Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167VVD2

Protein Details
Accession A0A167VVD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-250VDGQPTPGKRPRGRPKGSKNKTKGQADGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-246PGKRPRGRPKGSKNKTKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR018482  Znf-C4H2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF10146  zf-C4H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MYHQQPQYASTSNNNGNNNYGMNQNQNHAGMGTIAPHETTKQPAQANTTPLVATGDWTKDLVHLAKTAELKKHALTLQLHTAHILSAHASLDSKSKAIQDVKEQKNKLESERTRLLNCLREINEDRDKADLHEASLARECTDLRSKITVITDGDYAVAKQDVDRLRQELGQPPLPSLQSTIDEKAAQYLNQRRLDGNAQADEGHGSGQTPQQIQKRSATEAPVDGQPTPGKRPRGRPKGSKNKTKGQADGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.42
4 0.41
5 0.37
6 0.31
7 0.27
8 0.23
9 0.27
10 0.27
11 0.26
12 0.28
13 0.27
14 0.26
15 0.22
16 0.2
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.12
25 0.13
26 0.18
27 0.19
28 0.24
29 0.27
30 0.29
31 0.36
32 0.38
33 0.39
34 0.36
35 0.34
36 0.28
37 0.25
38 0.24
39 0.17
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.17
53 0.21
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.27
58 0.25
59 0.29
60 0.26
61 0.27
62 0.26
63 0.26
64 0.31
65 0.31
66 0.3
67 0.26
68 0.25
69 0.19
70 0.17
71 0.14
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.15
84 0.18
85 0.19
86 0.26
87 0.36
88 0.43
89 0.5
90 0.49
91 0.46
92 0.5
93 0.49
94 0.43
95 0.43
96 0.37
97 0.37
98 0.43
99 0.44
100 0.38
101 0.39
102 0.38
103 0.34
104 0.33
105 0.31
106 0.25
107 0.28
108 0.3
109 0.33
110 0.36
111 0.3
112 0.3
113 0.26
114 0.26
115 0.21
116 0.22
117 0.16
118 0.11
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.17
123 0.16
124 0.12
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.05
146 0.05
147 0.11
148 0.13
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.2
153 0.22
154 0.24
155 0.25
156 0.27
157 0.29
158 0.28
159 0.27
160 0.28
161 0.27
162 0.25
163 0.2
164 0.17
165 0.15
166 0.18
167 0.18
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.22
175 0.28
176 0.35
177 0.38
178 0.4
179 0.36
180 0.39
181 0.42
182 0.39
183 0.36
184 0.28
185 0.25
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.17
190 0.12
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.13
196 0.15
197 0.21
198 0.27
199 0.32
200 0.35
201 0.4
202 0.41
203 0.43
204 0.45
205 0.42
206 0.38
207 0.36
208 0.36
209 0.32
210 0.3
211 0.25
212 0.25
213 0.26
214 0.26
215 0.32
216 0.36
217 0.43
218 0.48
219 0.59
220 0.67
221 0.74
222 0.8
223 0.83
224 0.87
225 0.89
226 0.92
227 0.92
228 0.89
229 0.88
230 0.88
231 0.84