Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HB16

Protein Details
Accession A0A139HB16    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-176AEEEAERERKKKKKEKKREKPSRKKRGGDDDFSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-170KRKRTAEEEAERERKKKKKEKKREKPSRKKRG
185-190RVRKSK
484-489AKSAKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDLAQPETPTIDSNEVEPQGNNDPQDPLRPEIEEENDAGGTPPIAAPYTDMETQEDDAAAIGSGANEEGTAARGEDEEMKNGDPANTDEAVIDNEDEESELEDLDEAEFEDFDPSALAIPDKPQQVDQDNVNLLGVHKRKRTAEEEAERERKKKKKEKKREKPSRKKRGGDDDFSGGEEIDGKRVRKSKIGADGQPIKSSRRERTPVNEDDLTPEERRRRALERKMDDAVKTNRVSRRKAAAEIEERADSEVNEMRARMTKACEDDNRDRNNGKIATHKLKILPEVVALMNRNTIQSQLVDPDINILEAVRFMLEPADQDAALPNYQIQRELFKILMSLNIGKEALVASSIGKLILFYTKSSQAQPEIKRMAEHLVQSWTSTILGKKDSARARPVETKQYDPVVAAQSQRAGASQVDRAAILAEKRRKVLAQPGPTNRARVEGGVGTYTIAPVNNLSNAQGVSSRKLGANDEAFRKIAARSAAKSAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.24
7 0.28
8 0.3
9 0.3
10 0.25
11 0.28
12 0.28
13 0.36
14 0.35
15 0.32
16 0.31
17 0.32
18 0.33
19 0.33
20 0.37
21 0.3
22 0.28
23 0.26
24 0.23
25 0.22
26 0.2
27 0.15
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.12
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.22
42 0.2
43 0.17
44 0.13
45 0.11
46 0.1
47 0.08
48 0.06
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.2
67 0.2
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.15
72 0.16
73 0.18
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.14
80 0.12
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.09
108 0.14
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.22
113 0.25
114 0.27
115 0.26
116 0.27
117 0.26
118 0.25
119 0.23
120 0.19
121 0.16
122 0.21
123 0.24
124 0.25
125 0.27
126 0.31
127 0.34
128 0.4
129 0.44
130 0.45
131 0.5
132 0.52
133 0.56
134 0.6
135 0.67
136 0.63
137 0.63
138 0.63
139 0.6
140 0.63
141 0.66
142 0.69
143 0.71
144 0.81
145 0.88
146 0.91
147 0.95
148 0.96
149 0.97
150 0.97
151 0.97
152 0.97
153 0.95
154 0.91
155 0.88
156 0.87
157 0.83
158 0.77
159 0.69
160 0.61
161 0.51
162 0.44
163 0.36
164 0.25
165 0.17
166 0.15
167 0.11
168 0.12
169 0.15
170 0.16
171 0.2
172 0.25
173 0.27
174 0.3
175 0.33
176 0.34
177 0.41
178 0.46
179 0.44
180 0.46
181 0.53
182 0.49
183 0.5
184 0.45
185 0.37
186 0.38
187 0.41
188 0.39
189 0.39
190 0.42
191 0.41
192 0.49
193 0.54
194 0.51
195 0.51
196 0.47
197 0.38
198 0.38
199 0.37
200 0.31
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.25
205 0.27
206 0.27
207 0.32
208 0.39
209 0.46
210 0.52
211 0.52
212 0.55
213 0.55
214 0.54
215 0.46
216 0.44
217 0.38
218 0.34
219 0.31
220 0.32
221 0.35
222 0.38
223 0.41
224 0.38
225 0.42
226 0.38
227 0.41
228 0.38
229 0.38
230 0.37
231 0.36
232 0.33
233 0.26
234 0.24
235 0.21
236 0.18
237 0.12
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.17
250 0.22
251 0.24
252 0.28
253 0.35
254 0.42
255 0.43
256 0.43
257 0.41
258 0.38
259 0.41
260 0.35
261 0.28
262 0.27
263 0.31
264 0.34
265 0.35
266 0.36
267 0.33
268 0.33
269 0.33
270 0.27
271 0.21
272 0.15
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.17
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.09
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.14
347 0.19
348 0.21
349 0.23
350 0.25
351 0.27
352 0.35
353 0.37
354 0.42
355 0.4
356 0.39
357 0.38
358 0.37
359 0.35
360 0.31
361 0.29
362 0.23
363 0.23
364 0.23
365 0.22
366 0.21
367 0.17
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.16
373 0.18
374 0.21
375 0.28
376 0.34
377 0.37
378 0.41
379 0.42
380 0.47
381 0.53
382 0.55
383 0.58
384 0.55
385 0.54
386 0.52
387 0.51
388 0.45
389 0.37
390 0.36
391 0.29
392 0.27
393 0.24
394 0.21
395 0.2
396 0.2
397 0.2
398 0.16
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.16
406 0.16
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.24
411 0.29
412 0.32
413 0.34
414 0.37
415 0.37
416 0.39
417 0.45
418 0.46
419 0.49
420 0.55
421 0.61
422 0.66
423 0.67
424 0.66
425 0.56
426 0.5
427 0.41
428 0.33
429 0.29
430 0.24
431 0.24
432 0.21
433 0.2
434 0.17
435 0.16
436 0.15
437 0.12
438 0.1
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.16
446 0.15
447 0.16
448 0.19
449 0.19
450 0.21
451 0.23
452 0.24
453 0.24
454 0.26
455 0.29
456 0.31
457 0.36
458 0.39
459 0.42
460 0.43
461 0.41
462 0.39
463 0.37
464 0.3
465 0.28
466 0.29
467 0.29
468 0.29
469 0.38