Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166SWN1

Protein Details
Accession A0A166SWN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-271SRYVSRSPSRSRSRSPYRSRSRSISPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-215GRSKSRSQSRSSRGSKRSA
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRNALSIHGVNPQSLVETVIRNRIYESGFWKEHCFALTAESIIDKSIELRCIGGVYGNQRPTEFLCLLLKLLQIQPEKEILVEYLQADEFKYLRAVAAFYVRLTFRAVDVYEILEPLLKDYRKIRYRDMAGYTLTYMDEFVNQLLTEERVCDIILPRMAKRQTLEENGEIGPRKSRLLDALEGTSEHGSERGRSKSRSQSRSSRGSKRSASGSQAGSAGRSQSGRRSLSRSDKTPSEAGSRYVSRSPSRSRSRSPYRSRSRSISPDRMETEADPTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.23
4 0.22
5 0.18
6 0.17
7 0.18
8 0.12
9 0.16
10 0.19
11 0.26
12 0.26
13 0.25
14 0.26
15 0.27
16 0.28
17 0.27
18 0.3
19 0.3
20 0.32
21 0.33
22 0.36
23 0.34
24 0.33
25 0.3
26 0.26
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.07
37 0.08
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.14
48 0.21
49 0.23
50 0.24
51 0.23
52 0.25
53 0.25
54 0.28
55 0.24
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.15
64 0.18
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.16
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.11
99 0.11
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.16
113 0.25
114 0.31
115 0.34
116 0.36
117 0.38
118 0.42
119 0.45
120 0.45
121 0.37
122 0.31
123 0.29
124 0.25
125 0.19
126 0.15
127 0.1
128 0.08
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.29
156 0.32
157 0.27
158 0.28
159 0.27
160 0.28
161 0.24
162 0.19
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.18
170 0.2
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.15
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.11
182 0.15
183 0.21
184 0.26
185 0.29
186 0.36
187 0.45
188 0.54
189 0.59
190 0.61
191 0.64
192 0.66
193 0.74
194 0.75
195 0.74
196 0.7
197 0.7
198 0.67
199 0.61
200 0.6
201 0.53
202 0.5
203 0.45
204 0.41
205 0.35
206 0.33
207 0.3
208 0.24
209 0.21
210 0.18
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.2
215 0.27
216 0.3
217 0.32
218 0.36
219 0.43
220 0.51
221 0.57
222 0.55
223 0.54
224 0.53
225 0.55
226 0.52
227 0.47
228 0.43
229 0.38
230 0.36
231 0.36
232 0.35
233 0.34
234 0.35
235 0.37
236 0.36
237 0.41
238 0.46
239 0.5
240 0.58
241 0.62
242 0.66
243 0.71
244 0.77
245 0.81
246 0.84
247 0.84
248 0.85
249 0.87
250 0.86
251 0.82
252 0.8
253 0.8
254 0.79
255 0.79
256 0.72
257 0.71
258 0.68
259 0.64
260 0.57
261 0.48