FuNGI

A0A139IHC1

Protein Details

Accession

A0A139IHC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
395-419	REGDRDRREREKQRAERKQEAKREM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
227-243	PKHKIKKIPRGPPSPPP
383-426	RSRSRSRSRSGGREGDRDRREREKQRAERKQEAKREMARKNMGH

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSLAGSRTSISSALPKPKYTGEDEELPTHTQQKGPRVVGARELESSQLVVKRSGPPPYGQRSGWRPRNVEDFGDGGAFPEVPMAQYPLDMGRKNQPSTSNALALQVDNEGKVKYDAIARRGHGENRIVHASFKDLIPLRQRADVGDISLERPSEEEVQASKERTQKALQGLVDGTLAAQKPKNVKGTTRAEPTFVRYTPANQMGDTSKKQDRIMKIVPRQQDPMEPPKHKIKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALHTADRHAREEVQQRHRMQQRLAEKEKEAQEEHLRQLAMKAREDKAAAATQRRGSDRGRSRSRSVDSRSSYSSYSSRSRSRSRSRSGGREGDRDRREREKQRAERKQEAKREMARKNMGHERKMQMMAREQNRDIGEKVALGLAKPTQSKEAMYDSRLFNQSSGFAAGFNEDQAYDKPLFADRDALNSIYRPTVGDEDDGEDGGETLEKIQGTKRFDTLGRAPKSGFKGTETAEARSGPVQFERDRGDDPFGIEAGIAAASGGSKRAADDDGGGKGKRARVDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.4
3	0.42
4	0.46
5	0.49
6	0.47
7	0.48
8	0.43
9	0.47
10	0.49
11	0.49
12	0.47
13	0.45
14	0.4
15	0.37
16	0.33
17	0.3
18	0.32
19	0.37
20	0.43
21	0.43
22	0.47
23	0.48
24	0.48
25	0.52
26	0.51
27	0.44
28	0.38
29	0.36
30	0.31
31	0.26
32	0.25
33	0.21
34	0.2
35	0.19
36	0.19
37	0.22
38	0.28
39	0.32
40	0.39
41	0.37
42	0.39
43	0.46
44	0.52
45	0.54
46	0.48
47	0.52
48	0.54
49	0.63
50	0.67
51	0.66
52	0.61
53	0.6
54	0.67
55	0.62
56	0.55
57	0.47
58	0.39
59	0.31
60	0.29
61	0.24
62	0.16
63	0.14
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.07
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.14
75	0.19
76	0.2
77	0.22
78	0.29
79	0.36
80	0.38
81	0.41
82	0.41
83	0.38
84	0.44
85	0.45
86	0.39
87	0.32
88	0.33
89	0.29
90	0.25
91	0.23
92	0.19
93	0.15
94	0.13
95	0.14
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.18
102	0.21
103	0.25
104	0.3
105	0.3
106	0.35
107	0.38
108	0.39
109	0.38
110	0.39
111	0.38
112	0.38
113	0.41
114	0.36
115	0.33
116	0.31
117	0.29
118	0.24
119	0.21
120	0.22
121	0.19
122	0.23
123	0.29
124	0.34
125	0.32
126	0.34
127	0.34
128	0.29
129	0.32
130	0.28
131	0.22
132	0.2
133	0.19
134	0.16
135	0.17
136	0.16
137	0.11
138	0.11
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.14
143	0.14
144	0.19
145	0.22
146	0.23
147	0.26
148	0.28
149	0.3
150	0.31
151	0.32
152	0.32
153	0.34
154	0.38
155	0.33
156	0.29
157	0.28
158	0.25
159	0.23
160	0.17
161	0.12
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.13
167	0.18
168	0.23
169	0.31
170	0.3
171	0.33
172	0.4
173	0.46
174	0.49
175	0.52
176	0.47
177	0.43
178	0.42
179	0.44
180	0.41
181	0.34
182	0.3
183	0.23
184	0.25
185	0.29
186	0.34
187	0.29
188	0.23
189	0.25
190	0.26
191	0.31
192	0.29
193	0.28
194	0.27
195	0.29
196	0.32
197	0.36
198	0.36
199	0.39
200	0.45
201	0.48
202	0.51
203	0.54
204	0.56
205	0.53
206	0.53
207	0.46
208	0.44
209	0.4
210	0.42
211	0.45
212	0.42
213	0.43
214	0.5
215	0.57
216	0.54
217	0.58
218	0.6
219	0.62
220	0.7
221	0.76
222	0.74
223	0.75
224	0.76
225	0.76
226	0.73
227	0.69
228	0.63
229	0.55
230	0.51
231	0.49
232	0.49
233	0.49
234	0.49
235	0.47
236	0.48
237	0.51
238	0.46
239	0.42
240	0.42
241	0.41
242	0.4
243	0.36
244	0.34
245	0.32
246	0.32
247	0.3
248	0.28
249	0.21
250	0.16
251	0.18
252	0.19
253	0.28
254	0.3
255	0.38
256	0.42
257	0.47
258	0.52
259	0.49
260	0.49
261	0.42
262	0.41
263	0.37
264	0.4
265	0.38
266	0.38
267	0.39
268	0.35
269	0.33
270	0.32
271	0.28
272	0.19
273	0.17
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.11
279	0.12
280	0.12
281	0.15
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.13
287	0.11
288	0.11
289	0.06
290	0.06
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.12
298	0.13
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.17
303	0.26
304	0.34
305	0.4
306	0.46
307	0.46
308	0.53
309	0.58
310	0.57
311	0.49
312	0.47
313	0.47
314	0.49
315	0.52
316	0.46
317	0.42
318	0.44
319	0.46
320	0.42
321	0.34
322	0.29
323	0.31
324	0.31
325	0.32
326	0.29
327	0.25
328	0.22
329	0.24
330	0.27
331	0.24
332	0.24
333	0.27
334	0.25
335	0.27
336	0.28
337	0.25
338	0.21
339	0.23
340	0.21
341	0.21
342	0.23
343	0.24
344	0.28
345	0.29
346	0.29
347	0.27
348	0.35
349	0.4
350	0.47
351	0.52
352	0.53
353	0.55
354	0.59
355	0.62
356	0.6
357	0.57
358	0.56
359	0.51
360	0.5
361	0.49
362	0.44
363	0.4
364	0.35
365	0.31
366	0.27
367	0.28
368	0.3
369	0.33
370	0.37
371	0.44
372	0.51
373	0.59
374	0.64
375	0.65
376	0.7
377	0.71
378	0.73
379	0.73
380	0.72
381	0.65
382	0.65
383	0.63
384	0.63
385	0.62
386	0.59
387	0.56
388	0.56
389	0.61
390	0.62
391	0.68
392	0.69
393	0.73
394	0.79
395	0.85
396	0.85
397	0.85
398	0.85
399	0.84
400	0.82
401	0.78
402	0.75
403	0.73
404	0.74
405	0.68
406	0.68
407	0.67
408	0.59
409	0.6
410	0.63
411	0.6
412	0.54
413	0.57
414	0.51
415	0.49
416	0.53
417	0.48
418	0.41
419	0.43
420	0.48
421	0.48
422	0.5
423	0.44
424	0.45
425	0.44
426	0.42
427	0.35
428	0.29
429	0.23
430	0.17
431	0.17
432	0.14
433	0.13
434	0.1
435	0.11
436	0.1
437	0.14
438	0.15
439	0.16
440	0.17
441	0.18
442	0.19
443	0.2
444	0.27
445	0.26
446	0.27
447	0.31
448	0.3
449	0.34
450	0.36
451	0.34
452	0.27
453	0.25
454	0.23
455	0.2
456	0.2
457	0.14
458	0.11
459	0.11
460	0.13
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.08
465	0.1
466	0.1
467	0.14
468	0.13
469	0.13
470	0.14
471	0.18
472	0.2
473	0.18
474	0.24
475	0.21
476	0.25
477	0.26
478	0.26
479	0.23
480	0.22
481	0.23
482	0.17
483	0.17
484	0.13
485	0.14
486	0.17
487	0.17
488	0.17
489	0.17
490	0.18
491	0.18
492	0.18
493	0.15
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.08
498	0.05
499	0.06
500	0.08
501	0.08
502	0.09
503	0.14
504	0.2
505	0.25
506	0.28
507	0.29
508	0.3
509	0.32
510	0.38
511	0.42
512	0.46
513	0.45
514	0.45
515	0.44
516	0.47
517	0.52
518	0.5
519	0.43
520	0.36
521	0.36
522	0.36
523	0.45
524	0.4
525	0.37
526	0.34
527	0.33
528	0.31
529	0.29
530	0.28
531	0.21
532	0.22
533	0.25
534	0.24
535	0.28
536	0.31
537	0.32
538	0.33
539	0.34
540	0.36
541	0.32
542	0.32
543	0.29
544	0.24
545	0.21
546	0.18
547	0.15
548	0.1
549	0.08
550	0.06
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.08
559	0.1
560	0.12
561	0.12
562	0.16
563	0.18
564	0.24
565	0.28
566	0.28
567	0.29
568	0.32
569	0.35
570	0.37

A0A139IHC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer