Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4V2B8

Protein Details
Accession E4V2B8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-27SSNDKQAKPTGRHRQEKEEMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037202  ESCRT_assembly_dom  
IPR007143  Vps28  
IPR017899  VPS28_C  
IPR037206  VPS28_C_sf  
IPR017898  VPS28_N  
IPR038358  VPS28_N_sf  
Gene Ontology GO:0000813  C:ESCRT I complex  
GO:0032509  P:endosome transport via multivesicular body sorting pathway  
GO:0072666  P:establishment of protein localization to vacuole  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0043162  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF03997  VPS28  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51310  VPS28_C  
PS51313  VPS28_N  
Amino Acid Sequences MHGRCDASSNDKQAKPTGRHRQEKEEMYSQRPLSYAPTPYSYTPNTALSATISLDEQQEVKPFSSPAERDLYESLAETYSIIITLDGLEKAYIKDAVTESEYTETCARLLKQYRSILSDDTVAAEFVDLDTFKRAWEMECPRATERLRIGLPATVEQPSHAISQNTTAGPLASGSLILTATENFITFLDALKLNVEIPSEQDFENRGKIIQWLITLNQMRATEELSEEQARELAFEIEQAYQGFKATLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.58
3 0.62
4 0.65
5 0.67
6 0.75
7 0.78
8 0.8
9 0.8
10 0.8
11 0.76
12 0.74
13 0.69
14 0.63
15 0.65
16 0.56
17 0.48
18 0.41
19 0.35
20 0.3
21 0.3
22 0.3
23 0.26
24 0.29
25 0.3
26 0.31
27 0.36
28 0.32
29 0.31
30 0.3
31 0.29
32 0.26
33 0.24
34 0.22
35 0.18
36 0.17
37 0.14
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.16
51 0.21
52 0.21
53 0.21
54 0.25
55 0.24
56 0.25
57 0.26
58 0.26
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.11
63 0.11
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.16
96 0.21
97 0.23
98 0.29
99 0.32
100 0.33
101 0.33
102 0.34
103 0.29
104 0.24
105 0.22
106 0.14
107 0.12
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.15
124 0.2
125 0.25
126 0.27
127 0.3
128 0.3
129 0.36
130 0.36
131 0.33
132 0.28
133 0.27
134 0.25
135 0.23
136 0.23
137 0.19
138 0.19
139 0.16
140 0.16
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.14
151 0.17
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.1
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.22
192 0.2
193 0.16
194 0.15
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.16
200 0.17
201 0.24
202 0.26
203 0.25
204 0.27
205 0.25
206 0.25
207 0.23
208 0.24
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.12