Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IVU1

Protein Details
Accession A0A139IVU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-177AKPVAKRKEEPKPQWRDPSAHydrophilic
418-442VDSHYRNELKNKSKKSRKDLEHLITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-275RKSEAAALKHKAKTSPIK
Subcellular Location(s) mito_nucl 13.333, mito 13, nucl 12.5, cyto_mito 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MPPLSRQRYRPLLSIVNGHAHASSDDHEDGIAADKETHRPPRPILAVSPSKLRMRFDRETATPEQPKKQTRQEVIELDDSPVGQKARKTEAEKTYPSPNNTDSRRSSQNEVIMLDEEEDFNASPKASSSDVEEEEAVSAVPSEVKGVSGFRISGVTVAKPVAKRKEEPKPQWRDPSAQEVLPGKKRKMVSDAELEGFSDDEPSWMREEAKKLKNMHTGSKQRKTKANPQVFMPKSSSQQSQYGKEAAMKQKIAEKQFRKSEAAALKHKAKTSPIKKFKMVGALDYGSTSLSQTTISVQTSQTSAGAEAEDPRIDDSPLTEISEDEMEEIDLSGDAPNVKCGHCGAALKRSLLEDFQDEVLRGRELTYKWQKRFCRWHQQQDAEAQWQERGYPEIDWKHLSLRMHAHDSFLEDIVNDQVDSHYRNELKNKSKKSRKDLEHLITGHDTRGGASMGYYGPKGEKLITEHIISRFTNDIRQRSKKDKLVSTSGVQGGVSGFVQVVLAPHLVELLVKEDMDLNGDDWESRAREIISESTQLGELMHPEEEDDKVDDIDTAHVIAVVDEDDYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.52
3 0.48
4 0.45
5 0.39
6 0.32
7 0.27
8 0.24
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.18
18 0.17
19 0.12
20 0.15
21 0.17
22 0.22
23 0.3
24 0.39
25 0.4
26 0.43
27 0.46
28 0.53
29 0.56
30 0.54
31 0.51
32 0.51
33 0.52
34 0.5
35 0.53
36 0.49
37 0.5
38 0.49
39 0.49
40 0.48
41 0.49
42 0.53
43 0.52
44 0.54
45 0.51
46 0.54
47 0.55
48 0.56
49 0.56
50 0.56
51 0.58
52 0.59
53 0.64
54 0.66
55 0.71
56 0.71
57 0.7
58 0.72
59 0.71
60 0.68
61 0.64
62 0.61
63 0.52
64 0.43
65 0.37
66 0.29
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.15
71 0.17
72 0.2
73 0.27
74 0.35
75 0.39
76 0.45
77 0.53
78 0.59
79 0.61
80 0.59
81 0.62
82 0.61
83 0.58
84 0.54
85 0.5
86 0.5
87 0.5
88 0.54
89 0.49
90 0.49
91 0.55
92 0.54
93 0.55
94 0.52
95 0.52
96 0.47
97 0.42
98 0.38
99 0.31
100 0.27
101 0.22
102 0.17
103 0.13
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.08
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.15
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.21
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.12
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.15
146 0.17
147 0.24
148 0.3
149 0.33
150 0.37
151 0.44
152 0.54
153 0.61
154 0.68
155 0.72
156 0.73
157 0.76
158 0.81
159 0.76
160 0.71
161 0.63
162 0.62
163 0.54
164 0.45
165 0.41
166 0.37
167 0.39
168 0.42
169 0.44
170 0.36
171 0.39
172 0.4
173 0.39
174 0.4
175 0.38
176 0.35
177 0.36
178 0.38
179 0.34
180 0.32
181 0.3
182 0.24
183 0.2
184 0.15
185 0.1
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.21
195 0.3
196 0.35
197 0.4
198 0.42
199 0.48
200 0.54
201 0.53
202 0.54
203 0.54
204 0.59
205 0.62
206 0.68
207 0.68
208 0.64
209 0.69
210 0.68
211 0.69
212 0.69
213 0.69
214 0.61
215 0.59
216 0.65
217 0.58
218 0.54
219 0.48
220 0.4
221 0.34
222 0.36
223 0.34
224 0.27
225 0.33
226 0.34
227 0.32
228 0.32
229 0.31
230 0.28
231 0.28
232 0.32
233 0.3
234 0.3
235 0.27
236 0.26
237 0.31
238 0.35
239 0.37
240 0.4
241 0.38
242 0.41
243 0.46
244 0.49
245 0.45
246 0.41
247 0.43
248 0.4
249 0.42
250 0.39
251 0.38
252 0.41
253 0.41
254 0.42
255 0.36
256 0.35
257 0.4
258 0.44
259 0.51
260 0.54
261 0.56
262 0.56
263 0.58
264 0.54
265 0.52
266 0.44
267 0.34
268 0.27
269 0.23
270 0.21
271 0.19
272 0.17
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.03
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.16
331 0.16
332 0.22
333 0.24
334 0.23
335 0.24
336 0.23
337 0.21
338 0.18
339 0.17
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.1
349 0.09
350 0.13
351 0.13
352 0.23
353 0.33
354 0.4
355 0.45
356 0.54
357 0.57
358 0.62
359 0.72
360 0.71
361 0.72
362 0.72
363 0.78
364 0.79
365 0.79
366 0.73
367 0.69
368 0.63
369 0.55
370 0.47
371 0.37
372 0.29
373 0.24
374 0.21
375 0.15
376 0.14
377 0.11
378 0.11
379 0.17
380 0.18
381 0.21
382 0.22
383 0.22
384 0.23
385 0.26
386 0.25
387 0.23
388 0.26
389 0.28
390 0.32
391 0.31
392 0.3
393 0.27
394 0.29
395 0.26
396 0.2
397 0.16
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.09
406 0.11
407 0.12
408 0.17
409 0.19
410 0.23
411 0.31
412 0.39
413 0.47
414 0.54
415 0.63
416 0.67
417 0.75
418 0.81
419 0.83
420 0.84
421 0.81
422 0.81
423 0.81
424 0.76
425 0.74
426 0.65
427 0.59
428 0.52
429 0.46
430 0.37
431 0.28
432 0.22
433 0.15
434 0.16
435 0.13
436 0.09
437 0.08
438 0.1
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.13
446 0.12
447 0.14
448 0.17
449 0.23
450 0.25
451 0.26
452 0.29
453 0.3
454 0.32
455 0.29
456 0.27
457 0.26
458 0.24
459 0.3
460 0.33
461 0.4
462 0.45
463 0.54
464 0.59
465 0.64
466 0.72
467 0.71
468 0.74
469 0.73
470 0.7
471 0.7
472 0.67
473 0.6
474 0.57
475 0.51
476 0.43
477 0.34
478 0.28
479 0.2
480 0.16
481 0.14
482 0.08
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.11
501 0.11
502 0.14
503 0.14
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.11
509 0.15
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.14
514 0.15
515 0.19
516 0.23
517 0.22
518 0.23
519 0.23
520 0.22
521 0.22
522 0.21
523 0.18
524 0.14
525 0.13
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.13
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.14
540 0.13
541 0.11
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.08