Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IPC5

Protein Details
Accession A0A139IPC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-276LPSANNKAAQPKRPKRKRRRADPFQTVQTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-266KAAQPKRPKRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MVRPATLARDISPPPVRRVSTVPGLLLDAKNHPDPEQEQEQDDFNANDKSEVARIEAHELSIRDHLSYFVSHLSQVSRPTVGPRVPIDAFRELYQRNQHSQGAHFVVHQHDHPVAGLHYDLRLQFSDSSTISFAIPYGLPGNPNSKRPNRMAIETRVHNLWNNLIESASHATGSLLIWDTGQYENLPRPQPKLQPNTDDEISDIDDGESADTASQSQKLFEAFQSRHMRIRLHGTRLPKNYTIALRLPSANNKAAQPKRPKRKRRRADPFQTVQTATANSSEGESDAEAIRSASRDDIIDAAGIEAANASEDDEDGVIRSNNAYTGANNTIGSIHQRHWFLTLDRSNSGFTKARSGPDAGRWIGSDAFFVRGRDHERSIVTGRLADDVMADEGVEKFMRRKMWRPILE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.5
3 0.49
4 0.47
5 0.51
6 0.49
7 0.48
8 0.47
9 0.42
10 0.35
11 0.35
12 0.36
13 0.32
14 0.28
15 0.24
16 0.25
17 0.28
18 0.28
19 0.27
20 0.28
21 0.29
22 0.34
23 0.38
24 0.36
25 0.35
26 0.35
27 0.36
28 0.33
29 0.33
30 0.26
31 0.21
32 0.22
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.22
43 0.22
44 0.21
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.22
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.16
61 0.17
62 0.2
63 0.2
64 0.19
65 0.19
66 0.23
67 0.28
68 0.26
69 0.28
70 0.27
71 0.3
72 0.3
73 0.32
74 0.33
75 0.31
76 0.31
77 0.28
78 0.32
79 0.27
80 0.32
81 0.38
82 0.38
83 0.38
84 0.41
85 0.43
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.35
90 0.31
91 0.27
92 0.25
93 0.25
94 0.24
95 0.22
96 0.19
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.19
129 0.2
130 0.26
131 0.32
132 0.37
133 0.42
134 0.44
135 0.51
136 0.46
137 0.5
138 0.5
139 0.5
140 0.51
141 0.47
142 0.46
143 0.38
144 0.36
145 0.31
146 0.25
147 0.21
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.11
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.1
172 0.14
173 0.18
174 0.18
175 0.22
176 0.27
177 0.34
178 0.41
179 0.46
180 0.45
181 0.46
182 0.48
183 0.48
184 0.44
185 0.37
186 0.29
187 0.22
188 0.19
189 0.14
190 0.11
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.17
209 0.15
210 0.24
211 0.31
212 0.31
213 0.35
214 0.36
215 0.35
216 0.3
217 0.4
218 0.36
219 0.35
220 0.38
221 0.4
222 0.46
223 0.49
224 0.52
225 0.43
226 0.4
227 0.37
228 0.36
229 0.33
230 0.28
231 0.25
232 0.22
233 0.23
234 0.23
235 0.24
236 0.27
237 0.25
238 0.24
239 0.25
240 0.32
241 0.36
242 0.43
243 0.49
244 0.55
245 0.64
246 0.73
247 0.82
248 0.84
249 0.91
250 0.93
251 0.93
252 0.94
253 0.94
254 0.94
255 0.93
256 0.88
257 0.81
258 0.74
259 0.63
260 0.52
261 0.43
262 0.33
263 0.24
264 0.18
265 0.13
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.14
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.19
320 0.17
321 0.18
322 0.22
323 0.23
324 0.23
325 0.25
326 0.28
327 0.25
328 0.32
329 0.35
330 0.33
331 0.34
332 0.35
333 0.35
334 0.32
335 0.36
336 0.31
337 0.26
338 0.31
339 0.32
340 0.34
341 0.35
342 0.38
343 0.35
344 0.38
345 0.43
346 0.36
347 0.34
348 0.31
349 0.31
350 0.29
351 0.26
352 0.21
353 0.16
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.2
358 0.23
359 0.29
360 0.32
361 0.34
362 0.35
363 0.34
364 0.39
365 0.4
366 0.39
367 0.34
368 0.31
369 0.29
370 0.26
371 0.24
372 0.19
373 0.16
374 0.14
375 0.14
376 0.11
377 0.1
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.13
384 0.17
385 0.27
386 0.31
387 0.4
388 0.49