Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139I9F8

Protein Details
Accession A0A139I9F8    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23SVDSKGKKRKSGDNTAQPAKKVHydrophilic
50-73PIVTEKPKDKKTKAEPKLKKIVEKBasic
270-290GWEKRITREEQRRQSKQEKLKBasic
361-381DKTTKRKTKAGGEKVTMKKQKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-12GKKRKS
35-71RPAPPKSVLKKSKVEPIVTEKPKDKKTKAEPKLKKIV
241-282KGPKGVKNGKVRPRNRIEGSKLRKGADREGWEKRITREEQRR
365-384KRKTKAGGEKVTMKKQKTKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSVDSKGKKRKSGDNTAQPAKKVKTTTTTVKSADRPAPPKSVLKKSKVEPIVTEKPKDKKTKAEPKLKKIVEKIKEVEPVVSDVDEEEGGGAELTADQTADLLAGFSSDESGDEDGDEGVDVATLPAAPTTGGVQTAVTKASKQKSDDAESTPGVVYISRLPHGFFEKQLRAYFSQFGTITHLRLARNRKTGKSKHYAFIEFEAASVADIVAKTMDKYLLFGHILQCKRISPEQVKDEMWKGPKGVKNGKVRPRNRIEGSKLRKGADREGWEKRITREEQRRQSKQEKLKELGYDFEMPAVKSVDAISKQKAVKSANAGAGAEQEDGGVKLIEEHEKEPVLEETVVGTIKSGPKAVAVVEDKTTKRKTKAGGEKVTMKKQKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.82
3 0.84
4 0.81
5 0.74
6 0.73
7 0.65
8 0.61
9 0.53
10 0.49
11 0.47
12 0.49
13 0.56
14 0.54
15 0.57
16 0.54
17 0.57
18 0.57
19 0.57
20 0.57
21 0.56
22 0.54
23 0.52
24 0.56
25 0.53
26 0.58
27 0.59
28 0.62
29 0.62
30 0.65
31 0.68
32 0.65
33 0.71
34 0.68
35 0.63
36 0.57
37 0.57
38 0.61
39 0.58
40 0.6
41 0.57
42 0.6
43 0.66
44 0.7
45 0.65
46 0.65
47 0.7
48 0.76
49 0.79
50 0.82
51 0.83
52 0.82
53 0.89
54 0.83
55 0.79
56 0.77
57 0.77
58 0.72
59 0.7
60 0.64
61 0.59
62 0.61
63 0.54
64 0.46
65 0.38
66 0.33
67 0.26
68 0.23
69 0.17
70 0.11
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.03
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.1
127 0.15
128 0.2
129 0.24
130 0.25
131 0.31
132 0.34
133 0.39
134 0.41
135 0.38
136 0.37
137 0.33
138 0.32
139 0.25
140 0.2
141 0.15
142 0.12
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.13
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.22
154 0.24
155 0.27
156 0.28
157 0.29
158 0.27
159 0.28
160 0.28
161 0.22
162 0.22
163 0.19
164 0.18
165 0.21
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.2
170 0.18
171 0.23
172 0.3
173 0.3
174 0.38
175 0.41
176 0.45
177 0.52
178 0.57
179 0.6
180 0.61
181 0.58
182 0.55
183 0.55
184 0.52
185 0.44
186 0.39
187 0.34
188 0.25
189 0.21
190 0.16
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.06
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.19
215 0.22
216 0.24
217 0.27
218 0.26
219 0.33
220 0.36
221 0.39
222 0.39
223 0.38
224 0.38
225 0.36
226 0.33
227 0.27
228 0.23
229 0.27
230 0.29
231 0.34
232 0.4
233 0.43
234 0.51
235 0.59
236 0.67
237 0.7
238 0.71
239 0.74
240 0.73
241 0.73
242 0.69
243 0.67
244 0.66
245 0.66
246 0.69
247 0.68
248 0.64
249 0.57
250 0.57
251 0.52
252 0.51
253 0.48
254 0.47
255 0.45
256 0.48
257 0.5
258 0.49
259 0.49
260 0.45
261 0.45
262 0.43
263 0.47
264 0.51
265 0.58
266 0.65
267 0.72
268 0.77
269 0.76
270 0.81
271 0.8
272 0.79
273 0.78
274 0.76
275 0.69
276 0.67
277 0.63
278 0.56
279 0.49
280 0.43
281 0.36
282 0.28
283 0.27
284 0.24
285 0.19
286 0.2
287 0.19
288 0.15
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.18
293 0.21
294 0.22
295 0.28
296 0.29
297 0.31
298 0.36
299 0.33
300 0.34
301 0.38
302 0.41
303 0.38
304 0.38
305 0.36
306 0.3
307 0.3
308 0.26
309 0.19
310 0.14
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.1
319 0.14
320 0.16
321 0.17
322 0.19
323 0.2
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.19
328 0.17
329 0.16
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.12
334 0.11
335 0.12
336 0.16
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.22
344 0.21
345 0.22
346 0.25
347 0.31
348 0.32
349 0.39
350 0.47
351 0.46
352 0.48
353 0.53
354 0.56
355 0.61
356 0.7
357 0.73
358 0.74
359 0.73
360 0.78
361 0.8
362 0.83
363 0.8
364 0.75