FuNGI

A0A165FNH4

Protein Details

Accession

A0A165FNH4

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-49	IADPLVRPKKRDRTMRRPPSGAV	Hydrophilic
205-229	AHTNQPKKPNAFKKKTQQVFRNDKS	Hydrophilic
531-556	EASGTESTRKKHKKKHGPSSQPTASA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-46	IRRPRIADPLVRPKKRDRTMRRPPS
425-435	KEKELLKKFGK
478-492	RKKEEEKKAVEKGKR
539-548	RKKHKKKHGP

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPSNVPSGRTPNGGGPPMIRRPRIADPLVRPKKRDRTMRRPPSGAVGGNRPPSQPPQQPGTNAASAGTPQSTPGPRSLAMGTGIADSGFSAVPDGPYTDYPLVTTKRALLEGLRYHVAKFSSKKFVDPRNEAEFTRPVRLHRRDPRAPPAGPGAAKTEDVSMTDVDSKEALMDDKEREKQEALRAEKEAEREANLAQIAPAAHTNQPKKPNAFKKKTQQVFRNDKSEEGQAQSKLRYEEALPWHLEDFDNKNTWVGNYESALSESYAILVMEPTAVFRMIPIEKWYKFTAKAQFKTLTIEEAEDRMRQKVKEPRWFMDSQRQTAESQKAAQDRRAYNKLYVGKSNNEDTGVGPIKAEGGGDADDLDFTEDRFADDEENQLFEGDEEENKEAEDRIKRDQLQANIFDLKDQKEYEKAEAAEKKEKELLKKFGKTTRKTLTRREKNFIYADDDSDHPYSEESESEDSETERLKDEERKKEEEKKAVEKGKREESGTSSKGTTTPSGRDKHFDATKKSSTLKRSGSPNLSEASGTESTRKKHKKKHGPSSQPTASAPGSRPMSPAPSEPGRPLQQRKSTGIKLIFKAPKLTNVSSTAPRQPTRAGSGSEAEATAGETSDAGKKTKIKLRLGGSPVGGTPQGSRAASPEAGQAGAIGSRSGSPDGPKLAAATADEIIASIPNEGTTIAALLARFKGRVGDRQRFISLVRAHSRFGPDKLLRPRGTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.41
4	0.38
5	0.34
6	0.39
7	0.46
8	0.51
9	0.47
10	0.43
11	0.47
12	0.54
13	0.58
14	0.56
15	0.55
16	0.57
17	0.66
18	0.74
19	0.73
20	0.7
21	0.72
22	0.77
23	0.78
24	0.79
25	0.79
26	0.79
27	0.85
28	0.91
29	0.9
30	0.83
31	0.76
32	0.73
33	0.69
34	0.63
35	0.55
36	0.52
37	0.5
38	0.52
39	0.52
40	0.45
41	0.42
42	0.44
43	0.49
44	0.49
45	0.47
46	0.48
47	0.51
48	0.52
49	0.54
50	0.53
51	0.45
52	0.38
53	0.33
54	0.26
55	0.22
56	0.21
57	0.17
58	0.12
59	0.11
60	0.17
61	0.21
62	0.22
63	0.24
64	0.26
65	0.25
66	0.28
67	0.28
68	0.24
69	0.21
70	0.2
71	0.18
72	0.14
73	0.14
74	0.11
75	0.1
76	0.08
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.07
82	0.08
83	0.08
84	0.1
85	0.11
86	0.11
87	0.17
88	0.17
89	0.16
90	0.17
91	0.22
92	0.24
93	0.23
94	0.24
95	0.22
96	0.23
97	0.24
98	0.24
99	0.2
100	0.25
101	0.27
102	0.3
103	0.3
104	0.28
105	0.27
106	0.3
107	0.3
108	0.29
109	0.3
110	0.32
111	0.39
112	0.4
113	0.46
114	0.51
115	0.58
116	0.61
117	0.62
118	0.62
119	0.6
120	0.62
121	0.56
122	0.52
123	0.5
124	0.44
125	0.45
126	0.4
127	0.37
128	0.45
129	0.51
130	0.57
131	0.61
132	0.67
133	0.68
134	0.74
135	0.78
136	0.76
137	0.7
138	0.62
139	0.58
140	0.53
141	0.45
142	0.39
143	0.34
144	0.27
145	0.27
146	0.25
147	0.2
148	0.15
149	0.16
150	0.16
151	0.12
152	0.11
153	0.14
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.11
158	0.1
159	0.11
160	0.1
161	0.08
162	0.11
163	0.14
164	0.19
165	0.25
166	0.26
167	0.28
168	0.29
169	0.31
170	0.36
171	0.41
172	0.4
173	0.39
174	0.39
175	0.39
176	0.4
177	0.38
178	0.34
179	0.27
180	0.23
181	0.21
182	0.2
183	0.19
184	0.17
185	0.14
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.14
193	0.2
194	0.25
195	0.3
196	0.38
197	0.42
198	0.47
199	0.55
200	0.62
201	0.67
202	0.71
203	0.73
204	0.76
205	0.81
206	0.83
207	0.82
208	0.79
209	0.79
210	0.81
211	0.77
212	0.74
213	0.64
214	0.58
215	0.51
216	0.48
217	0.39
218	0.32
219	0.31
220	0.26
221	0.28
222	0.27
223	0.27
224	0.24
225	0.22
226	0.2
227	0.17
228	0.21
229	0.24
230	0.26
231	0.24
232	0.24
233	0.24
234	0.23
235	0.22
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.19
240	0.19
241	0.19
242	0.18
243	0.18
244	0.17
245	0.14
246	0.12
247	0.11
248	0.12
249	0.11
250	0.12
251	0.12
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.13
272	0.19
273	0.2
274	0.23
275	0.26
276	0.25
277	0.26
278	0.31
279	0.37
280	0.4
281	0.41
282	0.43
283	0.43
284	0.41
285	0.43
286	0.37
287	0.29
288	0.2
289	0.19
290	0.15
291	0.14
292	0.15
293	0.13
294	0.14
295	0.15
296	0.18
297	0.17
298	0.24
299	0.31
300	0.38
301	0.46
302	0.5
303	0.49
304	0.52
305	0.54
306	0.5
307	0.51
308	0.47
309	0.4
310	0.37
311	0.36
312	0.31
313	0.34
314	0.34
315	0.25
316	0.22
317	0.23
318	0.27
319	0.27
320	0.29
321	0.31
322	0.31
323	0.37
324	0.4
325	0.38
326	0.33
327	0.38
328	0.41
329	0.36
330	0.37
331	0.33
332	0.32
333	0.33
334	0.33
335	0.28
336	0.22
337	0.2
338	0.16
339	0.18
340	0.16
341	0.14
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.1
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.11
382	0.15
383	0.16
384	0.2
385	0.25
386	0.26
387	0.31
388	0.35
389	0.36
390	0.36
391	0.36
392	0.34
393	0.31
394	0.3
395	0.26
396	0.23
397	0.2
398	0.18
399	0.17
400	0.16
401	0.18
402	0.2
403	0.2
404	0.21
405	0.21
406	0.24
407	0.28
408	0.31
409	0.34
410	0.33
411	0.33
412	0.34
413	0.36
414	0.37
415	0.39
416	0.44
417	0.45
418	0.5
419	0.52
420	0.55
421	0.62
422	0.59
423	0.6
424	0.61
425	0.63
426	0.62
427	0.69
428	0.72
429	0.73
430	0.75
431	0.74
432	0.67
433	0.62
434	0.6
435	0.52
436	0.47
437	0.37
438	0.32
439	0.28
440	0.26
441	0.23
442	0.21
443	0.19
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.11
452	0.11
453	0.12
454	0.11
455	0.11
456	0.12
457	0.1
458	0.11
459	0.11
460	0.13
461	0.22
462	0.3
463	0.39
464	0.43
465	0.49
466	0.53
467	0.63
468	0.67
469	0.66
470	0.64
471	0.62
472	0.65
473	0.67
474	0.65
475	0.62
476	0.61
477	0.61
478	0.57
479	0.51
480	0.45
481	0.42
482	0.46
483	0.41
484	0.36
485	0.28
486	0.26
487	0.26
488	0.26
489	0.24
490	0.19
491	0.24
492	0.29
493	0.33
494	0.34
495	0.36
496	0.37
497	0.41
498	0.45
499	0.45
500	0.45
501	0.47
502	0.5
503	0.5
504	0.53
505	0.51
506	0.5
507	0.51
508	0.49
509	0.48
510	0.51
511	0.54
512	0.55
513	0.51
514	0.48
515	0.41
516	0.36
517	0.31
518	0.24
519	0.22
520	0.19
521	0.17
522	0.21
523	0.23
524	0.26
525	0.36
526	0.46
527	0.5
528	0.58
529	0.68
530	0.74
531	0.81
532	0.9
533	0.91
534	0.91
535	0.9
536	0.89
537	0.82
538	0.74
539	0.63
540	0.56
541	0.46
542	0.39
543	0.33
544	0.3
545	0.29
546	0.26
547	0.27
548	0.25
549	0.28
550	0.26
551	0.26
552	0.25
553	0.27
554	0.28
555	0.3
556	0.35
557	0.37
558	0.43
559	0.49
560	0.53
561	0.57
562	0.6
563	0.63
564	0.64
565	0.61
566	0.6
567	0.6
568	0.57
569	0.51
570	0.56
571	0.55
572	0.48
573	0.52
574	0.46
575	0.46
576	0.46
577	0.46
578	0.4
579	0.4
580	0.43
581	0.41
582	0.44
583	0.44
584	0.44
585	0.43
586	0.42
587	0.41
588	0.41
589	0.43
590	0.42
591	0.36
592	0.32
593	0.33
594	0.32
595	0.29
596	0.25
597	0.18
598	0.14
599	0.13
600	0.1
601	0.08
602	0.06
603	0.05
604	0.07
605	0.12
606	0.14
607	0.14
608	0.18
609	0.23
610	0.31
611	0.39
612	0.46
613	0.47
614	0.53
615	0.57
616	0.62
617	0.61
618	0.58
619	0.51
620	0.44
621	0.38
622	0.32
623	0.27
624	0.19
625	0.16
626	0.15
627	0.18
628	0.17
629	0.17
630	0.18
631	0.22
632	0.22
633	0.22
634	0.21
635	0.18
636	0.18
637	0.17
638	0.14
639	0.11
640	0.11
641	0.1
642	0.07
643	0.06
644	0.07
645	0.1
646	0.11
647	0.12
648	0.15
649	0.19
650	0.22
651	0.22
652	0.22
653	0.21
654	0.2
655	0.19
656	0.17
657	0.16
658	0.13
659	0.12
660	0.11
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.09
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.06
672	0.07
673	0.06
674	0.08
675	0.08
676	0.1
677	0.13
678	0.15
679	0.15
680	0.14
681	0.21
682	0.24
683	0.33
684	0.41
685	0.47
686	0.5
687	0.56
688	0.58
689	0.52
690	0.49
691	0.49
692	0.45
693	0.44
694	0.47
695	0.44
696	0.44
697	0.47
698	0.54
699	0.5
700	0.47
701	0.48
702	0.44
703	0.52
704	0.6
705	0.66

A0A165FNH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer