FuNGI

A0A166TCW2

Protein Details

Accession

A0A166TCW2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-32	TDLSSDKSHRMPKRPSSQSV	Hydrophilic
55-77	SFGNKLKSQTPAKRSKRVVCSEE	Hydrophilic
188-211	ASPPARAGPRPKPRPIKKPSQDIE	Hydrophilic
341-362	EDGRAKNGKKRREEKDRNDDDI	Basic
681-713	EEKAAKKKAKNLERDNDRKKDTRKGKAPAKAKD	Basic
716-737	LAGPSKPGTRRRPPPRDVHSDV	Hydrophilic
750-770	GSEEPTRRRKAQKNGSSSKSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
172-207	SMRPKKQGQDRTSTRSASPPARAGPRPKPRPIKKPS
222-224	PRK
344-353	RAKNGKKRRE
682-730	EKAAKKKAKNLERDNDRKKDTRKGKAPAKAKDLELAGPSKPGTRRRPPP

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MEGILGNLTRKQTDLSSDKSHRMPKRPSSQSVAPNHRQLSQAPGQGQIFEDVGGSFGNKLKSQTPAKRSKRVVCSEEESEDELDMLSSQATDPMDELSQSNAKGKAKQRTRANGGGSWASDGKSFNESYTSNVKSLPKITKIKFTPSTASTTRASSPDSQKASKPARSIASSMRPKKQGQDRTSTRSASPPARAGPRPKPRPIKKPSQDIELIPPGRTNAPPRKKPSLNPQPFPVSPPADSGTDIESPATARPNRKGPAPFPMESMSPLAGKSNREQGGGVQSSSSFPDISPLRSNSKPKDIFPHISPLSSPARGGDPPRRPFPLASPIANSTKRLSEEVEDGRAKNGKKRREEKDRNDDDIWMDPPNIGDISVNDESLFMDPSVDPSTLCPYCDESLPETPTPHLRTLLATARTKSYKDPRPTNPKGLKAPLSTFISVCQRHGFESVKLPEAKKRGWPRVIDFDKVKSRVESMGDRLEAIIVDGNEDGIPMNQDEEDEWAVRGPRGQSTFWRDMMKEVKRKGSRAVVGVAGQFASFEKAQPGYYGELGAVIIHQTLYSLFPPSSFNAALIAPLTPTEFIQRVLVPEAAVGLILEDRHLDWANEKHRVSAMRILSESAAYGVAMFPDADTSGKGKGDDDWVMGAGDEIMRERARVRRKELEKEERLEDELWVARESERALEEKAAKKKAKNLERDNDRKKDTRKGKAPAKAKDLELAGPSKPGTRRRPPPRDVHSDVGSSNLDSDIPISGSEEPTRRRKAQKNGSSSKSSSRAAVDLCSDSSSAEDSQNTTSKVKVKQKGKAVRSIPGLDPDNHCRVDSTRRSRSRSVASTRSAESASLQGSSNRGRHRGAVDISSGEERTPRAGKLKPASATSSKNSYTSITKGLQPLQIARNREDQSSWKRRMSPQTGGIDDDHILSISDSDSDPDLQGYMKPPSSNDRLDRRNATSDDNNNKEWSWLLSQESQQG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.34
3	0.42
4	0.46
5	0.52
6	0.56
7	0.64
8	0.64
9	0.68
10	0.71
11	0.72
12	0.77
13	0.8
14	0.8
15	0.79
16	0.78
17	0.78
18	0.78
19	0.78
20	0.74
21	0.73
22	0.69
23	0.64
24	0.57
25	0.49
26	0.48
27	0.45
28	0.44
29	0.37
30	0.4
31	0.37
32	0.36
33	0.36
34	0.29
35	0.22
36	0.16
37	0.15
38	0.1
39	0.1
40	0.09
41	0.09
42	0.08
43	0.12
44	0.15
45	0.16
46	0.19
47	0.21
48	0.3
49	0.39
50	0.47
51	0.54
52	0.61
53	0.69
54	0.76
55	0.82
56	0.83
57	0.83
58	0.83
59	0.77
60	0.73
61	0.71
62	0.66
63	0.6
64	0.53
65	0.45
66	0.36
67	0.32
68	0.25
69	0.18
70	0.13
71	0.11
72	0.08
73	0.06
74	0.05
75	0.05
76	0.08
77	0.08
78	0.09
79	0.09
80	0.11
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.14
85	0.17
86	0.17
87	0.21
88	0.25
89	0.27
90	0.34
91	0.42
92	0.48
93	0.54
94	0.62
95	0.67
96	0.72
97	0.77
98	0.77
99	0.73
100	0.66
101	0.61
102	0.55
103	0.45
104	0.39
105	0.32
106	0.25
107	0.22
108	0.2
109	0.19
110	0.2
111	0.19
112	0.17
113	0.2
114	0.19
115	0.22
116	0.28
117	0.29
118	0.25
119	0.3
120	0.32
121	0.32
122	0.38
123	0.41
124	0.42
125	0.49
126	0.51
127	0.56
128	0.57
129	0.62
130	0.61
131	0.59
132	0.56
133	0.49
134	0.53
135	0.45
136	0.46
137	0.38
138	0.35
139	0.34
140	0.29
141	0.31
142	0.31
143	0.36
144	0.41
145	0.45
146	0.44
147	0.45
148	0.52
149	0.56
150	0.54
151	0.5
152	0.47
153	0.47
154	0.47
155	0.47
156	0.45
157	0.48
158	0.53
159	0.57
160	0.59
161	0.59
162	0.59
163	0.64
164	0.67
165	0.67
166	0.62
167	0.66
168	0.66
169	0.68
170	0.72
171	0.65
172	0.56
173	0.52
174	0.52
175	0.47
176	0.44
177	0.4
178	0.4
179	0.45
180	0.49
181	0.51
182	0.56
183	0.61
184	0.65
185	0.7
186	0.76
187	0.78
188	0.83
189	0.84
190	0.85
191	0.82
192	0.85
193	0.78
194	0.74
195	0.69
196	0.6
197	0.59
198	0.56
199	0.49
200	0.38
201	0.35
202	0.3
203	0.29
204	0.3
205	0.32
206	0.33
207	0.42
208	0.51
209	0.58
210	0.66
211	0.68
212	0.72
213	0.74
214	0.75
215	0.74
216	0.7
217	0.68
218	0.65
219	0.6
220	0.58
221	0.52
222	0.44
223	0.35
224	0.34
225	0.31
226	0.25
227	0.25
228	0.22
229	0.19
230	0.17
231	0.17
232	0.14
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.17
237	0.18
238	0.22
239	0.26
240	0.34
241	0.36
242	0.42
243	0.46
244	0.42
245	0.48
246	0.5
247	0.46
248	0.41
249	0.41
250	0.35
251	0.31
252	0.3
253	0.21
254	0.15
255	0.14
256	0.15
257	0.16
258	0.17
259	0.18
260	0.26
261	0.26
262	0.26
263	0.26
264	0.25
265	0.31
266	0.3
267	0.27
268	0.19
269	0.18
270	0.18
271	0.19
272	0.17
273	0.09
274	0.08
275	0.13
276	0.14
277	0.17
278	0.22
279	0.24
280	0.28
281	0.33
282	0.4
283	0.39
284	0.48
285	0.48
286	0.45
287	0.51
288	0.52
289	0.51
290	0.46
291	0.51
292	0.41
293	0.39
294	0.37
295	0.32
296	0.29
297	0.25
298	0.23
299	0.15
300	0.17
301	0.19
302	0.23
303	0.28
304	0.34
305	0.38
306	0.43
307	0.45
308	0.44
309	0.43
310	0.44
311	0.44
312	0.39
313	0.35
314	0.34
315	0.34
316	0.38
317	0.38
318	0.34
319	0.26
320	0.26
321	0.26
322	0.24
323	0.22
324	0.18
325	0.23
326	0.23
327	0.27
328	0.25
329	0.24
330	0.25
331	0.28
332	0.27
333	0.29
334	0.34
335	0.36
336	0.45
337	0.53
338	0.61
339	0.68
340	0.78
341	0.81
342	0.85
343	0.84
344	0.8
345	0.72
346	0.63
347	0.53
348	0.45
349	0.36
350	0.25
351	0.18
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.1
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.1
375	0.15
376	0.15
377	0.15
378	0.14
379	0.15
380	0.16
381	0.17
382	0.18
383	0.16
384	0.2
385	0.22
386	0.22
387	0.2
388	0.2
389	0.24
390	0.25
391	0.23
392	0.2
393	0.17
394	0.17
395	0.2
396	0.25
397	0.25
398	0.24
399	0.24
400	0.27
401	0.28
402	0.28
403	0.31
404	0.34
405	0.38
406	0.44
407	0.51
408	0.56
409	0.65
410	0.69
411	0.74
412	0.7
413	0.67
414	0.64
415	0.6
416	0.55
417	0.47
418	0.43
419	0.38
420	0.35
421	0.29
422	0.25
423	0.23
424	0.25
425	0.23
426	0.23
427	0.2
428	0.17
429	0.18
430	0.21
431	0.2
432	0.15
433	0.22
434	0.22
435	0.25
436	0.26
437	0.26
438	0.27
439	0.29
440	0.29
441	0.3
442	0.37
443	0.41
444	0.44
445	0.46
446	0.46
447	0.53
448	0.54
449	0.5
450	0.43
451	0.4
452	0.41
453	0.4
454	0.36
455	0.26
456	0.25
457	0.23
458	0.24
459	0.2
460	0.17
461	0.19
462	0.18
463	0.17
464	0.16
465	0.14
466	0.11
467	0.09
468	0.08
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.03
477	0.04
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.1
491	0.08
492	0.11
493	0.13
494	0.14
495	0.18
496	0.25
497	0.29
498	0.3
499	0.31
500	0.27
501	0.29
502	0.36
503	0.38
504	0.37
505	0.37
506	0.43
507	0.44
508	0.45
509	0.46
510	0.44
511	0.4
512	0.35
513	0.34
514	0.26
515	0.24
516	0.23
517	0.19
518	0.12
519	0.09
520	0.07
521	0.06
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.05
538	0.04
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.05
545	0.05
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.1
550	0.11
551	0.14
552	0.12
553	0.12
554	0.12
555	0.12
556	0.11
557	0.1
558	0.09
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.05
563	0.05
564	0.07
565	0.08
566	0.08
567	0.1
568	0.1
569	0.11
570	0.13
571	0.13
572	0.1
573	0.09
574	0.09
575	0.07
576	0.06
577	0.05
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.06
585	0.07
586	0.07
587	0.1
588	0.16
589	0.2
590	0.27
591	0.27
592	0.26
593	0.28
594	0.3
595	0.29
596	0.3
597	0.27
598	0.23
599	0.23
600	0.23
601	0.21
602	0.19
603	0.16
604	0.1
605	0.08
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.03
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.05
617	0.07
618	0.08
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.1
623	0.14
624	0.14
625	0.13
626	0.12
627	0.12
628	0.11
629	0.11
630	0.09
631	0.06
632	0.05
633	0.04
634	0.05
635	0.06
636	0.06
637	0.07
638	0.1
639	0.17
640	0.26
641	0.32
642	0.39
643	0.47
644	0.53
645	0.63
646	0.71
647	0.74
648	0.71
649	0.69
650	0.65
651	0.56
652	0.52
653	0.43
654	0.33
655	0.25
656	0.21
657	0.18
658	0.15
659	0.14
660	0.12
661	0.12
662	0.13
663	0.12
664	0.11
665	0.12
666	0.12
667	0.16
668	0.21
669	0.27
670	0.34
671	0.4
672	0.43
673	0.44
674	0.51
675	0.57
676	0.6
677	0.63
678	0.65
679	0.67
680	0.74
681	0.82
682	0.83
683	0.8
684	0.77
685	0.75
686	0.7
687	0.71
688	0.7
689	0.7
690	0.7
691	0.72
692	0.75
693	0.76
694	0.8
695	0.77
696	0.75
697	0.68
698	0.6
699	0.54
700	0.46
701	0.4
702	0.33
703	0.28
704	0.21
705	0.19
706	0.19
707	0.2
708	0.24
709	0.31
710	0.38
711	0.45
712	0.56
713	0.65
714	0.75
715	0.77
716	0.82
717	0.81
718	0.81
719	0.78
720	0.73
721	0.64
722	0.56
723	0.49
724	0.42
725	0.34
726	0.25
727	0.19
728	0.13
729	0.1
730	0.08
731	0.09
732	0.07
733	0.07
734	0.07
735	0.08
736	0.09
737	0.11
738	0.14
739	0.19
740	0.23
741	0.32
742	0.39
743	0.44
744	0.53
745	0.6
746	0.68
747	0.74
748	0.78
749	0.8
750	0.81
751	0.81
752	0.77
753	0.71
754	0.67
755	0.61
756	0.53
757	0.45
758	0.38
759	0.35
760	0.29
761	0.29
762	0.24
763	0.2
764	0.2
765	0.18
766	0.16
767	0.13
768	0.13
769	0.14
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.13
774	0.17
775	0.21
776	0.23
777	0.21
778	0.24
779	0.29
780	0.37
781	0.45
782	0.5
783	0.54
784	0.6
785	0.69
786	0.76
787	0.74
788	0.75
789	0.68
790	0.66
791	0.63
792	0.6
793	0.51
794	0.48
795	0.46
796	0.4
797	0.42
798	0.42
799	0.42
800	0.38
801	0.36
802	0.31
803	0.31
804	0.38
805	0.43
806	0.47
807	0.52
808	0.59
809	0.66
810	0.69
811	0.73
812	0.72
813	0.71
814	0.69
815	0.66
816	0.63
817	0.61
818	0.58
819	0.53
820	0.44
821	0.35
822	0.28
823	0.24
824	0.2
825	0.17
826	0.16
827	0.15
828	0.18
829	0.24
830	0.28
831	0.3
832	0.34
833	0.34
834	0.38
835	0.39
836	0.42
837	0.4
838	0.36
839	0.33
840	0.3
841	0.31
842	0.28
843	0.26
844	0.19
845	0.17
846	0.16
847	0.19
848	0.21
849	0.21
850	0.25
851	0.29
852	0.38
853	0.43
854	0.5
855	0.48
856	0.49
857	0.53
858	0.53
859	0.54
860	0.5
861	0.49
862	0.43
863	0.41
864	0.39
865	0.36
866	0.34
867	0.32
868	0.33
869	0.29
870	0.31
871	0.35
872	0.38
873	0.38
874	0.36
875	0.39
876	0.41
877	0.44
878	0.43
879	0.42
880	0.47
881	0.46
882	0.45
883	0.43
884	0.44
885	0.49
886	0.55
887	0.59
888	0.56
889	0.61
890	0.67
891	0.74
892	0.73
893	0.7
894	0.69
895	0.7
896	0.65
897	0.61
898	0.54
899	0.46
900	0.38
901	0.31
902	0.22
903	0.15
904	0.13
905	0.11
906	0.1
907	0.08
908	0.09
909	0.08
910	0.09
911	0.11
912	0.12
913	0.12
914	0.12
915	0.12
916	0.11
917	0.14
918	0.17
919	0.2
920	0.22
921	0.23
922	0.25
923	0.33
924	0.39
925	0.44
926	0.48
927	0.53
928	0.56
929	0.63
930	0.68
931	0.66
932	0.67
933	0.61
934	0.6
935	0.59
936	0.63
937	0.65
938	0.63
939	0.6
940	0.54
941	0.52
942	0.46
943	0.39
944	0.33
945	0.27
946	0.26
947	0.28
948	0.31

A0A166TCW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer