Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IHS2

Protein Details
Accession A0A139IHS2    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-203GTPTRPAPTRPNPPRRRPNPPTPIQEHydrophilic
362-388KAEHSSKTGKKKGRGRPRKRPVPSMDEBasic
405-431FVPPGKKAKGKQPIKKRKTNTRTSSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-382RRLRRLAKAEHSSKTGKKKGRGRPRKRP
408-422PGKKAKGKQPIKKRK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MAHRGYGGRGQFDGRSLDPALLGLSDNASNGYMTEDESTTSNIQGYPQQGYTPRAYNNSLQTGPAAFPTGRTPYTGSYQDFAAQGTATGPYFTEPAQTLPQVSDEQFQMSFEDLTRGPAPLPAFSDFTTREPVVAQHNRLVGWYIRPQIELPGVGGVIPIESPYDIPEFGNFPPSNVGTPTRPAPTRPNPPRRRPNPPTPIQEATMTPFADPASIPQAAIEAHGTEGREDPGIVHKGSVIQPCRCYVGRKEEIKRPPNAWILYRSSMFKEGERYLKEIGHPKGAGAAEISIICGKWWRAMSEAEQAPWEKKAKEMDDEHKRLYPGWKYDPGAIHRQRFGTVDCKCGAYEYNMEQRRLRRLAKAEHSSKTGKKKGRGRPRKRPVPSMDEEEHDVDDEDDVNDSDAFVPPGKKAKGKQPIKKRKTNTRTSSATPSTSTPVGPSRTTSQAMDQYFQDFQTPIQQTFQAVVDAGRAARQQTPPRELRTQPNISYAEPADEAIEDAEMSGTDDIRDVGIGDFGHPDDAYTDDMLQSAFNFDDFDIDPSYAAPAPRLSRLGRWSRRANASRSFYAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.23
4 0.23
5 0.2
6 0.19
7 0.16
8 0.13
9 0.12
10 0.08
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.11
19 0.09
20 0.1
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.17
26 0.15
27 0.16
28 0.16
29 0.14
30 0.15
31 0.19
32 0.2
33 0.21
34 0.21
35 0.24
36 0.26
37 0.31
38 0.33
39 0.34
40 0.35
41 0.36
42 0.39
43 0.41
44 0.43
45 0.45
46 0.41
47 0.36
48 0.34
49 0.31
50 0.28
51 0.23
52 0.2
53 0.14
54 0.14
55 0.18
56 0.22
57 0.21
58 0.22
59 0.24
60 0.23
61 0.29
62 0.33
63 0.31
64 0.27
65 0.27
66 0.28
67 0.26
68 0.23
69 0.18
70 0.13
71 0.11
72 0.1
73 0.11
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.12
81 0.11
82 0.14
83 0.17
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.13
100 0.11
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.23
113 0.22
114 0.23
115 0.27
116 0.24
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.27
121 0.31
122 0.31
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.31
128 0.22
129 0.21
130 0.24
131 0.24
132 0.24
133 0.25
134 0.25
135 0.25
136 0.25
137 0.21
138 0.17
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.07
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.2
158 0.18
159 0.17
160 0.2
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.23
165 0.16
166 0.19
167 0.21
168 0.23
169 0.23
170 0.25
171 0.33
172 0.38
173 0.48
174 0.56
175 0.64
176 0.69
177 0.79
178 0.87
179 0.85
180 0.87
181 0.84
182 0.85
183 0.83
184 0.82
185 0.78
186 0.73
187 0.69
188 0.59
189 0.53
190 0.43
191 0.36
192 0.31
193 0.24
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.15
224 0.19
225 0.24
226 0.23
227 0.23
228 0.24
229 0.25
230 0.29
231 0.27
232 0.27
233 0.26
234 0.31
235 0.37
236 0.44
237 0.48
238 0.52
239 0.61
240 0.63
241 0.62
242 0.54
243 0.51
244 0.49
245 0.46
246 0.4
247 0.34
248 0.33
249 0.32
250 0.31
251 0.27
252 0.22
253 0.24
254 0.23
255 0.2
256 0.2
257 0.2
258 0.25
259 0.25
260 0.26
261 0.23
262 0.23
263 0.25
264 0.28
265 0.27
266 0.25
267 0.23
268 0.21
269 0.23
270 0.22
271 0.2
272 0.12
273 0.11
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.15
288 0.22
289 0.22
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.19
294 0.2
295 0.2
296 0.13
297 0.15
298 0.2
299 0.21
300 0.25
301 0.3
302 0.36
303 0.43
304 0.47
305 0.46
306 0.43
307 0.41
308 0.37
309 0.37
310 0.33
311 0.28
312 0.3
313 0.34
314 0.33
315 0.36
316 0.39
317 0.37
318 0.42
319 0.42
320 0.4
321 0.38
322 0.37
323 0.35
324 0.32
325 0.3
326 0.29
327 0.25
328 0.25
329 0.23
330 0.24
331 0.22
332 0.22
333 0.21
334 0.15
335 0.17
336 0.17
337 0.25
338 0.28
339 0.3
340 0.33
341 0.35
342 0.4
343 0.43
344 0.41
345 0.38
346 0.41
347 0.48
348 0.53
349 0.59
350 0.57
351 0.53
352 0.55
353 0.54
354 0.54
355 0.55
356 0.55
357 0.52
358 0.55
359 0.63
360 0.69
361 0.75
362 0.8
363 0.82
364 0.85
365 0.89
366 0.91
367 0.88
368 0.87
369 0.82
370 0.79
371 0.73
372 0.69
373 0.6
374 0.52
375 0.48
376 0.4
377 0.33
378 0.25
379 0.2
380 0.13
381 0.11
382 0.1
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.19
396 0.21
397 0.25
398 0.28
399 0.37
400 0.46
401 0.55
402 0.63
403 0.67
404 0.76
405 0.8
406 0.86
407 0.85
408 0.86
409 0.86
410 0.88
411 0.84
412 0.81
413 0.77
414 0.72
415 0.72
416 0.64
417 0.56
418 0.47
419 0.41
420 0.36
421 0.32
422 0.27
423 0.21
424 0.23
425 0.24
426 0.23
427 0.25
428 0.25
429 0.29
430 0.31
431 0.29
432 0.29
433 0.32
434 0.33
435 0.32
436 0.28
437 0.27
438 0.25
439 0.25
440 0.22
441 0.15
442 0.14
443 0.21
444 0.23
445 0.21
446 0.23
447 0.23
448 0.22
449 0.23
450 0.23
451 0.15
452 0.12
453 0.11
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.12
460 0.17
461 0.24
462 0.32
463 0.38
464 0.47
465 0.5
466 0.56
467 0.61
468 0.6
469 0.63
470 0.64
471 0.64
472 0.57
473 0.59
474 0.55
475 0.49
476 0.48
477 0.39
478 0.32
479 0.25
480 0.23
481 0.17
482 0.14
483 0.14
484 0.1
485 0.09
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.08
523 0.12
524 0.13
525 0.15
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.14
530 0.17
531 0.16
532 0.15
533 0.14
534 0.18
535 0.21
536 0.25
537 0.29
538 0.29
539 0.34
540 0.43
541 0.52
542 0.56
543 0.61
544 0.66
545 0.7
546 0.78
547 0.79
548 0.76
549 0.75
550 0.73