FuNGI

A0A165XT41

Protein Details

Accession

A0A165XT41

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
270-296	EDSDAAEKRRRKHKRRKASKADDESSE	Basic
300-404	ARSRSHSRSSSRKAKKRRKDDASETASSDDSGAERKRKRRKKMDADDDSSDGGEREKKKNKKKHKVKRQSPSDSEAESPDDTRSARKKEKSREKVPKRSASPVYN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-290	KRRRKHKRRKASKA
301-318	RSRSHSRSSSRKAKKRRK
333-342	ERKRKRRKKM
352-368	GEREKKKNKKKHKVKRQ
382-397	RSARKKEKSREKVPKR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNPMELRLHQTALADAQKTVTAKEAEALIPDGPARIAAINFLLGTGLLKAMKGPGDRITSYRAVTKKELEVKKDMTGEESMVLSHIQASGTEGIWTKHLKGKTELHQTVIDRCLKSLTQKLLIKPVKSHKHPTRKIYMLFHLQPSVEITGGPWYTDNELDTEFIKLLSGAVLHYVKDRSYPRQKRETELDSTQGQPLFPIGATPPYPSAQQVQGFLDKSKITETELSVEHVEMLLNVLILDGEIEKIPGFGPAAWDTQADTSDSEDSDAAEKRRRKHKRRKASKADDESSESDTARSRSHSRSSSRKAKKRRKDDASETASSDDSGAERKRKRRKKMDADDDSSDGGEREKKKNKKKHKVKRQSPSDSEAESPDDTRSARKKEKSREKVPKRSASPVYNLDLGAMDEDDFGGAYVYRAVRQERVALGWSQAPCGGCPVFEFCKDKGPVNPRECTYYEDWLGLEVVSAELAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.34
3	0.32
4	0.31
5	0.29
6	0.22
7	0.2
8	0.2
9	0.22
10	0.22
11	0.21
12	0.21
13	0.18
14	0.17
15	0.19
16	0.21
17	0.18
18	0.19
19	0.2
20	0.15
21	0.14
22	0.14
23	0.13
24	0.1
25	0.1
26	0.09
27	0.09
28	0.08
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.09
34	0.08
35	0.07
36	0.07
37	0.06
38	0.07
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.1
43	0.14
44	0.14
45	0.17
46	0.21
47	0.26
48	0.27
49	0.29
50	0.33
51	0.32
52	0.32
53	0.37
54	0.34
55	0.34
56	0.37
57	0.4
58	0.42
59	0.49
60	0.53
61	0.51
62	0.54
63	0.53
64	0.53
65	0.52
66	0.44
67	0.37
68	0.32
69	0.28
70	0.22
71	0.19
72	0.14
73	0.12
74	0.11
75	0.08
76	0.08
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.11
84	0.12
85	0.12
86	0.15
87	0.16
88	0.17
89	0.21
90	0.24
91	0.25
92	0.31
93	0.38
94	0.43
95	0.53
96	0.51
97	0.49
98	0.5
99	0.48
100	0.47
101	0.45
102	0.42
103	0.32
104	0.31
105	0.3
106	0.27
107	0.3
108	0.32
109	0.31
110	0.34
111	0.38
112	0.39
113	0.47
114	0.51
115	0.47
116	0.47
117	0.53
118	0.54
119	0.55
120	0.64
121	0.64
122	0.71
123	0.76
124	0.77
125	0.76
126	0.73
127	0.72
128	0.67
129	0.62
130	0.59
131	0.54
132	0.49
133	0.41
134	0.35
135	0.3
136	0.27
137	0.22
138	0.14
139	0.11
140	0.09
141	0.12
142	0.12
143	0.11
144	0.1
145	0.1
146	0.11
147	0.12
148	0.12
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.08
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.16
169	0.19
170	0.25
171	0.36
172	0.45
173	0.5
174	0.59
175	0.61
176	0.61
177	0.65
178	0.61
179	0.55
180	0.48
181	0.45
182	0.36
183	0.36
184	0.33
185	0.26
186	0.21
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.08
191	0.07
192	0.05
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.14
201	0.15
202	0.15
203	0.16
204	0.16
205	0.18
206	0.19
207	0.18
208	0.18
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.12
216	0.13
217	0.13
218	0.14
219	0.13
220	0.13
221	0.11
222	0.09
223	0.08
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.02
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.04
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.11
261	0.12
262	0.19
263	0.23
264	0.29
265	0.4
266	0.51
267	0.6
268	0.69
269	0.78
270	0.82
271	0.89
272	0.94
273	0.94
274	0.94
275	0.94
276	0.91
277	0.83
278	0.74
279	0.67
280	0.58
281	0.49
282	0.39
283	0.29
284	0.21
285	0.2
286	0.19
287	0.16
288	0.17
289	0.19
290	0.22
291	0.29
292	0.35
293	0.39
294	0.48
295	0.56
296	0.63
297	0.69
298	0.74
299	0.78
300	0.83
301	0.87
302	0.88
303	0.9
304	0.88
305	0.87
306	0.87
307	0.86
308	0.82
309	0.73
310	0.63
311	0.54
312	0.44
313	0.35
314	0.26
315	0.16
316	0.1
317	0.13
318	0.16
319	0.23
320	0.29
321	0.38
322	0.49
323	0.59
324	0.69
325	0.75
326	0.83
327	0.86
328	0.9
329	0.92
330	0.91
331	0.87
332	0.79
333	0.7
334	0.59
335	0.48
336	0.37
337	0.26
338	0.18
339	0.18
340	0.2
341	0.27
342	0.37
343	0.47
344	0.57
345	0.68
346	0.77
347	0.83
348	0.89
349	0.91
350	0.93
351	0.95
352	0.95
353	0.95
354	0.95
355	0.93
356	0.87
357	0.82
358	0.75
359	0.65
360	0.56
361	0.47
362	0.4
363	0.3
364	0.26
365	0.21
366	0.19
367	0.17
368	0.23
369	0.28
370	0.34
371	0.42
372	0.5
373	0.59
374	0.68
375	0.79
376	0.82
377	0.85
378	0.88
379	0.9
380	0.92
381	0.93
382	0.91
383	0.85
384	0.84
385	0.81
386	0.75
387	0.7
388	0.64
389	0.58
390	0.5
391	0.44
392	0.36
393	0.28
394	0.23
395	0.17
396	0.12
397	0.09
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.15
410	0.17
411	0.21
412	0.23
413	0.27
414	0.25
415	0.27
416	0.28
417	0.26
418	0.25
419	0.27
420	0.25
421	0.22
422	0.23
423	0.21
424	0.18
425	0.22
426	0.2
427	0.15
428	0.16
429	0.21
430	0.22
431	0.28
432	0.32
433	0.28
434	0.38
435	0.4
436	0.42
437	0.45
438	0.5
439	0.54
440	0.56
441	0.61
442	0.54
443	0.58
444	0.56
445	0.53
446	0.49
447	0.46
448	0.41
449	0.36
450	0.34
451	0.28
452	0.27
453	0.21
454	0.16
455	0.09
456	0.08

A0A165XT41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer