Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HSX6

Protein Details
Accession A0A139HSX6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-69SPAAPGRCSRLQRRRAQAWRLINIFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 9.5, cyto_mito 6, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019417  DUF2415  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10313  DUF2415  
Amino Acid Sequences MATTVLAVVEECLDDHDADPDPGIFSHHSATATATATATCYCRPSPAAPGRCSRLQRRRAQAWRLINIFRRTSPAGPLSYLYKHPESSADRVCAYRYPETHDLARSEKAFYPVQIPVSHWQLRHYISTPEQDHLYYASGNEIYCLNTATKKRKHVATLPFEARCTASGYGYVCVGGEDEGHFAAIKLDGSGSGPRTRTLHIDSALPLGSFGPGVRRRAPTVKVERIGEEIVNSISIHRIQDEDAHLDDIVAVLTNNDRTVRIYSLPQGHETKCVDLPFAINHATISPDGQLLVAVGDYNQAYFYRREIFDTPPQIPKPHNRLTSSSVRWERLCKVTLHAQPETTVGYFTTAWSPSGSLVAVGSEGGYITVMDTDILNDSACDSENRDEAIVAVVPGSRADFPSPHPGAIRSMMFSPDPWDLLVWAEDQGRICIGDMRTGLKSRQIIPLETKEETLNKITFDDLPLEDSDPALSYPPSVIPHLDDLEADLIRRYRMSPDNASAVNFATEYIEARRAHRAARQELANRTQADPGGLTAREQQILDTLRTSRQREEARAGGQIPRSVNYTTPDIFTSGPRAPSSTLPAAQSDSARPISEILSSVQDSFPELSRTHAASPGSRNASLDALPSLHALQEGVWESAARSGLSRLTESPSRLPRRRQSVILSPPSSNGGASAPPSAPRRDQPSTREEEAGDVNPWSIVEEQMSATARGPLFEGAARAQAAPPVPAPAERERDRRERIADSLQQGLEEGRRIATAQARVRERWSRSRLGGANGVTMADARRLAAFPEGYDALLRRTQMRGYSGREVGVRTAGLAMSPDGRTLWAACEEGIFEIDVRIKGRMFLPSCELR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.13
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.16
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.16
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.15
27 0.18
28 0.18
29 0.21
30 0.25
31 0.27
32 0.35
33 0.43
34 0.5
35 0.51
36 0.58
37 0.6
38 0.64
39 0.69
40 0.69
41 0.69
42 0.71
43 0.75
44 0.78
45 0.82
46 0.84
47 0.86
48 0.84
49 0.83
50 0.81
51 0.76
52 0.73
53 0.7
54 0.67
55 0.62
56 0.54
57 0.51
58 0.48
59 0.44
60 0.44
61 0.41
62 0.36
63 0.34
64 0.35
65 0.33
66 0.32
67 0.34
68 0.33
69 0.31
70 0.3
71 0.29
72 0.35
73 0.35
74 0.39
75 0.42
76 0.39
77 0.38
78 0.38
79 0.39
80 0.36
81 0.36
82 0.35
83 0.3
84 0.35
85 0.39
86 0.42
87 0.44
88 0.44
89 0.42
90 0.38
91 0.42
92 0.35
93 0.33
94 0.32
95 0.33
96 0.31
97 0.28
98 0.29
99 0.27
100 0.3
101 0.27
102 0.27
103 0.27
104 0.34
105 0.36
106 0.33
107 0.32
108 0.34
109 0.35
110 0.37
111 0.34
112 0.32
113 0.32
114 0.4
115 0.39
116 0.37
117 0.36
118 0.31
119 0.3
120 0.25
121 0.23
122 0.15
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.17
134 0.24
135 0.33
136 0.4
137 0.47
138 0.53
139 0.58
140 0.63
141 0.66
142 0.69
143 0.67
144 0.69
145 0.67
146 0.62
147 0.57
148 0.51
149 0.43
150 0.34
151 0.29
152 0.21
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.11
178 0.13
179 0.16
180 0.17
181 0.19
182 0.21
183 0.22
184 0.25
185 0.27
186 0.3
187 0.26
188 0.28
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.21
193 0.16
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.14
199 0.18
200 0.22
201 0.27
202 0.29
203 0.34
204 0.4
205 0.44
206 0.45
207 0.5
208 0.54
209 0.54
210 0.52
211 0.49
212 0.46
213 0.43
214 0.34
215 0.24
216 0.18
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.14
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.1
236 0.08
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.17
250 0.21
251 0.27
252 0.28
253 0.31
254 0.33
255 0.31
256 0.35
257 0.34
258 0.31
259 0.27
260 0.26
261 0.22
262 0.18
263 0.19
264 0.14
265 0.15
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.08
289 0.08
290 0.11
291 0.15
292 0.15
293 0.19
294 0.21
295 0.26
296 0.31
297 0.35
298 0.36
299 0.37
300 0.38
301 0.36
302 0.38
303 0.41
304 0.43
305 0.46
306 0.49
307 0.46
308 0.48
309 0.52
310 0.57
311 0.51
312 0.52
313 0.47
314 0.44
315 0.43
316 0.43
317 0.41
318 0.36
319 0.36
320 0.28
321 0.27
322 0.33
323 0.36
324 0.37
325 0.34
326 0.3
327 0.28
328 0.28
329 0.26
330 0.17
331 0.13
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.1
389 0.18
390 0.19
391 0.19
392 0.19
393 0.19
394 0.2
395 0.21
396 0.19
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.08
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.12
424 0.14
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.17
429 0.17
430 0.23
431 0.23
432 0.23
433 0.25
434 0.3
435 0.29
436 0.28
437 0.26
438 0.21
439 0.21
440 0.21
441 0.2
442 0.16
443 0.13
444 0.13
445 0.13
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.11
468 0.12
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.12
481 0.17
482 0.21
483 0.24
484 0.26
485 0.29
486 0.29
487 0.29
488 0.24
489 0.2
490 0.15
491 0.12
492 0.09
493 0.07
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.13
498 0.13
499 0.15
500 0.2
501 0.2
502 0.22
503 0.25
504 0.3
505 0.28
506 0.32
507 0.35
508 0.36
509 0.39
510 0.41
511 0.42
512 0.37
513 0.35
514 0.32
515 0.27
516 0.22
517 0.18
518 0.15
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.13
523 0.14
524 0.15
525 0.14
526 0.13
527 0.15
528 0.17
529 0.17
530 0.15
531 0.15
532 0.19
533 0.25
534 0.27
535 0.25
536 0.31
537 0.35
538 0.37
539 0.41
540 0.39
541 0.35
542 0.35
543 0.34
544 0.3
545 0.27
546 0.27
547 0.22
548 0.2
549 0.2
550 0.19
551 0.19
552 0.18
553 0.2
554 0.18
555 0.18
556 0.18
557 0.17
558 0.17
559 0.16
560 0.19
561 0.17
562 0.19
563 0.18
564 0.19
565 0.19
566 0.2
567 0.25
568 0.23
569 0.22
570 0.21
571 0.22
572 0.22
573 0.22
574 0.21
575 0.17
576 0.17
577 0.16
578 0.15
579 0.15
580 0.14
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.1
585 0.12
586 0.12
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.13
595 0.14
596 0.17
597 0.19
598 0.18
599 0.21
600 0.21
601 0.22
602 0.26
603 0.29
604 0.3
605 0.29
606 0.28
607 0.26
608 0.26
609 0.23
610 0.2
611 0.14
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.1
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.06
620 0.09
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.12
627 0.13
628 0.1
629 0.08
630 0.09
631 0.12
632 0.13
633 0.15
634 0.14
635 0.18
636 0.22
637 0.24
638 0.3
639 0.37
640 0.46
641 0.51
642 0.58
643 0.62
644 0.68
645 0.7
646 0.67
647 0.64
648 0.64
649 0.67
650 0.67
651 0.62
652 0.53
653 0.49
654 0.47
655 0.4
656 0.3
657 0.21
658 0.14
659 0.12
660 0.13
661 0.14
662 0.12
663 0.17
664 0.2
665 0.23
666 0.25
667 0.29
668 0.36
669 0.4
670 0.46
671 0.47
672 0.52
673 0.56
674 0.55
675 0.52
676 0.44
677 0.4
678 0.37
679 0.33
680 0.26
681 0.19
682 0.16
683 0.14
684 0.13
685 0.12
686 0.1
687 0.08
688 0.08
689 0.09
690 0.09
691 0.12
692 0.14
693 0.13
694 0.13
695 0.17
696 0.16
697 0.15
698 0.16
699 0.13
700 0.13
701 0.13
702 0.15
703 0.11
704 0.14
705 0.14
706 0.13
707 0.13
708 0.14
709 0.14
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.15
715 0.2
716 0.24
717 0.32
718 0.36
719 0.44
720 0.48
721 0.57
722 0.62
723 0.63
724 0.62
725 0.57
726 0.57
727 0.57
728 0.57
729 0.51
730 0.5
731 0.43
732 0.38
733 0.34
734 0.3
735 0.24
736 0.19
737 0.17
738 0.12
739 0.12
740 0.13
741 0.16
742 0.2
743 0.26
744 0.3
745 0.38
746 0.42
747 0.43
748 0.5
749 0.55
750 0.56
751 0.58
752 0.58
753 0.58
754 0.56
755 0.63
756 0.6
757 0.57
758 0.57
759 0.47
760 0.43
761 0.35
762 0.33
763 0.23
764 0.2
765 0.16
766 0.12
767 0.11
768 0.09
769 0.11
770 0.11
771 0.12
772 0.17
773 0.16
774 0.14
775 0.19
776 0.19
777 0.18
778 0.19
779 0.19
780 0.18
781 0.2
782 0.2
783 0.18
784 0.2
785 0.24
786 0.26
787 0.32
788 0.34
789 0.39
790 0.45
791 0.44
792 0.44
793 0.42
794 0.4
795 0.35
796 0.32
797 0.25
798 0.18
799 0.17
800 0.15
801 0.13
802 0.12
803 0.12
804 0.13
805 0.13
806 0.13
807 0.12
808 0.13
809 0.14
810 0.14
811 0.16
812 0.15
813 0.15
814 0.15
815 0.15
816 0.15
817 0.15
818 0.14
819 0.12
820 0.09
821 0.1
822 0.14
823 0.16
824 0.16
825 0.18
826 0.17
827 0.2
828 0.22
829 0.29
830 0.28
831 0.3