Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IJB5

Protein Details
Accession A0A139IJB5    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-33AKSKEKPETLKCEKKEKRSKNARKVEAEEKQFBasic
117-140GAVEAAKPHRKRKRKDAGDELEDABasic
155-177RLAAERAAKKRKQREHERGEDGSBasic
432-458FPPMLPRKLRVSRAKAPKKNGKPGTGRHydrophilic
547-576GLKLGGKGGGKKKKSKVTKRSTSFKSKKKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-24KKEKRSKNAR
123-131KPHRKRKRK
160-168RAAKKRKQR
369-374KRKRGK
434-463PMLPRKLRVSRAKAPKKNGKPGTGRPSARP
535-576EGHRASSKQGKRGLKLGGKGGGKKKKSKVTKRSTSFKSKKKP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKSKEKPETLKCEKKEKRSKNARKVEAEEKQFSLLADDNTVNTSLASLFAVKQPPVKANPPPAAPRPVAKRESDAEEGKEDEENDTELSEVDEDVESDADIDMKDAEEEAAGEQEGAVEAAKPHRKRKRKDAGDELEDAYMGRLAREDEKEADRLAAERAAKKRKQREHERGEDGSDAEEQDDVEKDAADEDNDDEDNAMSPPPKHETEIAADEELSKANRTVFLGNVSTAAISSKSSRKALLNHLASFFEELPPSKNGTKQKVESIRFRSTPYATALPKKAAFAKKELMDATTKSTNAYVVYSTEKLAREAVQHLNGTIILERHLRVDSVAHPAKIDNRRCVFVGNLGFVDDESNIQDANEEEGREKRKRGKEPADIEEGLWRTFSKSGKVESVRVIRDSTTRVGKGIAYVQFEDENAVEQALLLNEKKFPPMLPRKLRVSRAKAPKKNGKPGTGRPSARPSAATGYQRKLTGAEASQMGRTGKLLGRAAAAKVRTSGEFGKENRSGTGDKPPFGNGIKRPEDFIKKSPIIFEGHRASSKQGKRGLKLGGKGGGKKKKSKVTKRSTSFKSKKKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.85
4 0.85
5 0.85
6 0.87
7 0.92
8 0.92
9 0.94
10 0.92
11 0.9
12 0.86
13 0.85
14 0.83
15 0.8
16 0.73
17 0.64
18 0.56
19 0.48
20 0.41
21 0.35
22 0.29
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.16
30 0.12
31 0.12
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.14
38 0.18
39 0.19
40 0.24
41 0.26
42 0.31
43 0.36
44 0.4
45 0.43
46 0.48
47 0.53
48 0.54
49 0.57
50 0.57
51 0.58
52 0.54
53 0.54
54 0.53
55 0.56
56 0.55
57 0.5
58 0.5
59 0.48
60 0.52
61 0.51
62 0.46
63 0.4
64 0.38
65 0.37
66 0.33
67 0.3
68 0.24
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.06
108 0.13
109 0.22
110 0.26
111 0.37
112 0.47
113 0.57
114 0.65
115 0.75
116 0.79
117 0.81
118 0.86
119 0.87
120 0.86
121 0.81
122 0.75
123 0.65
124 0.54
125 0.43
126 0.33
127 0.22
128 0.16
129 0.11
130 0.08
131 0.07
132 0.09
133 0.13
134 0.15
135 0.18
136 0.2
137 0.22
138 0.24
139 0.23
140 0.22
141 0.18
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.21
147 0.28
148 0.37
149 0.42
150 0.5
151 0.59
152 0.64
153 0.72
154 0.77
155 0.8
156 0.81
157 0.85
158 0.83
159 0.74
160 0.67
161 0.58
162 0.47
163 0.37
164 0.27
165 0.18
166 0.12
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.22
197 0.25
198 0.24
199 0.19
200 0.18
201 0.17
202 0.16
203 0.14
204 0.11
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.09
223 0.12
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.21
228 0.25
229 0.32
230 0.38
231 0.38
232 0.36
233 0.36
234 0.34
235 0.32
236 0.29
237 0.22
238 0.14
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.15
244 0.14
245 0.2
246 0.25
247 0.31
248 0.36
249 0.35
250 0.42
251 0.47
252 0.51
253 0.53
254 0.53
255 0.52
256 0.48
257 0.48
258 0.43
259 0.36
260 0.34
261 0.3
262 0.28
263 0.24
264 0.27
265 0.27
266 0.26
267 0.25
268 0.24
269 0.27
270 0.27
271 0.27
272 0.26
273 0.29
274 0.28
275 0.29
276 0.28
277 0.23
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.17
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.16
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.15
306 0.13
307 0.1
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.1
317 0.1
318 0.18
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.19
323 0.26
324 0.33
325 0.36
326 0.35
327 0.35
328 0.37
329 0.37
330 0.37
331 0.3
332 0.28
333 0.25
334 0.18
335 0.16
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.15
353 0.21
354 0.24
355 0.28
356 0.34
357 0.42
358 0.5
359 0.59
360 0.64
361 0.67
362 0.72
363 0.72
364 0.69
365 0.61
366 0.52
367 0.47
368 0.38
369 0.29
370 0.22
371 0.18
372 0.13
373 0.16
374 0.17
375 0.18
376 0.19
377 0.22
378 0.29
379 0.31
380 0.32
381 0.35
382 0.4
383 0.37
384 0.35
385 0.34
386 0.27
387 0.27
388 0.28
389 0.26
390 0.25
391 0.24
392 0.23
393 0.23
394 0.22
395 0.21
396 0.23
397 0.22
398 0.19
399 0.19
400 0.2
401 0.2
402 0.19
403 0.19
404 0.13
405 0.12
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.11
416 0.12
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.23
421 0.33
422 0.42
423 0.49
424 0.54
425 0.62
426 0.69
427 0.77
428 0.76
429 0.74
430 0.74
431 0.76
432 0.81
433 0.79
434 0.82
435 0.84
436 0.83
437 0.85
438 0.83
439 0.8
440 0.78
441 0.8
442 0.79
443 0.77
444 0.71
445 0.65
446 0.66
447 0.61
448 0.54
449 0.45
450 0.39
451 0.36
452 0.4
453 0.42
454 0.4
455 0.41
456 0.43
457 0.43
458 0.4
459 0.35
460 0.3
461 0.27
462 0.23
463 0.22
464 0.21
465 0.21
466 0.21
467 0.23
468 0.22
469 0.17
470 0.16
471 0.17
472 0.16
473 0.21
474 0.22
475 0.2
476 0.23
477 0.25
478 0.26
479 0.27
480 0.26
481 0.21
482 0.22
483 0.23
484 0.2
485 0.23
486 0.24
487 0.24
488 0.3
489 0.31
490 0.37
491 0.38
492 0.38
493 0.36
494 0.36
495 0.33
496 0.29
497 0.38
498 0.34
499 0.33
500 0.33
501 0.33
502 0.34
503 0.35
504 0.4
505 0.35
506 0.41
507 0.46
508 0.45
509 0.48
510 0.51
511 0.58
512 0.56
513 0.55
514 0.55
515 0.52
516 0.53
517 0.51
518 0.46
519 0.41
520 0.37
521 0.4
522 0.37
523 0.38
524 0.4
525 0.39
526 0.41
527 0.46
528 0.5
529 0.49
530 0.52
531 0.54
532 0.55
533 0.6
534 0.65
535 0.62
536 0.61
537 0.59
538 0.58
539 0.56
540 0.6
541 0.64
542 0.64
543 0.65
544 0.69
545 0.73
546 0.75
547 0.81
548 0.84
549 0.85
550 0.87
551 0.9
552 0.9
553 0.91
554 0.89
555 0.9
556 0.89