Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4V4D9

Protein Details
Accession E4V4D9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-68ASRALRKKLKYGNVHRQLRAHydrophilic
133-156VTALYRQLPKRKRRTGPENSNILKHydrophilic
189-210NSKSLFDSKKKNKQKLERQSITHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MFSGTKKPYTAITVQIDSLTAEQYEVDDWSGIPDLIEVIRLQASGPSEASRALRKKLKYGNVHRQLRALTILDFLIQNAGERFHRSFADEPLLERLRVIATDPHTDALVKEKCQQLYSQWAVSFKGVAGMERVTALYRQLPKRKRRTGPENSNILKEPADEPLGHSVSIVAGDGPSRNLSSATPSSSSNSKSLFDSKKKNKQKLERQSITDKHTKTKAKASDEDVARIKRTVADVGFAITRLENAMKLVNREQMRVSQDKEVMCRVDECKVLRSELLKFIHKLDDENYLGILIHSHEEIINALLAFEVMDKSVDDDSDSEQELDLVHANAESSPPAKPPRPQMVPSLQFDKDKDLESESEQSDDDDINNPFGDRNAISTPALEKSGMTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.32
4 0.26
5 0.24
6 0.17
7 0.11
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.1
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.17
36 0.19
37 0.26
38 0.28
39 0.34
40 0.4
41 0.41
42 0.5
43 0.56
44 0.63
45 0.65
46 0.71
47 0.75
48 0.78
49 0.84
50 0.76
51 0.71
52 0.63
53 0.54
54 0.47
55 0.37
56 0.27
57 0.2
58 0.19
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.15
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.21
73 0.22
74 0.24
75 0.3
76 0.26
77 0.26
78 0.31
79 0.33
80 0.29
81 0.26
82 0.23
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.14
87 0.15
88 0.2
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.18
94 0.22
95 0.23
96 0.2
97 0.25
98 0.29
99 0.3
100 0.31
101 0.32
102 0.26
103 0.32
104 0.33
105 0.31
106 0.27
107 0.27
108 0.27
109 0.27
110 0.24
111 0.15
112 0.16
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.12
124 0.19
125 0.27
126 0.35
127 0.44
128 0.54
129 0.64
130 0.73
131 0.76
132 0.78
133 0.82
134 0.84
135 0.86
136 0.84
137 0.82
138 0.74
139 0.69
140 0.59
141 0.5
142 0.39
143 0.29
144 0.22
145 0.15
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.16
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.11
156 0.09
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.18
174 0.2
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.17
179 0.23
180 0.28
181 0.32
182 0.4
183 0.47
184 0.57
185 0.65
186 0.72
187 0.73
188 0.77
189 0.81
190 0.82
191 0.84
192 0.78
193 0.74
194 0.74
195 0.7
196 0.65
197 0.61
198 0.51
199 0.45
200 0.48
201 0.48
202 0.43
203 0.46
204 0.47
205 0.46
206 0.48
207 0.48
208 0.48
209 0.44
210 0.46
211 0.42
212 0.36
213 0.31
214 0.28
215 0.24
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.1
233 0.11
234 0.14
235 0.16
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.25
241 0.29
242 0.3
243 0.3
244 0.28
245 0.31
246 0.31
247 0.32
248 0.3
249 0.26
250 0.23
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.22
255 0.22
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.24
260 0.25
261 0.24
262 0.28
263 0.3
264 0.29
265 0.28
266 0.3
267 0.33
268 0.31
269 0.29
270 0.24
271 0.27
272 0.24
273 0.23
274 0.21
275 0.16
276 0.16
277 0.14
278 0.13
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.14
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.14
322 0.21
323 0.26
324 0.31
325 0.4
326 0.48
327 0.54
328 0.56
329 0.59
330 0.63
331 0.64
332 0.64
333 0.6
334 0.53
335 0.5
336 0.49
337 0.47
338 0.39
339 0.35
340 0.32
341 0.3
342 0.29
343 0.3
344 0.34
345 0.28
346 0.28
347 0.25
348 0.24
349 0.22
350 0.2
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.16
359 0.19
360 0.14
361 0.18
362 0.18
363 0.21
364 0.21
365 0.22
366 0.24
367 0.22
368 0.24
369 0.19