Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

E4V4U4

Protein Details
Accession E4V4U4    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-123DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
130-149EKKVEFAKLLKKQKRGKSDVBasic
421-440ANAKRRQEEDRQRRNNNNDHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-144KLLKKQKR
410-450RRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRG
Subcellular Location(s) cyto 11.5cyto_mito 11.5, mito 10.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSSKYPKIVSAVVEEQPQEIDGQEIPVDITKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEGEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKAEDEKKVEFAKLLKKQKRGKSDVTIAEEVIKKTWDTNVITPGTPFMDILALALRYWVAYKLSTDPGWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRACPEYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFQESKARTCKLCGQAGHVEEACTGKAKEKQGEFDEKQKGSPLKPFIWLHVSILREYLAVEMQVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPQMGGYLTKDGRVDLAKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRGAEPVPDIPPLVVPGKGELTRAERELTHAMVVNRGAVYKANMANKSAAAALKAQLLSGGTAEDDADAKDAQEPEPSAASGSKLGKRKSDVFENSNTEAEAEEEEEEEEAVEVPAKPKEDEMPPDTVRLWEDGYADRYYEQKFGVSPKDIAFRHKVARAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGEMDVQFNKGTPFKPFEQLMGVLPAASNHAIPEVFRDLMSDENSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLAAMDKRYHLLSEAEQARNAMGKDVLLLSEKHPLYESLTANFYSKKQGSSKLKLNMRISEGLGGKVEKNESYLPHSSLSLEVDGADIPALDEDRSISVYYEMPKSMHTHKSMLLRGVKFKEPALDKTDLEITRNKARHSGRSFGGAPLHSNRGGRGRGGGRGGQISYASNDRPNPFAAHLPPGYVPPRHMGGGPPGYNPAPPNTYNGSDRYRSRGGGHPRGGGGGGGGGGYGGGYGDHYQQPPRHNWSQHNAPPYGNAPRNPYQDRAHYQGGGSGGYGRGGGGGGGSYDGRGGGYYNSRGSGRGRGGRSDGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.46
4 0.46
5 0.41
6 0.4
7 0.38
8 0.35
9 0.34
10 0.33
11 0.29
12 0.27
13 0.24
14 0.18
15 0.13
16 0.13
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.13
24 0.11
25 0.16
26 0.21
27 0.24
28 0.27
29 0.28
30 0.28
31 0.31
32 0.32
33 0.34
34 0.3
35 0.3
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.2
40 0.18
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.44
55 0.5
56 0.49
57 0.51
58 0.51
59 0.52
60 0.44
61 0.38
62 0.31
63 0.25
64 0.24
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.13
73 0.13
74 0.17
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.37
99 0.45
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.8
104 0.82
105 0.79
106 0.76
107 0.77
108 0.76
109 0.73
110 0.73
111 0.66
112 0.61
113 0.65
114 0.59
115 0.49
116 0.43
117 0.37
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.22
122 0.26
123 0.35
124 0.41
125 0.51
126 0.55
127 0.62
128 0.71
129 0.77
130 0.82
131 0.79
132 0.78
133 0.76
134 0.77
135 0.75
136 0.73
137 0.65
138 0.55
139 0.53
140 0.48
141 0.4
142 0.32
143 0.25
144 0.19
145 0.18
146 0.21
147 0.22
148 0.23
149 0.26
150 0.31
151 0.32
152 0.32
153 0.31
154 0.3
155 0.25
156 0.21
157 0.17
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.15
174 0.19
175 0.19
176 0.22
177 0.23
178 0.28
179 0.32
180 0.3
181 0.27
182 0.27
183 0.32
184 0.29
185 0.29
186 0.24
187 0.21
188 0.24
189 0.24
190 0.21
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.25
205 0.26
206 0.26
207 0.31
208 0.33
209 0.33
210 0.32
211 0.38
212 0.35
213 0.43
214 0.45
215 0.43
216 0.46
217 0.45
218 0.42
219 0.34
220 0.28
221 0.2
222 0.2
223 0.17
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.25
247 0.28
248 0.27
249 0.24
250 0.28
251 0.24
252 0.26
253 0.28
254 0.28
255 0.25
256 0.28
257 0.36
258 0.35
259 0.4
260 0.37
261 0.39
262 0.43
263 0.43
264 0.43
265 0.35
266 0.28
267 0.23
268 0.23
269 0.18
270 0.14
271 0.13
272 0.14
273 0.19
274 0.24
275 0.29
276 0.31
277 0.36
278 0.39
279 0.49
280 0.46
281 0.5
282 0.53
283 0.47
284 0.45
285 0.46
286 0.44
287 0.36
288 0.41
289 0.38
290 0.32
291 0.38
292 0.38
293 0.35
294 0.37
295 0.35
296 0.31
297 0.29
298 0.28
299 0.21
300 0.21
301 0.18
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.08
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.17
317 0.17
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.1
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.12
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.15
382 0.15
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.13
393 0.14
394 0.2
395 0.26
396 0.29
397 0.37
398 0.4
399 0.44
400 0.5
401 0.59
402 0.62
403 0.67
404 0.72
405 0.71
406 0.76
407 0.78
408 0.78
409 0.74
410 0.7
411 0.64
412 0.59
413 0.58
414 0.6
415 0.65
416 0.66
417 0.7
418 0.72
419 0.75
420 0.79
421 0.8
422 0.78
423 0.76
424 0.76
425 0.74
426 0.74
427 0.77
428 0.78
429 0.79
430 0.79
431 0.78
432 0.77
433 0.77
434 0.74
435 0.73
436 0.75
437 0.72
438 0.66
439 0.59
440 0.51
441 0.44
442 0.37
443 0.28
444 0.17
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.14
456 0.15
457 0.16
458 0.16
459 0.14
460 0.16
461 0.17
462 0.16
463 0.13
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.11
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.06
473 0.08
474 0.1
475 0.13
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.19
480 0.18
481 0.18
482 0.15
483 0.12
484 0.08
485 0.09
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.1
516 0.12
517 0.16
518 0.21
519 0.23
520 0.25
521 0.28
522 0.33
523 0.33
524 0.39
525 0.39
526 0.37
527 0.4
528 0.42
529 0.4
530 0.35
531 0.31
532 0.23
533 0.18
534 0.15
535 0.11
536 0.07
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.03
546 0.04
547 0.04
548 0.06
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.12
554 0.14
555 0.18
556 0.2
557 0.24
558 0.24
559 0.25
560 0.24
561 0.22
562 0.2
563 0.16
564 0.14
565 0.09
566 0.1
567 0.11
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.12
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.13
576 0.11
577 0.12
578 0.15
579 0.18
580 0.17
581 0.18
582 0.18
583 0.24
584 0.24
585 0.27
586 0.28
587 0.28
588 0.3
589 0.32
590 0.32
591 0.27
592 0.29
593 0.26
594 0.25
595 0.22
596 0.18
597 0.15
598 0.13
599 0.12
600 0.09
601 0.07
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.09
611 0.13
612 0.17
613 0.15
614 0.19
615 0.2
616 0.25
617 0.28
618 0.3
619 0.27
620 0.24
621 0.24
622 0.2
623 0.2
624 0.15
625 0.12
626 0.09
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.06
639 0.07
640 0.09
641 0.1
642 0.13
643 0.17
644 0.19
645 0.24
646 0.24
647 0.24
648 0.24
649 0.24
650 0.21
651 0.18
652 0.16
653 0.11
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.08
658 0.07
659 0.05
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.09
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.11
668 0.11
669 0.13
670 0.15
671 0.13
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.09
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.07
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.09
685 0.08
686 0.1
687 0.13
688 0.13
689 0.13
690 0.16
691 0.15
692 0.17
693 0.18
694 0.16
695 0.15
696 0.14
697 0.14
698 0.15
699 0.17
700 0.15
701 0.14
702 0.13
703 0.12
704 0.12
705 0.12
706 0.08
707 0.07
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.12
712 0.18
713 0.24
714 0.28
715 0.29
716 0.28
717 0.28
718 0.28
719 0.26
720 0.22
721 0.16
722 0.2
723 0.25
724 0.25
725 0.25
726 0.25
727 0.24
728 0.24
729 0.23
730 0.16
731 0.1
732 0.09
733 0.09
734 0.09
735 0.1
736 0.09
737 0.1
738 0.1
739 0.18
740 0.18
741 0.17
742 0.18
743 0.18
744 0.2
745 0.25
746 0.25
747 0.19
748 0.21
749 0.21
750 0.22
751 0.23
752 0.2
753 0.22
754 0.22
755 0.25
756 0.26
757 0.35
758 0.43
759 0.49
760 0.56
761 0.58
762 0.62
763 0.66
764 0.66
765 0.61
766 0.56
767 0.51
768 0.43
769 0.4
770 0.35
771 0.28
772 0.25
773 0.22
774 0.18
775 0.18
776 0.19
777 0.13
778 0.15
779 0.17
780 0.17
781 0.22
782 0.24
783 0.24
784 0.24
785 0.24
786 0.22
787 0.21
788 0.2
789 0.15
790 0.12
791 0.1
792 0.09
793 0.09
794 0.08
795 0.07
796 0.05
797 0.04
798 0.05
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.06
803 0.07
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.09
808 0.12
809 0.15
810 0.16
811 0.17
812 0.16
813 0.17
814 0.21
815 0.26
816 0.31
817 0.31
818 0.31
819 0.35
820 0.42
821 0.44
822 0.46
823 0.47
824 0.43
825 0.47
826 0.49
827 0.49
828 0.43
829 0.4
830 0.41
831 0.37
832 0.39
833 0.38
834 0.37
835 0.33
836 0.34
837 0.4
838 0.33
839 0.32
840 0.33
841 0.32
842 0.38
843 0.4
844 0.39
845 0.4
846 0.44
847 0.51
848 0.52
849 0.53
850 0.45
851 0.49
852 0.49
853 0.44
854 0.44
855 0.35
856 0.33
857 0.31
858 0.33
859 0.29
860 0.28
861 0.28
862 0.3
863 0.31
864 0.28
865 0.31
866 0.3
867 0.32
868 0.35
869 0.34
870 0.3
871 0.31
872 0.3
873 0.24
874 0.22
875 0.19
876 0.18
877 0.2
878 0.19
879 0.2
880 0.25
881 0.26
882 0.27
883 0.28
884 0.28
885 0.27
886 0.31
887 0.29
888 0.31
889 0.29
890 0.29
891 0.28
892 0.3
893 0.32
894 0.28
895 0.27
896 0.24
897 0.26
898 0.25
899 0.26
900 0.23
901 0.27
902 0.34
903 0.34
904 0.31
905 0.32
906 0.32
907 0.33
908 0.32
909 0.28
910 0.25
911 0.24
912 0.28
913 0.3
914 0.33
915 0.34
916 0.38
917 0.39
918 0.4
919 0.42
920 0.44
921 0.43
922 0.41
923 0.42
924 0.46
925 0.5
926 0.54
927 0.56
928 0.52
929 0.49
930 0.48
931 0.44
932 0.35
933 0.25
934 0.15
935 0.11
936 0.07
937 0.06
938 0.04
939 0.04
940 0.03
941 0.03
942 0.03
943 0.02
944 0.04
945 0.06
946 0.1
947 0.14
948 0.17
949 0.23
950 0.28
951 0.35
952 0.41
953 0.48
954 0.53
955 0.56
956 0.61
957 0.64
958 0.7
959 0.7
960 0.7
961 0.63
962 0.55
963 0.52
964 0.5
965 0.51
966 0.46
967 0.44
968 0.44
969 0.5
970 0.58
971 0.58
972 0.59
973 0.55
974 0.58
975 0.61
976 0.6
977 0.57
978 0.5
979 0.46
980 0.43
981 0.38
982 0.29
983 0.23
984 0.18
985 0.14
986 0.13
987 0.12
988 0.09
989 0.08
990 0.08
991 0.07
992 0.05
993 0.05
994 0.05
995 0.06
996 0.07
997 0.06
998 0.06
999 0.07
1000 0.07
1001 0.07
1002 0.07
1003 0.1
1004 0.16
1005 0.2
1006 0.21
1007 0.24
1008 0.25
1009 0.27
1010 0.29
1011 0.33
1012 0.36
1013 0.41
1014 0.42
1015 0.44
1016 0.48
1017 0.49
1018 0.51