FuNGI

A0A166FX34

Protein Details

Accession

A0A166FX34

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-36	RRKAQVSLFHPKKKPQQPHSPPKPSTPRPTPT	Hydrophilic
81-101	VSTWQQPVKLNRKDPRRHETG	Hydrophilic
148-169	DGKAGGGKKKFQKKTRQVFIVP	Hydrophilic
392-412	GPPTKETKKMKKLIRNLEKNT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
150-161	KAGGGKKKFQKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MPGARRKAQVSLFHPKKKPQQPHSPPKPSTPRPTPTAVDEDEDDGVKLPQGPFQEFKIISSPQNGWKYNVMKFHSREAVDVSTWQQPVKLNRKDPRRHETGQPTQEAVGPMLGLDGKPVIGADGRMVMVDAQDRPIHNVDPSSQGSKDGKAGGGKKKFQKKTRQVFIVPDAVRQLRREEKYPWVIEDATGNETWAGQMEEVSKSDTHGFFMPTSEDKFQFVSAHRWYKFQKKQNHAQLSAEEVEKLMEQQKKNRDPEFWLMRRRNGQAPSAATTAIFKAEAEGRVLTGGSGSLVHTSGQSLGPGGRRLKAVDKDLFGDDEDEGGRRKKEDDGEGGMDEMLFDEEFADDDEGEAPDEDDEDAKELEERLKKEYKSANKQRDGFVDESEEEEDGPPTKETKKMKKLIRNLEKNTAYESDEDSNPYASSVSDEEEEEEPPVTTNEPAVQPTPSQPPSRSQTPARPSMPSGQGSRATSPAAPGLGGHSIVAMRATSPKPPRPGLNAARGTSPLANGQVSPTNGSRASSPVVDASGQKMSKKRKATEEPSGTAQAPGVSVSAKKRKPTALSDSPPVDAKTVIEWLKNTPGATTKDCIKQFTKFLQDKAKREQFTAMMKQLAVVKDGVLMLRPTT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.75
3	0.79
4	0.8
5	0.83
6	0.82
7	0.83
8	0.85
9	0.9
10	0.93
11	0.92
12	0.86
13	0.85
14	0.86
15	0.84
16	0.83
17	0.81
18	0.77
19	0.71
20	0.73
21	0.66
22	0.61
23	0.59
24	0.5
25	0.43
26	0.38
27	0.35
28	0.31
29	0.28
30	0.22
31	0.16
32	0.15
33	0.13
34	0.15
35	0.13
36	0.16
37	0.19
38	0.23
39	0.24
40	0.27
41	0.34
42	0.3
43	0.32
44	0.34
45	0.33
46	0.31
47	0.34
48	0.35
49	0.35
50	0.43
51	0.43
52	0.41
53	0.46
54	0.49
55	0.49
56	0.53
57	0.48
58	0.49
59	0.49
60	0.54
61	0.53
62	0.49
63	0.45
64	0.42
65	0.4
66	0.32
67	0.32
68	0.27
69	0.26
70	0.26
71	0.25
72	0.23
73	0.26
74	0.35
75	0.43
76	0.49
77	0.52
78	0.6
79	0.71
80	0.78
81	0.82
82	0.8
83	0.78
84	0.74
85	0.74
86	0.76
87	0.76
88	0.74
89	0.67
90	0.6
91	0.52
92	0.51
93	0.42
94	0.32
95	0.22
96	0.14
97	0.11
98	0.1
99	0.1
100	0.07
101	0.06
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.06
108	0.06
109	0.06
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.08
116	0.1
117	0.1
118	0.11
119	0.13
120	0.14
121	0.18
122	0.2
123	0.2
124	0.18
125	0.2
126	0.19
127	0.23
128	0.25
129	0.24
130	0.23
131	0.26
132	0.27
133	0.27
134	0.28
135	0.23
136	0.23
137	0.25
138	0.32
139	0.36
140	0.42
141	0.48
142	0.54
143	0.63
144	0.69
145	0.73
146	0.77
147	0.79
148	0.82
149	0.84
150	0.83
151	0.76
152	0.72
153	0.68
154	0.66
155	0.55
156	0.46
157	0.4
158	0.35
159	0.34
160	0.3
161	0.31
162	0.31
163	0.33
164	0.36
165	0.36
166	0.41
167	0.47
168	0.48
169	0.43
170	0.38
171	0.35
172	0.32
173	0.3
174	0.23
175	0.18
176	0.16
177	0.14
178	0.11
179	0.11
180	0.1
181	0.09
182	0.07
183	0.05
184	0.06
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.15
195	0.16
196	0.14
197	0.15
198	0.16
199	0.14
200	0.17
201	0.18
202	0.17
203	0.17
204	0.17
205	0.18
206	0.18
207	0.18
208	0.22
209	0.25
210	0.33
211	0.32
212	0.36
213	0.39
214	0.47
215	0.54
216	0.56
217	0.59
218	0.59
219	0.69
220	0.75
221	0.79
222	0.7
223	0.63
224	0.55
225	0.49
226	0.43
227	0.34
228	0.23
229	0.15
230	0.13
231	0.11
232	0.12
233	0.13
234	0.17
235	0.19
236	0.26
237	0.35
238	0.43
239	0.49
240	0.5
241	0.46
242	0.46
243	0.53
244	0.56
245	0.52
246	0.54
247	0.52
248	0.54
249	0.56
250	0.54
251	0.52
252	0.45
253	0.41
254	0.36
255	0.35
256	0.33
257	0.29
258	0.25
259	0.19
260	0.17
261	0.15
262	0.11
263	0.09
264	0.05
265	0.06
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.07
274	0.05
275	0.04
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.13
291	0.13
292	0.14
293	0.14
294	0.16
295	0.21
296	0.23
297	0.27
298	0.25
299	0.25
300	0.25
301	0.25
302	0.24
303	0.19
304	0.16
305	0.11
306	0.09
307	0.08
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.1
314	0.13
315	0.16
316	0.19
317	0.21
318	0.23
319	0.24
320	0.23
321	0.22
322	0.19
323	0.15
324	0.11
325	0.08
326	0.05
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.11
352	0.15
353	0.16
354	0.2
355	0.26
356	0.26
357	0.32
358	0.39
359	0.44
360	0.51
361	0.6
362	0.64
363	0.66
364	0.69
365	0.65
366	0.61
367	0.56
368	0.46
369	0.37
370	0.3
371	0.23
372	0.21
373	0.19
374	0.15
375	0.11
376	0.1
377	0.1
378	0.08
379	0.09
380	0.08
381	0.1
382	0.12
383	0.18
384	0.25
385	0.35
386	0.44
387	0.51
388	0.59
389	0.66
390	0.74
391	0.79
392	0.82
393	0.81
394	0.76
395	0.77
396	0.71
397	0.63
398	0.57
399	0.47
400	0.38
401	0.29
402	0.28
403	0.21
404	0.19
405	0.2
406	0.17
407	0.16
408	0.15
409	0.14
410	0.11
411	0.08
412	0.09
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.17
435	0.24
436	0.25
437	0.27
438	0.27
439	0.33
440	0.38
441	0.43
442	0.44
443	0.42
444	0.47
445	0.5
446	0.57
447	0.53
448	0.49
449	0.47
450	0.48
451	0.48
452	0.43
453	0.39
454	0.35
455	0.37
456	0.36
457	0.35
458	0.3
459	0.26
460	0.23
461	0.21
462	0.18
463	0.14
464	0.12
465	0.1
466	0.11
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.06
475	0.05
476	0.11
477	0.12
478	0.2
479	0.27
480	0.34
481	0.4
482	0.44
483	0.48
484	0.49
485	0.58
486	0.57
487	0.6
488	0.59
489	0.54
490	0.52
491	0.48
492	0.44
493	0.35
494	0.29
495	0.21
496	0.17
497	0.17
498	0.15
499	0.17
500	0.18
501	0.18
502	0.21
503	0.19
504	0.21
505	0.21
506	0.21
507	0.2
508	0.18
509	0.2
510	0.17
511	0.17
512	0.15
513	0.15
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.21
518	0.21
519	0.24
520	0.31
521	0.39
522	0.46
523	0.54
524	0.57
525	0.61
526	0.7
527	0.74
528	0.78
529	0.76
530	0.72
531	0.68
532	0.65
533	0.55
534	0.45
535	0.37
536	0.27
537	0.19
538	0.15
539	0.11
540	0.09
541	0.12
542	0.2
543	0.29
544	0.33
545	0.37
546	0.43
547	0.5
548	0.55
549	0.6
550	0.61
551	0.62
552	0.63
553	0.66
554	0.62
555	0.57
556	0.53
557	0.46
558	0.37
559	0.27
560	0.23
561	0.18
562	0.22
563	0.22
564	0.22
565	0.22
566	0.25
567	0.31
568	0.32
569	0.3
570	0.26
571	0.3
572	0.33
573	0.35
574	0.35
575	0.35
576	0.41
577	0.44
578	0.47
579	0.44
580	0.45
581	0.48
582	0.52
583	0.56
584	0.53
585	0.57
586	0.63
587	0.68
588	0.69
589	0.73
590	0.75
591	0.66
592	0.63
593	0.62
594	0.58
595	0.58
596	0.59
597	0.53
598	0.46
599	0.43
600	0.44
601	0.43
602	0.38
603	0.31
604	0.23
605	0.18
606	0.18
607	0.19
608	0.17
609	0.14

A0A166FX34

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer