Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IHW4

Protein Details
Accession A0A139IHW4    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-155ESERWDKRLAKKERNKDNNAHydrophilic
248-267IKKAEEIRLKKRRERGRADEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-264IRLKKRRERGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPTTLKRKGSPALEEDSESSKRRFAESADQQLAENTEDVLVEQKSTEEDPAATTTAPPANDRAARFAALRARNAESRKSNLQDTKHEAQKASIDPSQLTNINRKKDIAQHKLLKAEIEEAGGDFERQRAWDWTVEESERWDKRLAKKERNKDNNAFADYNKEAGKVYKRQLNTMQKAGFDERLEGYEQDKRDAISRAVASGGLEIVETADGELIAVDKDGSFYSTADSASFNENKPSKAAVDRLVDDIKKAEEIRLKKRRERGRADEDGGDVTYINEKNKQFNLKLARFYNKYTADIRESFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.41
4 0.39
5 0.36
6 0.33
7 0.3
8 0.29
9 0.3
10 0.29
11 0.28
12 0.35
13 0.4
14 0.49
15 0.49
16 0.49
17 0.46
18 0.45
19 0.42
20 0.32
21 0.23
22 0.13
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.14
38 0.15
39 0.13
40 0.12
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.2
47 0.24
48 0.25
49 0.27
50 0.25
51 0.26
52 0.25
53 0.27
54 0.3
55 0.29
56 0.31
57 0.3
58 0.32
59 0.36
60 0.38
61 0.42
62 0.38
63 0.4
64 0.45
65 0.44
66 0.48
67 0.48
68 0.5
69 0.5
70 0.53
71 0.54
72 0.53
73 0.53
74 0.46
75 0.41
76 0.42
77 0.37
78 0.34
79 0.29
80 0.24
81 0.22
82 0.24
83 0.25
84 0.24
85 0.23
86 0.27
87 0.31
88 0.34
89 0.35
90 0.35
91 0.34
92 0.39
93 0.48
94 0.46
95 0.5
96 0.53
97 0.54
98 0.56
99 0.54
100 0.45
101 0.36
102 0.3
103 0.21
104 0.14
105 0.12
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.17
120 0.19
121 0.19
122 0.17
123 0.18
124 0.23
125 0.21
126 0.21
127 0.23
128 0.26
129 0.33
130 0.44
131 0.49
132 0.53
133 0.61
134 0.69
135 0.76
136 0.8
137 0.79
138 0.73
139 0.72
140 0.66
141 0.61
142 0.52
143 0.41
144 0.37
145 0.31
146 0.28
147 0.21
148 0.17
149 0.13
150 0.15
151 0.2
152 0.2
153 0.24
154 0.27
155 0.27
156 0.31
157 0.4
158 0.47
159 0.46
160 0.47
161 0.44
162 0.39
163 0.41
164 0.39
165 0.32
166 0.22
167 0.2
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.13
173 0.15
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.15
178 0.17
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.15
217 0.17
218 0.16
219 0.23
220 0.25
221 0.25
222 0.26
223 0.26
224 0.24
225 0.26
226 0.28
227 0.27
228 0.29
229 0.3
230 0.32
231 0.35
232 0.32
233 0.29
234 0.27
235 0.22
236 0.21
237 0.2
238 0.21
239 0.24
240 0.31
241 0.41
242 0.49
243 0.55
244 0.6
245 0.69
246 0.74
247 0.77
248 0.8
249 0.79
250 0.79
251 0.8
252 0.77
253 0.69
254 0.6
255 0.52
256 0.42
257 0.32
258 0.22
259 0.15
260 0.17
261 0.16
262 0.17
263 0.23
264 0.24
265 0.3
266 0.37
267 0.44
268 0.4
269 0.47
270 0.55
271 0.54
272 0.6
273 0.6
274 0.63
275 0.58
276 0.61
277 0.62
278 0.55
279 0.53
280 0.49
281 0.48
282 0.46
283 0.45
284 0.44
285 0.41
286 0.4
287 0.37