Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4V6L1

Protein Details
Accession E4V6L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-175KDGTSGPKRRGKRGKYKKRQPPADQASTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-170GPKRRGKRGKYKKRQPPAD
177-180GKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSEPRVRMTRHQGQLSFGPEIRQFLYAYGDTTPHSSYPQESNPETVRVLDEIVTDFVIETCHEAAQVANYSNRQKVKSDDFRFILRRDPIKLGRVQELFRLERELKEARKAFDQNDDRLGGGLKESSKAELADLAGEAGAQDNGFAKDGTSGPKRRGKRGKYKKRQPPADQASTGTGKKRKVASFDGFFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.55
3 0.49
4 0.4
5 0.35
6 0.29
7 0.31
8 0.28
9 0.24
10 0.2
11 0.17
12 0.21
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.17
24 0.21
25 0.26
26 0.29
27 0.28
28 0.32
29 0.33
30 0.34
31 0.31
32 0.26
33 0.22
34 0.17
35 0.17
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.13
57 0.16
58 0.2
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.27
63 0.34
64 0.42
65 0.43
66 0.45
67 0.43
68 0.46
69 0.48
70 0.44
71 0.4
72 0.34
73 0.33
74 0.3
75 0.33
76 0.31
77 0.32
78 0.34
79 0.3
80 0.31
81 0.31
82 0.28
83 0.27
84 0.28
85 0.25
86 0.22
87 0.25
88 0.2
89 0.18
90 0.22
91 0.23
92 0.2
93 0.27
94 0.29
95 0.26
96 0.31
97 0.33
98 0.3
99 0.35
100 0.38
101 0.32
102 0.33
103 0.32
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.14
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.1
136 0.16
137 0.23
138 0.26
139 0.32
140 0.41
141 0.45
142 0.53
143 0.63
144 0.67
145 0.71
146 0.78
147 0.83
148 0.86
149 0.93
150 0.93
151 0.94
152 0.95
153 0.91
154 0.91
155 0.89
156 0.86
157 0.77
158 0.68
159 0.63
160 0.57
161 0.51
162 0.48
163 0.44
164 0.39
165 0.43
166 0.48
167 0.48
168 0.49
169 0.55
170 0.56