Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IIE0

Protein Details
Accession A0A139IIE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-242DTYFVKPQGRKRPGTKGAKRFDAKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-238GRKRPGTKGAKRF
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
Amino Acid Sequences MSKRKFNAVAAAFDDENPRDWLYKNMPLVVDWLKTKYFKEGMKSSKTLNDIVGYISVPIGYDKTIANLAGALNINTRVEVIAKGAEKNKVTLYRYKSKLPIHNAESLLNFFAQPEAPLFVSYEDLQDGWPGCESELLILEIDHKILIGRHEKKGTIQTIHPDNINLYIDSTGDGKAGADFYSFWRAIKLPDDKMIKETLEDAKITATSQQTTDRAFDDTYFVKPQGRKRPGTKGAKRFDAKSASNAALFKSGMLKDYRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.26
3 0.25
4 0.24
5 0.22
6 0.19
7 0.2
8 0.26
9 0.28
10 0.34
11 0.34
12 0.35
13 0.34
14 0.33
15 0.36
16 0.32
17 0.3
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.29
24 0.32
25 0.32
26 0.38
27 0.44
28 0.48
29 0.53
30 0.54
31 0.5
32 0.5
33 0.49
34 0.43
35 0.36
36 0.3
37 0.23
38 0.22
39 0.2
40 0.14
41 0.11
42 0.1
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.1
69 0.11
70 0.13
71 0.16
72 0.2
73 0.2
74 0.21
75 0.24
76 0.26
77 0.28
78 0.32
79 0.36
80 0.41
81 0.44
82 0.47
83 0.5
84 0.51
85 0.56
86 0.56
87 0.57
88 0.51
89 0.53
90 0.5
91 0.44
92 0.38
93 0.32
94 0.25
95 0.18
96 0.14
97 0.08
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.08
134 0.16
135 0.2
136 0.24
137 0.26
138 0.26
139 0.29
140 0.34
141 0.35
142 0.29
143 0.27
144 0.29
145 0.32
146 0.33
147 0.3
148 0.24
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.14
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.17
174 0.23
175 0.26
176 0.23
177 0.3
178 0.34
179 0.33
180 0.35
181 0.35
182 0.28
183 0.24
184 0.24
185 0.22
186 0.2
187 0.19
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.14
194 0.13
195 0.15
196 0.19
197 0.2
198 0.22
199 0.23
200 0.2
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.25
210 0.29
211 0.38
212 0.46
213 0.52
214 0.57
215 0.61
216 0.71
217 0.75
218 0.81
219 0.82
220 0.81
221 0.81
222 0.83
223 0.81
224 0.73
225 0.7
226 0.67
227 0.59
228 0.54
229 0.51
230 0.43
231 0.42
232 0.4
233 0.33
234 0.28
235 0.26
236 0.22
237 0.22
238 0.2
239 0.21
240 0.26