Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0W4E3

Protein Details
Accession G0W4E3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-335VIAKLKKKPVIGKVTNRVTKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-327KKKPVIGK
331-331R
333-335TKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, cyto 10.5, nucl 9, cyto_mito 6.666, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG ndi:NDAI_0A05260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MDAIADPTFQHTKVKSSLSEETPSLLTVIIDITPKLWTELDQETEENGSLISVLKSLIVFLNAHLAFNSSNQVAVIASHSQGIKYLYPQNTKGSDEESSSKTKDLSIINKDMYRRFRNVDETLVEELYTLFEKERDQIDKFKQKSTLSGAMSAGLTYINRLSRELEAISLKSRLMVLTCGGKGESKDEIFQYIPIMNCIFSANKIKCPIDVVKIGGSERSTFLQQTTDATNGVYLHVESSKGLIQYLSTAMFIDPSLRQIIVKPNHGSVDFRTSCYLTGKVVAIGYICSVCLCVLSIIPPGNKCPACDSEFDEHVIAKLKKKPVIGKVTNRVTKKPTKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.38
4 0.45
5 0.43
6 0.46
7 0.41
8 0.38
9 0.34
10 0.31
11 0.25
12 0.18
13 0.13
14 0.09
15 0.1
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.15
26 0.19
27 0.22
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.17
34 0.13
35 0.09
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.19
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.15
72 0.23
73 0.27
74 0.31
75 0.34
76 0.38
77 0.38
78 0.39
79 0.36
80 0.32
81 0.27
82 0.25
83 0.27
84 0.25
85 0.26
86 0.25
87 0.25
88 0.22
89 0.21
90 0.22
91 0.23
92 0.27
93 0.29
94 0.32
95 0.34
96 0.36
97 0.38
98 0.4
99 0.43
100 0.4
101 0.38
102 0.37
103 0.38
104 0.42
105 0.41
106 0.39
107 0.32
108 0.31
109 0.29
110 0.26
111 0.22
112 0.15
113 0.13
114 0.11
115 0.1
116 0.07
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.1
121 0.13
122 0.16
123 0.18
124 0.24
125 0.32
126 0.41
127 0.42
128 0.43
129 0.45
130 0.41
131 0.43
132 0.42
133 0.4
134 0.32
135 0.32
136 0.28
137 0.24
138 0.23
139 0.19
140 0.13
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.13
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.17
189 0.18
190 0.21
191 0.25
192 0.25
193 0.24
194 0.28
195 0.28
196 0.24
197 0.25
198 0.22
199 0.2
200 0.21
201 0.21
202 0.18
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.1
219 0.11
220 0.09
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.23
248 0.25
249 0.32
250 0.32
251 0.33
252 0.35
253 0.36
254 0.35
255 0.29
256 0.34
257 0.29
258 0.28
259 0.29
260 0.27
261 0.28
262 0.29
263 0.27
264 0.17
265 0.19
266 0.18
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.12
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.22
288 0.3
289 0.31
290 0.3
291 0.32
292 0.34
293 0.34
294 0.35
295 0.38
296 0.36
297 0.37
298 0.38
299 0.33
300 0.28
301 0.26
302 0.32
303 0.29
304 0.29
305 0.35
306 0.4
307 0.44
308 0.5
309 0.57
310 0.58
311 0.66
312 0.69
313 0.72
314 0.75
315 0.81
316 0.83
317 0.78
318 0.75
319 0.72