Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165FIF6

Protein Details
Accession A0A165FIF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-79VTGSRVKPTQPQERRRAPRTTKPASSPPKNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-203ARR
443-453KPPPAPQPRKK
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 6.5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPRSRGNYPNRRAGRNGFAKLHSRISPAPEEVHEIISLDEESDNSVVVTGSRVKPTQPQERRRAPRTTKPASSPPKNDAMPNVYLEMLHDASALSQHEPSDRASKRRRVESRLGAESLDYEPQHDVISVPEDSPGHTTRPPPQIIFDDDESSEESDFDWEEVDLARDTAAETPSAAEEGPSKGLDIVIGGERSGPERKVARRRPVTAYEKKARLDIHKTHLLCLVAHACMRSTWCNDDEVQSSLQVLLSKKTQSYLVPNATLSQFQRSRSFMDGLAQASEIWRNKFNITARGLRNAVWAENEETLKNYKLPEDTDTPMDLSDFRSAAKRLQGSRDIGAQLFCALLRSVGVTARLVCSLQPLPFSSSKSATAQPSTPNYIYADTGSSDSSGEDDHGIDLNGPSPAFGASSTAQGVGGAPVLPPRIRRIGQPFFGEPRRMDIGKPPPAPQPRKKFRESPFPVYWVEVFNEALQKWIPVDPLVTKTIAKPSKFEPPASDIENTMSYVVGLEAEGEVKDVTRRYAKAYNGKTRKLRVESTKGGDRWWWKALRKLRRGWVLDRDQVEDGELAAREASEEMPRNVQDFKDHPYYALERHLKRNEVIFPKREVGKMSVGRTSSTGPGKALEPIYRRRDVNIVKSADGWYRLGREIKAGEQPLKFVTARRNQVQSFEDDDDRTAQDAGVGLYAEFQTTLYEPPPIVNGRVPKNAFGNLDVYVPTMVPKGGFHIADSEAARAASIVGVDYADAVTGFEFRGRQGTAVVRGIIAPAEYQEAIEAVIQGLRDEQAAAEEALRSAEAVRMWKRFLVALRIKERISGYDIEGMQEEEDRRDLEDEQDDAEAEGGGFFMDRDQVEIAEPTAPPFNEQLHMTGPLLQSGHDDNADKGSAKITLTLGEDFPGSYTTQPAVESEYAAGGGFFAEDDGGGGGFLFEENLPADAAHSAVSEGSGGGFVPQGEGVNNSLDYHEANPKPGDANIYEPQNNSHLLAEGSTNEAEPVGEESDELEKGSLLSHDPEDEDAEPEWLIDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.7
3 0.68
4 0.68
5 0.63
6 0.61
7 0.63
8 0.61
9 0.61
10 0.53
11 0.49
12 0.45
13 0.46
14 0.46
15 0.42
16 0.41
17 0.36
18 0.4
19 0.36
20 0.34
21 0.28
22 0.23
23 0.2
24 0.19
25 0.17
26 0.11
27 0.1
28 0.08
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.1
37 0.15
38 0.18
39 0.23
40 0.24
41 0.26
42 0.34
43 0.43
44 0.51
45 0.55
46 0.62
47 0.68
48 0.78
49 0.86
50 0.84
51 0.86
52 0.84
53 0.84
54 0.84
55 0.83
56 0.8
57 0.77
58 0.8
59 0.8
60 0.81
61 0.76
62 0.71
63 0.71
64 0.65
65 0.6
66 0.56
67 0.51
68 0.44
69 0.4
70 0.36
71 0.28
72 0.26
73 0.24
74 0.22
75 0.17
76 0.14
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.13
81 0.14
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.19
88 0.26
89 0.3
90 0.39
91 0.47
92 0.55
93 0.61
94 0.71
95 0.76
96 0.74
97 0.79
98 0.8
99 0.79
100 0.75
101 0.68
102 0.57
103 0.49
104 0.43
105 0.35
106 0.29
107 0.2
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.15
113 0.13
114 0.1
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.19
122 0.2
123 0.19
124 0.22
125 0.26
126 0.31
127 0.39
128 0.42
129 0.38
130 0.41
131 0.42
132 0.44
133 0.45
134 0.39
135 0.33
136 0.3
137 0.3
138 0.27
139 0.24
140 0.19
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.16
182 0.15
183 0.18
184 0.24
185 0.34
186 0.44
187 0.53
188 0.61
189 0.66
190 0.71
191 0.72
192 0.76
193 0.77
194 0.75
195 0.76
196 0.74
197 0.71
198 0.66
199 0.63
200 0.58
201 0.55
202 0.54
203 0.51
204 0.49
205 0.52
206 0.51
207 0.49
208 0.48
209 0.42
210 0.33
211 0.3
212 0.24
213 0.18
214 0.18
215 0.17
216 0.14
217 0.13
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.21
222 0.21
223 0.23
224 0.23
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.21
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.13
236 0.16
237 0.18
238 0.18
239 0.19
240 0.2
241 0.19
242 0.25
243 0.31
244 0.31
245 0.31
246 0.3
247 0.31
248 0.3
249 0.31
250 0.25
251 0.25
252 0.24
253 0.26
254 0.3
255 0.3
256 0.32
257 0.33
258 0.33
259 0.25
260 0.26
261 0.26
262 0.22
263 0.21
264 0.18
265 0.14
266 0.13
267 0.17
268 0.17
269 0.17
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.26
274 0.28
275 0.31
276 0.32
277 0.38
278 0.37
279 0.41
280 0.41
281 0.36
282 0.37
283 0.31
284 0.27
285 0.2
286 0.2
287 0.17
288 0.19
289 0.19
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.15
297 0.16
298 0.18
299 0.2
300 0.23
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.22
305 0.2
306 0.19
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.1
311 0.1
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.21
316 0.24
317 0.25
318 0.3
319 0.35
320 0.34
321 0.35
322 0.35
323 0.31
324 0.27
325 0.24
326 0.19
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.18
350 0.2
351 0.23
352 0.21
353 0.21
354 0.23
355 0.24
356 0.27
357 0.25
358 0.25
359 0.24
360 0.26
361 0.27
362 0.3
363 0.27
364 0.24
365 0.23
366 0.22
367 0.2
368 0.17
369 0.14
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.11
411 0.17
412 0.17
413 0.22
414 0.3
415 0.35
416 0.38
417 0.4
418 0.39
419 0.39
420 0.41
421 0.39
422 0.3
423 0.29
424 0.29
425 0.26
426 0.24
427 0.26
428 0.32
429 0.38
430 0.39
431 0.37
432 0.41
433 0.5
434 0.58
435 0.59
436 0.61
437 0.63
438 0.68
439 0.7
440 0.71
441 0.67
442 0.71
443 0.69
444 0.66
445 0.59
446 0.56
447 0.51
448 0.43
449 0.39
450 0.29
451 0.22
452 0.15
453 0.12
454 0.1
455 0.12
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.11
470 0.12
471 0.2
472 0.24
473 0.23
474 0.22
475 0.23
476 0.33
477 0.34
478 0.34
479 0.28
480 0.28
481 0.3
482 0.31
483 0.29
484 0.19
485 0.19
486 0.19
487 0.16
488 0.12
489 0.09
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.04
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.07
505 0.1
506 0.11
507 0.15
508 0.2
509 0.25
510 0.33
511 0.4
512 0.48
513 0.51
514 0.56
515 0.56
516 0.56
517 0.58
518 0.53
519 0.51
520 0.48
521 0.5
522 0.49
523 0.49
524 0.51
525 0.44
526 0.41
527 0.39
528 0.34
529 0.31
530 0.31
531 0.31
532 0.27
533 0.34
534 0.42
535 0.49
536 0.53
537 0.55
538 0.57
539 0.6
540 0.62
541 0.58
542 0.59
543 0.54
544 0.52
545 0.47
546 0.43
547 0.35
548 0.31
549 0.28
550 0.19
551 0.13
552 0.09
553 0.08
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.05
559 0.06
560 0.07
561 0.09
562 0.1
563 0.12
564 0.13
565 0.14
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.19
571 0.23
572 0.23
573 0.22
574 0.24
575 0.25
576 0.23
577 0.3
578 0.32
579 0.29
580 0.37
581 0.4
582 0.39
583 0.38
584 0.4
585 0.39
586 0.41
587 0.44
588 0.39
589 0.38
590 0.4
591 0.41
592 0.39
593 0.34
594 0.28
595 0.3
596 0.31
597 0.3
598 0.29
599 0.28
600 0.27
601 0.26
602 0.25
603 0.22
604 0.2
605 0.19
606 0.16
607 0.16
608 0.16
609 0.18
610 0.18
611 0.18
612 0.2
613 0.27
614 0.32
615 0.35
616 0.35
617 0.33
618 0.4
619 0.4
620 0.43
621 0.43
622 0.39
623 0.36
624 0.37
625 0.37
626 0.3
627 0.28
628 0.21
629 0.15
630 0.15
631 0.17
632 0.19
633 0.17
634 0.18
635 0.18
636 0.19
637 0.23
638 0.23
639 0.25
640 0.23
641 0.24
642 0.22
643 0.24
644 0.22
645 0.2
646 0.26
647 0.29
648 0.35
649 0.38
650 0.43
651 0.4
652 0.44
653 0.43
654 0.38
655 0.35
656 0.31
657 0.29
658 0.24
659 0.24
660 0.21
661 0.2
662 0.17
663 0.13
664 0.1
665 0.08
666 0.09
667 0.08
668 0.07
669 0.06
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.08
682 0.09
683 0.12
684 0.12
685 0.13
686 0.15
687 0.21
688 0.24
689 0.32
690 0.32
691 0.31
692 0.33
693 0.34
694 0.32
695 0.27
696 0.24
697 0.18
698 0.18
699 0.16
700 0.14
701 0.11
702 0.1
703 0.09
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.1
709 0.12
710 0.12
711 0.12
712 0.14
713 0.15
714 0.17
715 0.18
716 0.15
717 0.12
718 0.12
719 0.11
720 0.09
721 0.08
722 0.05
723 0.05
724 0.04
725 0.04
726 0.04
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.04
731 0.03
732 0.03
733 0.03
734 0.04
735 0.04
736 0.06
737 0.06
738 0.07
739 0.1
740 0.11
741 0.11
742 0.13
743 0.16
744 0.19
745 0.21
746 0.2
747 0.17
748 0.17
749 0.17
750 0.14
751 0.11
752 0.07
753 0.05
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.06
762 0.05
763 0.06
764 0.06
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.06
781 0.08
782 0.09
783 0.14
784 0.19
785 0.21
786 0.23
787 0.24
788 0.24
789 0.25
790 0.26
791 0.3
792 0.33
793 0.39
794 0.43
795 0.46
796 0.45
797 0.46
798 0.44
799 0.36
800 0.33
801 0.27
802 0.23
803 0.26
804 0.26
805 0.23
806 0.22
807 0.2
808 0.17
809 0.18
810 0.16
811 0.12
812 0.13
813 0.13
814 0.13
815 0.15
816 0.15
817 0.16
818 0.18
819 0.17
820 0.17
821 0.16
822 0.15
823 0.14
824 0.13
825 0.09
826 0.06
827 0.06
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.03
832 0.04
833 0.06
834 0.06
835 0.08
836 0.09
837 0.09
838 0.11
839 0.11
840 0.12
841 0.11
842 0.11
843 0.11
844 0.15
845 0.14
846 0.15
847 0.17
848 0.18
849 0.18
850 0.19
851 0.2
852 0.18
853 0.21
854 0.19
855 0.22
856 0.2
857 0.2
858 0.19
859 0.17
860 0.17
861 0.17
862 0.19
863 0.16
864 0.17
865 0.15
866 0.18
867 0.19
868 0.17
869 0.15
870 0.15
871 0.15
872 0.14
873 0.15
874 0.13
875 0.15
876 0.16
877 0.18
878 0.17
879 0.15
880 0.15
881 0.13
882 0.13
883 0.12
884 0.1
885 0.09
886 0.11
887 0.11
888 0.12
889 0.12
890 0.12
891 0.16
892 0.15
893 0.16
894 0.14
895 0.14
896 0.13
897 0.12
898 0.11
899 0.06
900 0.06
901 0.05
902 0.04
903 0.04
904 0.03
905 0.03
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.04
912 0.04
913 0.04
914 0.05
915 0.04
916 0.06
917 0.06
918 0.07
919 0.08
920 0.07
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.07
925 0.07
926 0.07
927 0.06
928 0.07
929 0.06
930 0.06
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.06
936 0.06
937 0.07
938 0.07
939 0.08
940 0.08
941 0.1
942 0.11
943 0.12
944 0.13
945 0.12
946 0.12
947 0.12
948 0.13
949 0.15
950 0.23
951 0.22
952 0.26
953 0.26
954 0.27
955 0.28
956 0.28
957 0.29
958 0.22
959 0.28
960 0.29
961 0.35
962 0.36
963 0.35
964 0.36
965 0.34
966 0.34
967 0.29
968 0.24
969 0.19
970 0.17
971 0.17
972 0.15
973 0.14
974 0.15
975 0.14
976 0.13
977 0.12
978 0.12
979 0.11
980 0.1
981 0.12
982 0.1
983 0.1
984 0.09
985 0.11
986 0.14
987 0.14
988 0.14
989 0.11
990 0.1
991 0.1
992 0.11
993 0.11
994 0.1
995 0.13
996 0.14
997 0.15
998 0.16
999 0.18
1000 0.2
1001 0.2
1002 0.2
1003 0.18
1004 0.17
1005 0.16