Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IPX3

Protein Details
Accession A0A139IPX3    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-83ELEHHPYNQRHTRQPSHHHHHHQRTDGABasic
981-1000SDDLDRKPKKAKRRVVIEDEBasic
1051-1109GKAKGSSKAKGKGKQREKKKKVKAAKTLAELKKEASRNKTAKKKYLKRLRKDYVGSAKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
986-994RKPKKAKRR
1041-1101KPAIKKSKGEGKAKGSSKAKGKGKQREKKKKVKAAKTLAELKKEASRNKTAKKKYLKRLRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd18008  DEXDc_SHPRH-like  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MSSTTNNPRPRPRELEAIEDDLAFNAVLIESLDPYSDDYQDRRARLDAETRRLEAELEHHPYNQRHTRQPSHHHHHHQRTDGASDNAAARDDWWQNAMHGRPGSNQSSAGSMSSNAARPNPPHYQSHATAGLKRGPPVSSFLPDPFEPASKRPTPDPSNPATPTSSTGSDYADQLARMRQGAAVRRQQDILHQHEMALRDHAYAQQMRMNQPPPSQSIASSSRPAVQTTLNYNGRYHKPPPSLPMIKTEPPAQSTQASGPRGSYPVLPSQQVKAEPSSSRTQQPSQHRAFRNPPPMIDLTGSDSEDDVEEINPTRFTPSGRQPSRSAQPVPQNAPIPHRQQMPGAYPGTDLQHAYHNALNLAHRAQQTQDPFAQLRNQIGHGVQNGLQALGSGARELSNLVFGSSARPYDLDDDDDDDMEYVGHHQLPGYANYAGQEDLYRQRYNDFAAYDPSKSKEELEALLANIRPDEDMPAHLRVQTPEDMSVRLHKYQELGLTWLKNQEESSNKGGILADDMGLGKTIQMLSLMVTRKSDDPRCKTTLIIAPVALMRQWKSEIRNKLKPNRQLLIFTHHATHKAKSFDELRTFDVVLTTYGTIAAELKRLEKFKLRQLANPGAQIQPTAAEKTIFLGENARWYRVVLDEAQCIKNRTTQTSKGACLLNAQYRFCVTGTPMMNNVEEFFSLIQFLRIKPYCHWQRFRNDFNTPLRSSSDQVRQGAMQKLQILCKSIMLRRTKKSTFEGKPILVLPERTTDEVNPVFSEDETAFYHALETQSQVTFNKYLRAGTVGQSYSAILVLLLRLRQACCHPHLIKDFGVAAAADMSEDQMLDFARQLEPQVIERIKAAGGNFECPVCYDVTANPAIFVPCGHDTCSECFAKIADPAMAIQNGDERGQARCPNCRGNIDPKRLTDFNSFKKIHMPELLTQEEQAQMEEGMVDFDSDSDEDSDSESDEEENEYEDDTLDGFIVDDEDEVEADGSDSDDLDRKPKKAKRRVVIEDEETDSDDLDTKPAKIKTEVKEQPSEVVAGPSTAVIDEAEEEKPAIKKSKGEGKAKGSSKAKGKGKQREKKKKVKAAKTLAELKKEASRNKTAKKKYLKRLRKDYVGSAKIERTMEILEEIMKDKEGEKVLIFSQWTSLLDLLEIPIDEQDYGYRRYDGSMSASMRGDAVDDFCDDRKNVRIMLVSLKAGNAGLNLNMASQVIILDPFWNPYIEEQAIDRAHRIGQKRPVKVHRVLIKGTVEDRIIDLQEKKRRLISEALDEQQSQQLGRLGVRELAYLFGVTSDPNQQVDYQPRQRQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.6
4 0.59
5 0.51
6 0.43
7 0.38
8 0.28
9 0.25
10 0.16
11 0.11
12 0.06
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.08
20 0.08
21 0.11
22 0.13
23 0.16
24 0.18
25 0.19
26 0.29
27 0.35
28 0.36
29 0.36
30 0.36
31 0.36
32 0.38
33 0.46
34 0.45
35 0.48
36 0.52
37 0.5
38 0.49
39 0.47
40 0.43
41 0.34
42 0.3
43 0.29
44 0.3
45 0.3
46 0.31
47 0.37
48 0.4
49 0.48
50 0.52
51 0.51
52 0.54
53 0.62
54 0.69
55 0.72
56 0.8
57 0.82
58 0.82
59 0.86
60 0.87
61 0.89
62 0.9
63 0.89
64 0.85
65 0.79
66 0.72
67 0.66
68 0.6
69 0.51
70 0.41
71 0.35
72 0.3
73 0.25
74 0.23
75 0.19
76 0.14
77 0.19
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.2
83 0.27
84 0.28
85 0.27
86 0.28
87 0.28
88 0.31
89 0.37
90 0.39
91 0.34
92 0.33
93 0.27
94 0.28
95 0.27
96 0.22
97 0.17
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.25
105 0.26
106 0.32
107 0.38
108 0.39
109 0.41
110 0.45
111 0.49
112 0.48
113 0.51
114 0.52
115 0.46
116 0.46
117 0.46
118 0.47
119 0.42
120 0.42
121 0.38
122 0.32
123 0.31
124 0.32
125 0.32
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.3
130 0.29
131 0.31
132 0.28
133 0.29
134 0.28
135 0.28
136 0.34
137 0.35
138 0.38
139 0.39
140 0.46
141 0.49
142 0.55
143 0.59
144 0.57
145 0.6
146 0.6
147 0.57
148 0.51
149 0.44
150 0.39
151 0.36
152 0.32
153 0.25
154 0.24
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.19
160 0.18
161 0.18
162 0.2
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.21
168 0.29
169 0.36
170 0.41
171 0.41
172 0.43
173 0.44
174 0.42
175 0.44
176 0.44
177 0.42
178 0.4
179 0.37
180 0.36
181 0.37
182 0.39
183 0.32
184 0.28
185 0.22
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.23
193 0.26
194 0.28
195 0.34
196 0.36
197 0.34
198 0.36
199 0.38
200 0.37
201 0.39
202 0.36
203 0.3
204 0.33
205 0.34
206 0.34
207 0.34
208 0.31
209 0.31
210 0.31
211 0.31
212 0.27
213 0.24
214 0.25
215 0.27
216 0.35
217 0.35
218 0.35
219 0.36
220 0.41
221 0.43
222 0.45
223 0.45
224 0.44
225 0.46
226 0.48
227 0.52
228 0.55
229 0.56
230 0.51
231 0.54
232 0.52
233 0.49
234 0.48
235 0.48
236 0.41
237 0.37
238 0.38
239 0.33
240 0.27
241 0.26
242 0.29
243 0.31
244 0.3
245 0.27
246 0.27
247 0.26
248 0.27
249 0.25
250 0.22
251 0.19
252 0.24
253 0.26
254 0.27
255 0.27
256 0.29
257 0.32
258 0.32
259 0.31
260 0.26
261 0.28
262 0.27
263 0.3
264 0.34
265 0.33
266 0.37
267 0.4
268 0.42
269 0.45
270 0.54
271 0.59
272 0.6
273 0.66
274 0.64
275 0.67
276 0.7
277 0.71
278 0.71
279 0.63
280 0.56
281 0.52
282 0.49
283 0.44
284 0.37
285 0.28
286 0.23
287 0.23
288 0.23
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.08
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.12
303 0.14
304 0.2
305 0.28
306 0.38
307 0.42
308 0.46
309 0.48
310 0.54
311 0.58
312 0.58
313 0.51
314 0.47
315 0.51
316 0.55
317 0.55
318 0.53
319 0.52
320 0.47
321 0.5
322 0.49
323 0.45
324 0.43
325 0.42
326 0.38
327 0.36
328 0.38
329 0.37
330 0.36
331 0.32
332 0.27
333 0.24
334 0.24
335 0.23
336 0.2
337 0.17
338 0.12
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.18
344 0.18
345 0.18
346 0.18
347 0.14
348 0.15
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.18
353 0.22
354 0.24
355 0.26
356 0.26
357 0.24
358 0.24
359 0.25
360 0.28
361 0.24
362 0.25
363 0.23
364 0.23
365 0.21
366 0.21
367 0.21
368 0.17
369 0.18
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.14
404 0.11
405 0.1
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.09
414 0.11
415 0.12
416 0.14
417 0.13
418 0.12
419 0.13
420 0.14
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.15
426 0.19
427 0.19
428 0.18
429 0.2
430 0.2
431 0.22
432 0.23
433 0.18
434 0.15
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.17
444 0.17
445 0.17
446 0.18
447 0.16
448 0.15
449 0.17
450 0.16
451 0.14
452 0.12
453 0.11
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.08
458 0.1
459 0.13
460 0.15
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.19
466 0.19
467 0.17
468 0.17
469 0.18
470 0.17
471 0.17
472 0.22
473 0.22
474 0.22
475 0.22
476 0.2
477 0.2
478 0.21
479 0.23
480 0.17
481 0.17
482 0.18
483 0.18
484 0.18
485 0.2
486 0.19
487 0.17
488 0.16
489 0.18
490 0.19
491 0.22
492 0.25
493 0.23
494 0.23
495 0.23
496 0.22
497 0.18
498 0.16
499 0.12
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.07
505 0.06
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.12
517 0.13
518 0.16
519 0.22
520 0.28
521 0.33
522 0.37
523 0.43
524 0.46
525 0.46
526 0.42
527 0.42
528 0.4
529 0.34
530 0.29
531 0.22
532 0.19
533 0.19
534 0.19
535 0.14
536 0.1
537 0.08
538 0.08
539 0.11
540 0.13
541 0.18
542 0.26
543 0.35
544 0.42
545 0.5
546 0.57
547 0.64
548 0.69
549 0.72
550 0.71
551 0.65
552 0.58
553 0.54
554 0.48
555 0.45
556 0.4
557 0.33
558 0.29
559 0.25
560 0.28
561 0.26
562 0.26
563 0.24
564 0.23
565 0.23
566 0.24
567 0.26
568 0.26
569 0.3
570 0.3
571 0.28
572 0.27
573 0.27
574 0.24
575 0.21
576 0.16
577 0.11
578 0.1
579 0.07
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.09
589 0.12
590 0.13
591 0.15
592 0.21
593 0.24
594 0.28
595 0.37
596 0.37
597 0.37
598 0.43
599 0.49
600 0.43
601 0.42
602 0.37
603 0.29
604 0.27
605 0.24
606 0.17
607 0.11
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.09
614 0.1
615 0.09
616 0.08
617 0.09
618 0.09
619 0.17
620 0.17
621 0.17
622 0.15
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.16
627 0.1
628 0.11
629 0.14
630 0.17
631 0.19
632 0.2
633 0.21
634 0.2
635 0.22
636 0.22
637 0.23
638 0.26
639 0.28
640 0.35
641 0.36
642 0.37
643 0.35
644 0.35
645 0.29
646 0.27
647 0.25
648 0.23
649 0.22
650 0.21
651 0.18
652 0.18
653 0.19
654 0.16
655 0.14
656 0.09
657 0.13
658 0.14
659 0.15
660 0.16
661 0.16
662 0.16
663 0.15
664 0.15
665 0.09
666 0.08
667 0.08
668 0.06
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.14
676 0.16
677 0.18
678 0.18
679 0.28
680 0.36
681 0.43
682 0.48
683 0.47
684 0.56
685 0.62
686 0.67
687 0.63
688 0.56
689 0.54
690 0.54
691 0.54
692 0.45
693 0.39
694 0.36
695 0.31
696 0.3
697 0.3
698 0.31
699 0.3
700 0.3
701 0.29
702 0.27
703 0.3
704 0.33
705 0.28
706 0.22
707 0.21
708 0.21
709 0.23
710 0.23
711 0.21
712 0.17
713 0.19
714 0.2
715 0.19
716 0.25
717 0.31
718 0.36
719 0.39
720 0.46
721 0.46
722 0.47
723 0.51
724 0.55
725 0.5
726 0.52
727 0.51
728 0.43
729 0.43
730 0.39
731 0.35
732 0.26
733 0.23
734 0.17
735 0.16
736 0.17
737 0.17
738 0.17
739 0.14
740 0.18
741 0.18
742 0.17
743 0.13
744 0.13
745 0.12
746 0.11
747 0.13
748 0.08
749 0.1
750 0.1
751 0.11
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.1
757 0.08
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.14
765 0.14
766 0.17
767 0.16
768 0.15
769 0.15
770 0.18
771 0.17
772 0.16
773 0.2
774 0.16
775 0.16
776 0.16
777 0.15
778 0.12
779 0.11
780 0.09
781 0.04
782 0.04
783 0.04
784 0.05
785 0.05
786 0.06
787 0.07
788 0.08
789 0.1
790 0.13
791 0.17
792 0.18
793 0.27
794 0.27
795 0.31
796 0.34
797 0.35
798 0.32
799 0.3
800 0.27
801 0.18
802 0.18
803 0.12
804 0.09
805 0.06
806 0.06
807 0.04
808 0.03
809 0.04
810 0.03
811 0.03
812 0.03
813 0.04
814 0.04
815 0.04
816 0.05
817 0.06
818 0.07
819 0.07
820 0.08
821 0.1
822 0.11
823 0.12
824 0.18
825 0.17
826 0.17
827 0.17
828 0.17
829 0.15
830 0.16
831 0.14
832 0.13
833 0.14
834 0.16
835 0.16
836 0.15
837 0.15
838 0.14
839 0.15
840 0.1
841 0.09
842 0.08
843 0.08
844 0.12
845 0.14
846 0.13
847 0.12
848 0.12
849 0.12
850 0.11
851 0.1
852 0.11
853 0.11
854 0.12
855 0.13
856 0.15
857 0.17
858 0.19
859 0.24
860 0.2
861 0.18
862 0.18
863 0.17
864 0.16
865 0.15
866 0.13
867 0.09
868 0.09
869 0.1
870 0.12
871 0.11
872 0.1
873 0.09
874 0.1
875 0.11
876 0.11
877 0.11
878 0.1
879 0.12
880 0.16
881 0.21
882 0.2
883 0.26
884 0.3
885 0.36
886 0.38
887 0.4
888 0.41
889 0.47
890 0.54
891 0.56
892 0.56
893 0.52
894 0.55
895 0.52
896 0.52
897 0.5
898 0.48
899 0.46
900 0.51
901 0.5
902 0.44
903 0.51
904 0.48
905 0.43
906 0.4
907 0.36
908 0.31
909 0.36
910 0.39
911 0.31
912 0.3
913 0.27
914 0.24
915 0.21
916 0.17
917 0.11
918 0.08
919 0.08
920 0.08
921 0.07
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.04
926 0.04
927 0.05
928 0.05
929 0.06
930 0.06
931 0.07
932 0.07
933 0.08
934 0.08
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.07
939 0.07
940 0.08
941 0.07
942 0.08
943 0.08
944 0.08
945 0.08
946 0.08
947 0.07
948 0.07
949 0.07
950 0.05
951 0.05
952 0.04
953 0.04
954 0.05
955 0.04
956 0.04
957 0.04
958 0.04
959 0.04
960 0.05
961 0.05
962 0.04
963 0.04
964 0.04
965 0.04
966 0.04
967 0.04
968 0.05
969 0.09
970 0.09
971 0.17
972 0.21
973 0.23
974 0.33
975 0.4
976 0.5
977 0.57
978 0.66
979 0.68
980 0.75
981 0.81
982 0.8
983 0.8
984 0.74
985 0.66
986 0.59
987 0.51
988 0.42
989 0.33
990 0.24
991 0.18
992 0.15
993 0.12
994 0.12
995 0.12
996 0.12
997 0.18
998 0.2
999 0.23
1000 0.27
1001 0.35
1002 0.38
1003 0.48
1004 0.53
1005 0.52
1006 0.55
1007 0.53
1008 0.5
1009 0.43
1010 0.39
1011 0.28
1012 0.23
1013 0.18
1014 0.13
1015 0.12
1016 0.09
1017 0.08
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.05
1021 0.05
1022 0.06
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.09
1027 0.11
1028 0.13
1029 0.17
1030 0.21
1031 0.21
1032 0.25
1033 0.31
1034 0.42
1035 0.48
1036 0.53
1037 0.57
1038 0.59
1039 0.67
1040 0.66
1041 0.68
1042 0.61
1043 0.59
1044 0.6
1045 0.62
1046 0.62
1047 0.61
1048 0.68
1049 0.7
1050 0.77
1051 0.8
1052 0.84
1053 0.86
1054 0.88
1055 0.91
1056 0.92
1057 0.92
1058 0.91
1059 0.92
1060 0.91
1061 0.9
1062 0.87
1063 0.84
1064 0.83
1065 0.77
1066 0.72
1067 0.62
1068 0.54
1069 0.52
1070 0.51
1071 0.5
1072 0.46
1073 0.51
1074 0.55
1075 0.64
1076 0.71
1077 0.72
1078 0.76
1079 0.81
1080 0.84
1081 0.85
1082 0.88
1083 0.88
1084 0.89
1085 0.91
1086 0.9
1087 0.88
1088 0.82
1089 0.81
1090 0.8
1091 0.74
1092 0.67
1093 0.6
1094 0.54
1095 0.49
1096 0.44
1097 0.35
1098 0.26
1099 0.22
1100 0.2
1101 0.17
1102 0.15
1103 0.12
1104 0.13
1105 0.14
1106 0.13
1107 0.13
1108 0.12
1109 0.12
1110 0.17
1111 0.18
1112 0.18
1113 0.17
1114 0.19
1115 0.19
1116 0.21
1117 0.21
1118 0.16
1119 0.16
1120 0.16
1121 0.16
1122 0.16
1123 0.15
1124 0.12
1125 0.12
1126 0.12
1127 0.1
1128 0.09
1129 0.08
1130 0.07
1131 0.07
1132 0.07
1133 0.07
1134 0.07
1135 0.1
1136 0.13
1137 0.16
1138 0.18
1139 0.19
1140 0.18
1141 0.2
1142 0.21
1143 0.2
1144 0.22
1145 0.26
1146 0.25
1147 0.28
1148 0.28
1149 0.26
1150 0.25
1151 0.22
1152 0.18
1153 0.12
1154 0.12
1155 0.1
1156 0.11
1157 0.13
1158 0.14
1159 0.17
1160 0.17
1161 0.19
1162 0.24
1163 0.26
1164 0.25
1165 0.26
1166 0.29
1167 0.28
1168 0.34
1169 0.35
1170 0.3
1171 0.28
1172 0.27
1173 0.24
1174 0.21
1175 0.19
1176 0.13
1177 0.1
1178 0.09
1179 0.09
1180 0.09
1181 0.09
1182 0.09
1183 0.09
1184 0.07
1185 0.06
1186 0.06
1187 0.06
1188 0.06
1189 0.06
1190 0.07
1191 0.08
1192 0.1
1193 0.11
1194 0.11
1195 0.12
1196 0.13
1197 0.19
1198 0.18
1199 0.19
1200 0.18
1201 0.24
1202 0.25
1203 0.26
1204 0.26
1205 0.21
1206 0.24
1207 0.29
1208 0.32
1209 0.34
1210 0.42
1211 0.5
1212 0.57
1213 0.65
1214 0.7
1215 0.73
1216 0.76
1217 0.77
1218 0.75
1219 0.72
1220 0.67
1221 0.63
1222 0.58
1223 0.53
1224 0.47
1225 0.41
1226 0.33
1227 0.28
1228 0.27
1229 0.24
1230 0.22
1231 0.23
1232 0.28
1233 0.34
1234 0.42
1235 0.45
1236 0.46
1237 0.49
1238 0.5
1239 0.49
1240 0.51
1241 0.48
1242 0.49
1243 0.53
1244 0.53
1245 0.49
1246 0.47
1247 0.45
1248 0.4
1249 0.35
1250 0.25
1251 0.21
1252 0.22
1253 0.21
1254 0.22
1255 0.22
1256 0.2
1257 0.23
1258 0.23
1259 0.22
1260 0.18
1261 0.18
1262 0.17
1263 0.15
1264 0.13
1265 0.1
1266 0.1
1267 0.09
1268 0.11
1269 0.15
1270 0.17
1271 0.18
1272 0.19
1273 0.2
1274 0.26
1275 0.35
1276 0.43
1277 0.47