Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166U4K7

Protein Details
Accession A0A166U4K7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-294AYFAPKAKSAPKQKAKKEEKVYIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-124RRGRGRGGGFRGERGERGRGGGRGGARM
276-291KAKSAPKQKAKKEEKV
296-344DARFERPRGGGDRGRGGDRGSRGGGRGRGDNGGGRGRGGGDRGPRGGRG
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFAILEGAEDSTPSPAAPSSAATPAASNTRGRGSQPRGANTRGTRGGGQYYPRGGPGGGAPAQNRTAREGDEAANANSERPRRTYDGEDRRGRGRGGGFRGERGERGRGGGRGGARMDRHSATGKTDSDKKIHQTWGGDDGPAELKAEEAAVVDAAVAATDNTWGVEAAPADDPWATPAAAPGDEAAPAPAAAEGEGRPARRGGDRDAREPEEEDNTVSYDQYLAQKAAEESALPKLAPRSANEGVDESQWKDAVEVTKPEEDAYFAPKAKSAPKQKAKKEEKVYIEIDARFERPRGGGDRGRGGDRGSRGGGRGRGDNGGGRGRGGGDRGPRGGRGPAGVDVADEKAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.16
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.18
19 0.21
20 0.22
21 0.2
22 0.2
23 0.23
24 0.25
25 0.28
26 0.35
27 0.38
28 0.43
29 0.48
30 0.53
31 0.53
32 0.54
33 0.59
34 0.53
35 0.54
36 0.5
37 0.46
38 0.4
39 0.38
40 0.4
41 0.36
42 0.36
43 0.33
44 0.33
45 0.31
46 0.3
47 0.28
48 0.23
49 0.2
50 0.17
51 0.19
52 0.18
53 0.19
54 0.19
55 0.22
56 0.26
57 0.28
58 0.27
59 0.25
60 0.24
61 0.23
62 0.25
63 0.24
64 0.22
65 0.24
66 0.25
67 0.21
68 0.23
69 0.21
70 0.2
71 0.22
72 0.24
73 0.22
74 0.23
75 0.27
76 0.29
77 0.33
78 0.4
79 0.47
80 0.54
81 0.61
82 0.65
83 0.62
84 0.62
85 0.6
86 0.51
87 0.45
88 0.39
89 0.37
90 0.35
91 0.41
92 0.38
93 0.38
94 0.42
95 0.39
96 0.36
97 0.32
98 0.31
99 0.23
100 0.26
101 0.26
102 0.23
103 0.23
104 0.23
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.2
111 0.23
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.24
118 0.24
119 0.24
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.33
124 0.33
125 0.34
126 0.36
127 0.35
128 0.29
129 0.29
130 0.32
131 0.3
132 0.25
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.14
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.09
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.16
196 0.19
197 0.2
198 0.28
199 0.31
200 0.35
201 0.4
202 0.4
203 0.38
204 0.37
205 0.32
206 0.26
207 0.23
208 0.19
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.07
215 0.08
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.16
232 0.17
233 0.18
234 0.23
235 0.25
236 0.26
237 0.26
238 0.27
239 0.24
240 0.24
241 0.24
242 0.18
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.17
251 0.19
252 0.21
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.18
257 0.16
258 0.18
259 0.19
260 0.18
261 0.18
262 0.19
263 0.21
264 0.26
265 0.34
266 0.4
267 0.47
268 0.56
269 0.65
270 0.72
271 0.81
272 0.84
273 0.85
274 0.84
275 0.82
276 0.77
277 0.74
278 0.67
279 0.6
280 0.56
281 0.47
282 0.42
283 0.35
284 0.32
285 0.27
286 0.26
287 0.24
288 0.2
289 0.24
290 0.25
291 0.3
292 0.33
293 0.35
294 0.43
295 0.44
296 0.45
297 0.41
298 0.38
299 0.37
300 0.34
301 0.34
302 0.29
303 0.28
304 0.27
305 0.33
306 0.35
307 0.33
308 0.34
309 0.32
310 0.32
311 0.32
312 0.33
313 0.32
314 0.33
315 0.3
316 0.26
317 0.24
318 0.24
319 0.24
320 0.22
321 0.23
322 0.24
323 0.28
324 0.32
325 0.33
326 0.33
327 0.34
328 0.36
329 0.33
330 0.29
331 0.27
332 0.25
333 0.25
334 0.23
335 0.21
336 0.19
337 0.2
338 0.17
339 0.14
340 0.12