Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5R3W1

Protein Details
Accession E5R3W1    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-45PAVSEHPPSKKSKKTQEKPVNTETIKHydrophilic
66-89EKLPVKVDKKPAKELKPRKRAADFBasic
100-128EVVSKPKAEKKETQPKKKAKSEKPAASAEHydrophilic
132-156KSSATAEKKKKTKSKTKEVEKEPEEBasic
214-236PDSKKAMKAIRKKKKENSEPEEPBasic
325-344GANRRFKKTPWNQIEKRRLDHydrophilic
411-432DKKDETLKKKESKSKAEAKDKTBasic
449-507AETGKKSAEKKEAKKPKKKVVNDTPATSEKPTKVEKQPKSAPKAKKVEEKPKKVKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-13KATKRKAP
25-37HPPSKKSKKTQEK
45-85KVKASSSKSKKENSTVNGAKSEKLPVKVDKKPAKELKPRKR
104-148KPKAEKKETQPKKKAKSEKPAASAELKEKSSATAEKKKKTKSKTK
216-228SKKAMKAIRKKKK
326-371ANRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSRDGWSKAISKESSKRAKKAEKMK
417-507LKKKESKSKAEAKDKTVTNGKASKEKKTEAEPAETGKKSAEKKEAKKPKKKVVNDTPATSEKPTKVEKQPKSAPKAKKVEEKPKKVKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.166, cyto 7, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPEKKATKRKAPATATAAPAVSEHPPSKKSKKTQEKPVNTETIKVKASSSKSKKENSTVNGAKSEKLPVKVDKKPAKELKPRKRAADFLSDDEEEAEKEVVSKPKAEKKETQPKKKAKSEKPAASAELKEKSSATAEKKKKTKSKTKEVEKEPEEVSEPVDEEQVSPISDADSDDEVEDDQTLALIRGFESSGDEDASEDEGFEPGQEVPKIPDSKKAMKAIRKKKKENSEPEEPGTVYVGRIPHGFYEDEMRAYFSQFGEISRLRLSRNRTTGKSKHYAFIEFTSTSVAKVVAATMQNYLMFGHILKCKYIPNDKVHPAMWKGANRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSRDGWSKAISKESSKRAKKAEKMKALGYEYEIPTLKSVEEVPVAPTVQDQIEEGTTAPIAAIEDKKDETLKKKESKSKAEAKDKTVTNGKASKEKKTEAEPAETGKKSAEKKEAKKPKKKVVNDTPATSEKPTKVEKQPKSAPKAKKVEEKPKKVKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.74
3 0.67
4 0.59
5 0.5
6 0.4
7 0.35
8 0.28
9 0.23
10 0.22
11 0.23
12 0.25
13 0.3
14 0.39
15 0.47
16 0.55
17 0.62
18 0.68
19 0.76
20 0.8
21 0.87
22 0.89
23 0.91
24 0.89
25 0.87
26 0.85
27 0.74
28 0.71
29 0.64
30 0.59
31 0.5
32 0.43
33 0.37
34 0.35
35 0.41
36 0.45
37 0.5
38 0.54
39 0.59
40 0.66
41 0.71
42 0.72
43 0.74
44 0.67
45 0.7
46 0.66
47 0.62
48 0.61
49 0.55
50 0.49
51 0.42
52 0.45
53 0.4
54 0.38
55 0.39
56 0.41
57 0.48
58 0.54
59 0.63
60 0.63
61 0.64
62 0.7
63 0.74
64 0.76
65 0.78
66 0.82
67 0.83
68 0.85
69 0.85
70 0.83
71 0.79
72 0.75
73 0.69
74 0.69
75 0.61
76 0.55
77 0.54
78 0.46
79 0.4
80 0.35
81 0.3
82 0.2
83 0.18
84 0.14
85 0.08
86 0.09
87 0.14
88 0.18
89 0.19
90 0.24
91 0.29
92 0.37
93 0.45
94 0.49
95 0.54
96 0.59
97 0.69
98 0.74
99 0.79
100 0.81
101 0.84
102 0.88
103 0.89
104 0.89
105 0.88
106 0.88
107 0.87
108 0.85
109 0.81
110 0.75
111 0.68
112 0.61
113 0.54
114 0.48
115 0.43
116 0.35
117 0.3
118 0.27
119 0.25
120 0.24
121 0.27
122 0.3
123 0.35
124 0.42
125 0.5
126 0.58
127 0.66
128 0.71
129 0.75
130 0.78
131 0.78
132 0.81
133 0.83
134 0.87
135 0.87
136 0.86
137 0.86
138 0.77
139 0.71
140 0.61
141 0.51
142 0.43
143 0.33
144 0.27
145 0.17
146 0.16
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.16
199 0.2
200 0.19
201 0.26
202 0.3
203 0.37
204 0.42
205 0.48
206 0.48
207 0.53
208 0.62
209 0.66
210 0.71
211 0.73
212 0.76
213 0.77
214 0.82
215 0.84
216 0.84
217 0.8
218 0.79
219 0.73
220 0.66
221 0.59
222 0.49
223 0.39
224 0.29
225 0.22
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.08
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.19
255 0.25
256 0.28
257 0.36
258 0.39
259 0.41
260 0.48
261 0.53
262 0.56
263 0.57
264 0.52
265 0.48
266 0.44
267 0.43
268 0.36
269 0.32
270 0.29
271 0.21
272 0.2
273 0.18
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.11
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.09
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.16
298 0.21
299 0.28
300 0.31
301 0.34
302 0.41
303 0.44
304 0.46
305 0.44
306 0.43
307 0.37
308 0.36
309 0.35
310 0.33
311 0.37
312 0.42
313 0.5
314 0.5
315 0.56
316 0.55
317 0.56
318 0.61
319 0.64
320 0.67
321 0.67
322 0.74
323 0.74
324 0.8
325 0.85
326 0.77
327 0.71
328 0.67
329 0.58
330 0.52
331 0.53
332 0.48
333 0.47
334 0.46
335 0.46
336 0.45
337 0.46
338 0.43
339 0.39
340 0.39
341 0.32
342 0.36
343 0.34
344 0.34
345 0.4
346 0.47
347 0.54
348 0.53
349 0.58
350 0.61
351 0.68
352 0.7
353 0.74
354 0.75
355 0.74
356 0.71
357 0.69
358 0.66
359 0.59
360 0.52
361 0.45
362 0.4
363 0.32
364 0.32
365 0.29
366 0.23
367 0.21
368 0.21
369 0.17
370 0.12
371 0.12
372 0.1
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.05
393 0.06
394 0.08
395 0.1
396 0.1
397 0.13
398 0.14
399 0.16
400 0.19
401 0.23
402 0.28
403 0.36
404 0.44
405 0.51
406 0.59
407 0.67
408 0.73
409 0.78
410 0.79
411 0.8
412 0.81
413 0.83
414 0.8
415 0.76
416 0.75
417 0.67
418 0.64
419 0.62
420 0.55
421 0.51
422 0.51
423 0.48
424 0.5
425 0.51
426 0.54
427 0.53
428 0.55
429 0.53
430 0.54
431 0.6
432 0.54
433 0.58
434 0.5
435 0.49
436 0.53
437 0.49
438 0.43
439 0.37
440 0.39
441 0.38
442 0.43
443 0.47
444 0.49
445 0.57
446 0.67
447 0.75
448 0.8
449 0.85
450 0.88
451 0.88
452 0.89
453 0.9
454 0.9
455 0.9
456 0.9
457 0.86
458 0.8
459 0.76
460 0.7
461 0.64
462 0.57
463 0.52
464 0.44
465 0.44
466 0.46
467 0.47
468 0.54
469 0.61
470 0.65
471 0.68
472 0.75
473 0.79
474 0.82
475 0.83
476 0.82
477 0.82
478 0.85
479 0.83
480 0.83
481 0.84
482 0.86
483 0.88
484 0.89
485 0.9
486 0.9
487 0.93