FuNGI

A0A166TNE6

Protein Details

Accession

A0A166TNE6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-38	ESTTPISTKQKSKSSRKSLDKEKDKDGD	Hydrophilic
75-102	ETVSWKVYHPGKVRKRPNKESIPSRAYI	Hydrophilic
296-319	APTASPKKPPKAPRPPRPPPAQQL	Hydrophilic
405-435	REKEIQARKDRDRERERKRREKEKEDAAKSG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
241-249	DKKAGKAAK
263-314	TAKKGRKAKAAAAAANANAAQAKAGPSGGAGTPAPTASPKKPPKAPRPPRPP
375-379	RRAKE
409-432	IQARKDRDRERERKRREKEKEDAA
490-505	RGGGRRGRGRGGRGFR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MTSVPARQSFESTTPISTKQKSKSSRKSLDKEKDKDGDLVKEEKADRFKTVVRRLPPTLPEEVFWQSVQPWVTEETVSWKVYHPGKVRKRPNKESIPSRAYIAFRSEEQLATFSQAYDGHLFRDKAGNESIAVVEYAPYQKTPSDKKKADARCNTIDKDEDYISFLKSLESKGSTNNDEPSTLESLIAASQPPPQPKTTPLLEALKAQKEKELAIRVQFQQRKDRDHAAALKDAQAKKDLDKKAGKAAKAATQAAASGVSAETAKKGRKAKAAAAAANANAAQAKAGPSGGAGTPAPTASPKKPPKAPRPPRPPPAQQLQTPATLNPQASGEVQPGTTVAGVEPAQPRRARPVIATASRGFEAALSGAGVAVGKRRAKEKADREAAATGAGPSEPSATPAADVAREKEIQARKDRDRERERKRREKEKEDAAKSGGAGGSATPAPTILARDTPPKILARPPATDTHPQAGVLNVNTNAPEAAEGGTTSARGGGRRGRGRGGRGFRGGVPQGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.37
3	0.4
4	0.43
5	0.48
6	0.51
7	0.59
8	0.65
9	0.73
10	0.78
11	0.82
12	0.86
13	0.88
14	0.89
15	0.91
16	0.92
17	0.91
18	0.86
19	0.84
20	0.79
21	0.71
22	0.68
23	0.61
24	0.57
25	0.51
26	0.49
27	0.41
28	0.41
29	0.41
30	0.4
31	0.43
32	0.39
33	0.37
34	0.37
35	0.42
36	0.46
37	0.54
38	0.56
39	0.55
40	0.59
41	0.61
42	0.64
43	0.62
44	0.57
45	0.54
46	0.47
47	0.41
48	0.39
49	0.37
50	0.33
51	0.27
52	0.24
53	0.18
54	0.21
55	0.21
56	0.17
57	0.15
58	0.16
59	0.17
60	0.16
61	0.16
62	0.18
63	0.22
64	0.23
65	0.22
66	0.21
67	0.26
68	0.31
69	0.39
70	0.41
71	0.47
72	0.57
73	0.67
74	0.76
75	0.8
76	0.86
77	0.87
78	0.89
79	0.89
80	0.87
81	0.86
82	0.85
83	0.8
84	0.71
85	0.64
86	0.58
87	0.49
88	0.42
89	0.36
90	0.28
91	0.23
92	0.25
93	0.24
94	0.2
95	0.19
96	0.18
97	0.15
98	0.16
99	0.15
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.14
104	0.16
105	0.16
106	0.15
107	0.2
108	0.21
109	0.2
110	0.26
111	0.24
112	0.24
113	0.25
114	0.23
115	0.18
116	0.19
117	0.18
118	0.12
119	0.12
120	0.09
121	0.07
122	0.08
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.1
127	0.12
128	0.18
129	0.28
130	0.36
131	0.44
132	0.47
133	0.53
134	0.61
135	0.69
136	0.73
137	0.72
138	0.69
139	0.68
140	0.7
141	0.66
142	0.59
143	0.52
144	0.42
145	0.37
146	0.31
147	0.23
148	0.2
149	0.19
150	0.17
151	0.15
152	0.14
153	0.12
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.14
158	0.14
159	0.18
160	0.22
161	0.25
162	0.26
163	0.28
164	0.26
165	0.24
166	0.24
167	0.23
168	0.21
169	0.18
170	0.15
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.08
176	0.06
177	0.11
178	0.15
179	0.18
180	0.2
181	0.21
182	0.23
183	0.25
184	0.29
185	0.26
186	0.25
187	0.26
188	0.28
189	0.26
190	0.3
191	0.31
192	0.32
193	0.32
194	0.29
195	0.27
196	0.25
197	0.25
198	0.25
199	0.26
200	0.21
201	0.23
202	0.27
203	0.28
204	0.36
205	0.38
206	0.37
207	0.41
208	0.43
209	0.46
210	0.46
211	0.48
212	0.41
213	0.43
214	0.45
215	0.38
216	0.37
217	0.32
218	0.32
219	0.33
220	0.32
221	0.27
222	0.26
223	0.24
224	0.25
225	0.33
226	0.3
227	0.31
228	0.34
229	0.35
230	0.4
231	0.43
232	0.4
233	0.34
234	0.34
235	0.32
236	0.32
237	0.31
238	0.22
239	0.18
240	0.18
241	0.15
242	0.13
243	0.08
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.09
251	0.1
252	0.15
253	0.21
254	0.24
255	0.3
256	0.33
257	0.36
258	0.41
259	0.44
260	0.39
261	0.36
262	0.33
263	0.27
264	0.24
265	0.19
266	0.11
267	0.08
268	0.06
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.12
286	0.13
287	0.24
288	0.29
289	0.35
290	0.43
291	0.52
292	0.61
293	0.69
294	0.77
295	0.78
296	0.82
297	0.85
298	0.86
299	0.85
300	0.8
301	0.75
302	0.74
303	0.68
304	0.6
305	0.57
306	0.51
307	0.46
308	0.4
309	0.34
310	0.27
311	0.25
312	0.22
313	0.16
314	0.15
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.12
319	0.1
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.1
330	0.15
331	0.17
332	0.22
333	0.23
334	0.24
335	0.29
336	0.31
337	0.29
338	0.26
339	0.32
340	0.35
341	0.37
342	0.4
343	0.34
344	0.34
345	0.32
346	0.31
347	0.22
348	0.14
349	0.12
350	0.08
351	0.07
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.06
359	0.12
360	0.14
361	0.15
362	0.19
363	0.25
364	0.31
365	0.41
366	0.47
367	0.52
368	0.57
369	0.57
370	0.56
371	0.52
372	0.46
373	0.36
374	0.28
375	0.17
376	0.11
377	0.09
378	0.07
379	0.06
380	0.09
381	0.08
382	0.1
383	0.11
384	0.1
385	0.11
386	0.12
387	0.13
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.17
392	0.18
393	0.18
394	0.24
395	0.3
396	0.33
397	0.42
398	0.48
399	0.51
400	0.61
401	0.68
402	0.71
403	0.75
404	0.8
405	0.81
406	0.84
407	0.87
408	0.88
409	0.91
410	0.91
411	0.91
412	0.9
413	0.88
414	0.88
415	0.88
416	0.82
417	0.76
418	0.67
419	0.57
420	0.48
421	0.41
422	0.3
423	0.2
424	0.15
425	0.11
426	0.12
427	0.11
428	0.11
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.11
434	0.1
435	0.14
436	0.16
437	0.23
438	0.25
439	0.27
440	0.3
441	0.31
442	0.32
443	0.35
444	0.42
445	0.41
446	0.43
447	0.43
448	0.45
449	0.47
450	0.52
451	0.5
452	0.46
453	0.42
454	0.38
455	0.35
456	0.32
457	0.3
458	0.24
459	0.23
460	0.19
461	0.19
462	0.19
463	0.19
464	0.16
465	0.13
466	0.12
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.12
476	0.12
477	0.13
478	0.18
479	0.24
480	0.33
481	0.41
482	0.45
483	0.51
484	0.56
485	0.62
486	0.67
487	0.68
488	0.66
489	0.63
490	0.62
491	0.55
492	0.57

A0A166TNE6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer