FuNGI

A0A369J6V2

Protein Details

Accession

A0A369J6V2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-30	MPSTTTPKAPPTKPKKDRERKEKLPVVGER	Hydrophilic
60-84	ATWKAYYPGKSRKRLGKENIPSRAY	Hydrophilic
272-294	SSNIRPKSPKPPRPPKAPQQKVV	Hydrophilic
360-384	GVSAGERKSRREREREREKEKETQA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-24	APPTKPKKDRERKEKL
214-290	PRKDEPKKKGAPPTQRAPEPTTPAGKKPSKKPIPAPPVPPSAQKPPPLPAAVAKLNVGSSNIRPKSPKPPRPPKAPQ
366-378	RKSRREREREREK
482-505	GGRGGRRGRGRGRGGNPGAPVRGG

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 6, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MPSTTTPKAPPTKPKKDRERKEKLPVVGERLKTVVRRLPPNLPEDVFWGSVEPWVNDETATWKAYYPGKSRKRLGKENIPSRAYIAFRNEEQLSLFSREYDGHLFRDKAGNESQAVVEFAPYQKVPSEKKKVDARNATIEKDEDYISFIESLKVNKPEPVSLETLIAARQPAPAPTTTPLLEALKAEKSASKDKEAILRNHAHYKDATILAPTPRKDEPKKKGAPPTQRAPEPTTPAGKKPSKKPIPAPPVPPSAQKPPPLPAAVAKLNVGSSNIRPKSPKPPRPPKAPQQKVVQGGAKPAAPGPSVTAIQGAATAESPIAPPPLSGSAPSVPAAGLARRTRPVIGLASRQFEAALSGAGVSAGERKSRREREREREKEKETQAADGAAGSGPVGTGTSVPPKTSPPSPRRERHAKQIREVAAPGAAAAVNVGSSGGPVNAGPAVKVPAILQRIDGPSAGAAGEQKEVGATAPVSDGALGGGGRGGRRGRGRGRGGNPGAPVRGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.87
3	0.9
4	0.93
5	0.94
6	0.94
7	0.92
8	0.93
9	0.91
10	0.85
11	0.83
12	0.78
13	0.75
14	0.72
15	0.64
16	0.55
17	0.49
18	0.47
19	0.4
20	0.41
21	0.39
22	0.39
23	0.45
24	0.48
25	0.55
26	0.56
27	0.58
28	0.57
29	0.51
30	0.45
31	0.4
32	0.39
33	0.3
34	0.25
35	0.22
36	0.17
37	0.19
38	0.2
39	0.16
40	0.15
41	0.15
42	0.15
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.15
49	0.14
50	0.18
51	0.25
52	0.31
53	0.37
54	0.44
55	0.52
56	0.6
57	0.68
58	0.74
59	0.77
60	0.8
61	0.81
62	0.81
63	0.82
64	0.83
65	0.84
66	0.76
67	0.67
68	0.59
69	0.54
70	0.45
71	0.38
72	0.35
73	0.3
74	0.29
75	0.33
76	0.31
77	0.27
78	0.27
79	0.24
80	0.22
81	0.22
82	0.22
83	0.17
84	0.18
85	0.18
86	0.2
87	0.23
88	0.22
89	0.21
90	0.26
91	0.26
92	0.26
93	0.32
94	0.29
95	0.28
96	0.29
97	0.28
98	0.24
99	0.24
100	0.23
101	0.18
102	0.18
103	0.14
104	0.12
105	0.11
106	0.1
107	0.12
108	0.11
109	0.11
110	0.13
111	0.19
112	0.25
113	0.33
114	0.43
115	0.43
116	0.51
117	0.59
118	0.65
119	0.69
120	0.71
121	0.66
122	0.66
123	0.67
124	0.6
125	0.53
126	0.46
127	0.37
128	0.3
129	0.25
130	0.15
131	0.14
132	0.13
133	0.11
134	0.12
135	0.11
136	0.11
137	0.12
138	0.14
139	0.17
140	0.2
141	0.2
142	0.22
143	0.24
144	0.24
145	0.25
146	0.27
147	0.25
148	0.22
149	0.22
150	0.19
151	0.18
152	0.16
153	0.14
154	0.1
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.1
159	0.11
160	0.11
161	0.13
162	0.14
163	0.17
164	0.15
165	0.15
166	0.17
167	0.16
168	0.16
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.16
176	0.24
177	0.25
178	0.27
179	0.27
180	0.28
181	0.36
182	0.39
183	0.38
184	0.36
185	0.39
186	0.38
187	0.43
188	0.42
189	0.36
190	0.31
191	0.29
192	0.27
193	0.23
194	0.2
195	0.13
196	0.15
197	0.18
198	0.22
199	0.21
200	0.21
201	0.23
202	0.3
203	0.37
204	0.45
205	0.49
206	0.55
207	0.61
208	0.64
209	0.71
210	0.72
211	0.75
212	0.71
213	0.72
214	0.67
215	0.63
216	0.6
217	0.56
218	0.51
219	0.45
220	0.41
221	0.39
222	0.34
223	0.35
224	0.4
225	0.4
226	0.42
227	0.45
228	0.53
229	0.54
230	0.58
231	0.62
232	0.64
233	0.67
234	0.67
235	0.64
236	0.57
237	0.55
238	0.51
239	0.48
240	0.41
241	0.39
242	0.39
243	0.37
244	0.34
245	0.32
246	0.34
247	0.31
248	0.29
249	0.23
250	0.23
251	0.21
252	0.2
253	0.17
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.13
258	0.09
259	0.1
260	0.19
261	0.19
262	0.21
263	0.23
264	0.26
265	0.36
266	0.45
267	0.53
268	0.54
269	0.65
270	0.7
271	0.78
272	0.83
273	0.82
274	0.83
275	0.8
276	0.76
277	0.72
278	0.71
279	0.65
280	0.6
281	0.54
282	0.43
283	0.38
284	0.33
285	0.26
286	0.2
287	0.17
288	0.15
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.09
297	0.08
298	0.09
299	0.07
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.13
319	0.1
320	0.11
321	0.11
322	0.1
323	0.14
324	0.15
325	0.17
326	0.19
327	0.2
328	0.2
329	0.2
330	0.22
331	0.21
332	0.22
333	0.27
334	0.28
335	0.3
336	0.29
337	0.28
338	0.25
339	0.2
340	0.18
341	0.11
342	0.08
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.04
349	0.07
350	0.08
351	0.13
352	0.14
353	0.2
354	0.3
355	0.41
356	0.49
357	0.56
358	0.66
359	0.72
360	0.83
361	0.87
362	0.86
363	0.85
364	0.82
365	0.8
366	0.73
367	0.7
368	0.6
369	0.52
370	0.44
371	0.35
372	0.3
373	0.21
374	0.18
375	0.1
376	0.09
377	0.06
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.03
383	0.04
384	0.06
385	0.13
386	0.14
387	0.15
388	0.17
389	0.2
390	0.24
391	0.32
392	0.4
393	0.41
394	0.51
395	0.6
396	0.66
397	0.72
398	0.79
399	0.76
400	0.77
401	0.79
402	0.76
403	0.74
404	0.76
405	0.7
406	0.63
407	0.59
408	0.48
409	0.39
410	0.31
411	0.24
412	0.15
413	0.11
414	0.07
415	0.07
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.03
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.1
431	0.12
432	0.12
433	0.13
434	0.13
435	0.17
436	0.2
437	0.2
438	0.19
439	0.22
440	0.25
441	0.25
442	0.24
443	0.18
444	0.16
445	0.16
446	0.15
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.06
465	0.07
466	0.06
467	0.05
468	0.07
469	0.08
470	0.08
471	0.13
472	0.15
473	0.2
474	0.27
475	0.36
476	0.42
477	0.51
478	0.59
479	0.65
480	0.68
481	0.73
482	0.72
483	0.68
484	0.64
485	0.59

A0A369J6V2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer