FuNGI

E4UP39

Protein Details

Accession

E4UP39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
114-137	AVDEKMDKRRKARREARERQEMEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-130	KRRKARREAR

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 6.5, cyto_mito 5.5, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13181 TPR_8

Amino Acid Sequences

MSGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAALLGTAPPTAYGASNRGEKGGKAEKEEEDDDRYQDPENETGLFAYGQYDRDDDEADQVYQAVDEKMDKRRKARREARERQEMEEYERKNPKIQQQFADLKRSLASVSDEDWANIPEVGDLTGKNRRARQNMRQRFYAVPDSVIANARDSTEFTTTINDDGTESYVPRGENADGTITNFADIGAARDKVLQVRLDQAAEGSSGDVASGSATSIDPKGYLTSLTKSEMKAGEVEIGDIKRVRTLLESVTKTNPKHPPGWIAIARLEEIAGRIGAARNYIARGCELCPKSEDVWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKNNDRSTRLWIEAMKLESDPRAKKNVLRQAILHVPQSVIIWKEAVNLEENPDDARLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSRDIWIAAARLQEQMGTANKVNVMKRAVQSLARDSAMPKREEWIIEAEKCEEEDAILTCNAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDAKGSIARGKYETARAIYAYALRVFVNKKSVWLAAADLERNHGTKESLWQLLEKGVEACPQCEDLWMQLAKEKWQAGEIDNTRRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADTNQIEQARELLSTARREAGTDRVWIKSVAYERQLGNKDHALNLVNQGLQLYPKADKLWMLKGQIYESDGQLQQAREAYGTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKAGVVVKARSVLDRARLAVPKNAELWTESKSPNSGLLWSESIWHLEPRTHRKPRSLEAIKKVDNDPILFVTVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVANSDLGDVWAWYYKFLLQHGTDEKREDVLTKCIATEPKHGEIWQTVSKDPANAHKTTEEILKITLNRLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.31
3	0.28
4	0.25
5	0.2
6	0.15
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.08
12	0.09
13	0.1
14	0.11
15	0.15
16	0.15
17	0.16
18	0.2
19	0.23
20	0.25
21	0.29
22	0.3
23	0.29
24	0.32
25	0.34
26	0.32
27	0.38
28	0.37
29	0.32
30	0.32
31	0.29
32	0.27
33	0.31
34	0.31
35	0.27
36	0.25
37	0.25
38	0.22
39	0.25
40	0.23
41	0.17
42	0.14
43	0.15
44	0.17
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.16
49	0.16
50	0.16
51	0.14
52	0.15
53	0.18
54	0.23
55	0.24
56	0.26
57	0.27
58	0.26
59	0.31
60	0.37
61	0.37
62	0.37
63	0.41
64	0.4
65	0.45
66	0.47
67	0.43
68	0.39
69	0.38
70	0.35
71	0.32
72	0.3
73	0.26
74	0.27
75	0.27
76	0.23
77	0.23
78	0.21
79	0.2
80	0.19
81	0.18
82	0.14
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.13
88	0.13
89	0.13
90	0.15
91	0.17
92	0.14
93	0.17
94	0.18
95	0.17
96	0.16
97	0.15
98	0.14
99	0.12
100	0.13
101	0.09
102	0.08
103	0.12
104	0.16
105	0.26
106	0.35
107	0.4
108	0.48
109	0.57
110	0.65
111	0.72
112	0.78
113	0.8
114	0.82
115	0.88
116	0.89
117	0.9
118	0.83
119	0.77
120	0.74
121	0.65
122	0.61
123	0.58
124	0.51
125	0.5
126	0.55
127	0.51
128	0.49
129	0.53
130	0.55
131	0.58
132	0.62
133	0.57
134	0.58
135	0.66
136	0.64
137	0.67
138	0.57
139	0.48
140	0.42
141	0.39
142	0.3
143	0.22
144	0.22
145	0.15
146	0.16
147	0.18
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.17
152	0.14
153	0.13
154	0.11
155	0.08
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.12
161	0.19
162	0.24
163	0.29
164	0.36
165	0.43
166	0.52
167	0.61
168	0.67
169	0.72
170	0.78
171	0.77
172	0.74
173	0.7
174	0.63
175	0.59
176	0.56
177	0.45
178	0.36
179	0.32
180	0.29
181	0.27
182	0.28
183	0.22
184	0.16
185	0.15
186	0.16
187	0.15
188	0.15
189	0.16
190	0.15
191	0.15
192	0.14
193	0.17
194	0.16
195	0.16
196	0.15
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.13
211	0.15
212	0.13
213	0.14
214	0.15
215	0.13
216	0.12
217	0.11
218	0.1
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.13
227	0.14
228	0.18
229	0.16
230	0.15
231	0.19
232	0.2
233	0.2
234	0.19
235	0.17
236	0.14
237	0.13
238	0.12
239	0.07
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.1
258	0.11
259	0.13
260	0.15
261	0.18
262	0.2
263	0.19
264	0.23
265	0.22
266	0.21
267	0.19
268	0.18
269	0.18
270	0.15
271	0.16
272	0.14
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.13
282	0.16
283	0.23
284	0.25
285	0.27
286	0.33
287	0.38
288	0.37
289	0.43
290	0.45
291	0.41
292	0.42
293	0.42
294	0.41
295	0.39
296	0.45
297	0.39
298	0.33
299	0.32
300	0.29
301	0.27
302	0.21
303	0.18
304	0.11
305	0.1
306	0.08
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.12
321	0.2
322	0.2
323	0.2
324	0.21
325	0.24
326	0.24
327	0.26
328	0.25
329	0.18
330	0.24
331	0.24
332	0.24
333	0.23
334	0.22
335	0.2
336	0.2
337	0.21
338	0.21
339	0.23
340	0.22
341	0.21
342	0.21
343	0.19
344	0.2
345	0.18
346	0.16
347	0.15
348	0.15
349	0.16
350	0.18
351	0.2
352	0.2
353	0.21
354	0.19
355	0.22
356	0.22
357	0.27
358	0.27
359	0.27
360	0.28
361	0.27
362	0.26
363	0.25
364	0.25
365	0.19
366	0.15
367	0.15
368	0.15
369	0.2
370	0.21
371	0.21
372	0.25
373	0.25
374	0.29
375	0.37
376	0.44
377	0.42
378	0.4
379	0.38
380	0.38
381	0.43
382	0.41
383	0.33
384	0.24
385	0.2
386	0.19
387	0.18
388	0.15
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.1
398	0.12
399	0.12
400	0.12
401	0.1
402	0.09
403	0.09
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.04
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.07
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.11
437	0.13
438	0.19
439	0.22
440	0.18
441	0.19
442	0.2
443	0.21
444	0.23
445	0.23
446	0.19
447	0.16
448	0.19
449	0.19
450	0.18
451	0.17
452	0.17
453	0.16
454	0.14
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.11
465	0.1
466	0.1
467	0.12
468	0.15
469	0.15
470	0.16
471	0.17
472	0.18
473	0.19
474	0.2
475	0.2
476	0.19
477	0.2
478	0.21
479	0.21
480	0.18
481	0.17
482	0.16
483	0.21
484	0.24
485	0.23
486	0.2
487	0.2
488	0.21
489	0.21
490	0.21
491	0.21
492	0.2
493	0.19
494	0.2
495	0.19
496	0.18
497	0.17
498	0.16
499	0.1
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.07
509	0.06
510	0.06
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.06
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.13
530	0.14
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.14
535	0.14
536	0.15
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.13
541	0.14
542	0.18
543	0.2
544	0.18
545	0.18
546	0.17
547	0.16
548	0.15
549	0.15
550	0.13
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.12
555	0.13
556	0.15
557	0.18
558	0.17
559	0.18
560	0.19
561	0.19
562	0.17
563	0.16
564	0.15
565	0.13
566	0.15
567	0.14
568	0.12
569	0.14
570	0.15
571	0.15
572	0.14
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.16
577	0.17
578	0.19
579	0.19
580	0.19
581	0.19
582	0.2
583	0.19
584	0.15
585	0.12
586	0.1
587	0.14
588	0.13
589	0.13
590	0.12
591	0.14
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.1
596	0.15
597	0.14
598	0.13
599	0.14
600	0.15
601	0.17
602	0.2
603	0.2
604	0.15
605	0.17
606	0.18
607	0.17
608	0.25
609	0.27
610	0.3
611	0.32
612	0.33
613	0.31
614	0.3
615	0.29
616	0.23
617	0.23
618	0.22
619	0.3
620	0.34
621	0.42
622	0.45
623	0.48
624	0.47
625	0.47
626	0.42
627	0.31
628	0.26
629	0.18
630	0.16
631	0.14
632	0.12
633	0.08
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.05
639	0.07
640	0.08
641	0.09
642	0.12
643	0.13
644	0.13
645	0.13
646	0.14
647	0.12
648	0.12
649	0.11
650	0.11
651	0.14
652	0.16
653	0.17
654	0.19
655	0.18
656	0.19
657	0.21
658	0.24
659	0.22
660	0.26
661	0.26
662	0.25
663	0.26
664	0.25
665	0.23
666	0.22
667	0.23
668	0.23
669	0.23
670	0.26
671	0.26
672	0.33
673	0.38
674	0.35
675	0.35
676	0.35
677	0.34
678	0.31
679	0.32
680	0.26
681	0.23
682	0.24
683	0.22
684	0.17
685	0.16
686	0.15
687	0.13
688	0.12
689	0.12
690	0.11
691	0.1
692	0.12
693	0.13
694	0.13
695	0.17
696	0.2
697	0.26
698	0.29
699	0.3
700	0.31
701	0.31
702	0.32
703	0.3
704	0.28
705	0.22
706	0.18
707	0.2
708	0.18
709	0.18
710	0.2
711	0.19
712	0.19
713	0.19
714	0.18
715	0.14
716	0.14
717	0.14
718	0.13
719	0.15
720	0.14
721	0.17
722	0.22
723	0.23
724	0.23
725	0.23
726	0.23
727	0.26
728	0.3
729	0.28
730	0.25
731	0.29
732	0.29
733	0.3
734	0.28
735	0.27
736	0.24
737	0.23
738	0.21
739	0.16
740	0.15
741	0.17
742	0.18
743	0.15
744	0.15
745	0.15
746	0.15
747	0.19
748	0.19
749	0.17
750	0.18
751	0.2
752	0.24
753	0.26
754	0.28
755	0.3
756	0.34
757	0.35
758	0.37
759	0.37
760	0.33
761	0.33
762	0.31
763	0.26
764	0.25
765	0.24
766	0.23
767	0.25
768	0.24
769	0.23
770	0.24
771	0.24
772	0.25
773	0.24
774	0.22
775	0.18
776	0.21
777	0.2
778	0.19
779	0.2
780	0.18
781	0.19
782	0.18
783	0.19
784	0.17
785	0.2
786	0.28
787	0.36
788	0.46
789	0.54
790	0.57
791	0.64
792	0.7
793	0.72
794	0.75
795	0.75
796	0.74
797	0.74
798	0.78
799	0.73
800	0.7
801	0.65
802	0.59
803	0.52
804	0.44
805	0.36
806	0.28
807	0.26
808	0.22
809	0.2
810	0.18
811	0.17
812	0.16
813	0.14
814	0.13
815	0.12
816	0.16
817	0.22
818	0.23
819	0.24
820	0.3
821	0.33
822	0.34
823	0.34
824	0.38
825	0.42
826	0.42
827	0.42
828	0.37
829	0.34
830	0.37
831	0.36
832	0.31
833	0.25
834	0.22
835	0.2
836	0.19
837	0.19
838	0.15
839	0.15
840	0.12
841	0.09
842	0.09
843	0.13
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.15
848	0.17
849	0.19
850	0.25
851	0.21
852	0.28
853	0.36
854	0.41
855	0.41
856	0.42
857	0.42
858	0.38
859	0.37
860	0.34
861	0.29
862	0.29
863	0.3
864	0.27
865	0.27
866	0.29
867	0.34
868	0.34
869	0.4
870	0.4
871	0.4
872	0.43
873	0.42
874	0.41
875	0.39
876	0.42
877	0.39
878	0.36
879	0.32
880	0.34
881	0.35
882	0.35
883	0.34
884	0.37
885	0.36
886	0.34
887	0.37
888	0.35
889	0.35
890	0.35
891	0.38
892	0.3
893	0.26
894	0.27
895	0.28
896	0.28

E4UP39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer