730 0.43
731 0.47
732 0.45
733 0.44
734 0.49
735 0.52
736 0.53
737 0.54
738 0.51
739 0.49
740 0.49
741 0.46
742 0.42
743 0.36
744 0.33
745 0.28
746 0.27
747 0.3
748 0.27
749 0.24
750 0.24
751 0.31
752 0.31
753 0.3
754 0.29
755 0.25
756 0.24
757 0.26
758 0.28
759 0.25
760 0.25
761 0.3
762 0.33
763 0.32
764 0.32
765 0.33
766 0.3
767 0.3
768 0.29
769 0.26
770 0.28
771 0.31
772 0.33
773 0.31
774 0.31
775 0.29
776 0.34
777 0.35
778 0.32
779 0.32
780 0.37
781 0.42
782 0.43
783 0.43
784 0.37
785 0.39
786 0.41
787 0.39
788 0.37
789 0.34
790 0.33
791 0.36
792 0.35
793 0.31
794 0.26
795 0.25
796 0.2
797 0.18
798 0.17
799 0.12
800 0.12
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.09
805 0.08
806 0.06
807 0.07
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.06
816 0.05
817 0.06
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.05
825 0.05
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.05
833 0.05
834 0.04
835 0.06
836 0.07
837 0.09
838 0.1
839 0.17
840 0.19
841 0.22
842 0.3
843 0.34
844 0.41
845 0.47
846 0.52
847 0.48
848 0.52
849 0.54
850 0.51
851 0.5
852 0.48
853 0.41
854 0.42
855 0.41
856 0.42
857 0.38
858 0.36
859 0.36
860 0.4
861 0.45
862 0.4
863 0.44
864 0.43
865 0.43
866 0.41
867 0.37
868 0.28
869 0.24
870 0.27
871 0.21
872 0.16
873 0.17
874 0.22
875 0.22
876 0.22
877 0.21
878 0.23
879 0.3
880 0.34
881 0.41
882 0.45
883 0.45
884 0.47
885 0.46
886 0.43
887 0.42
888 0.41
889 0.32
890 0.26
891 0.3
892 0.31
893 0.3
894 0.27
895 0.23
896 0.22
897 0.24
898 0.26
899 0.3
900 0.31
901 0.36
902 0.43
903 0.49
904 0.54
905 0.56
906 0.51
907 0.44
908 0.42
909 0.4
910 0.37
911 0.3
912 0.23
913 0.2
914 0.19
915 0.18
916 0.16
917 0.13
918 0.09
919 0.09
920 0.08
921 0.07
922 0.07
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.05
927 0.05
928 0.04
929 0.03
930 0.03
931 0.04
932 0.04
933 0.04
934 0.04
935 0.05
936 0.09
937 0.11