Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IH43

Protein Details
Accession A0A139IH43    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MKGKRSKQYRKLMQHYQLNFNFHydrophilic
206-250QEMPKPKKYKVKGPKGPNPLSVKKSKKDNKTDKKQDERPKAVVRKBasic
269-297EGAGAEGQKKKRKRMRKPKEPKVAITNEQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-252PKPKKYKVKGPKGPNPLSVKKSKKDNKTDKKQDERPKAVVRKSK
275-290GQKKKRKRMRKPKEPK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MKGKRSKQYRKLMQHYQLNFNFRQPYQVILDADIIKDAARFKMQLGQMLQNTLHGQIKPMITQCCIRHLYNEPASPDKDAWISVAKDAERRRCGHHELEEPLSALECIESVVDSKGTGNNKHRYIVAVQDHEVRRKMRKVVGVPLVYIARSVMILEPMANATQEVREKDENAKIRAGLNGRRPTSTGEKRKRDDEEDDDEKENETQEMPKPKKYKVKGPKGPNPLSVKKSKKDNKTDKKQDERPKAVVRKSKQESHAGDQPAVTPEAAEGAGAEGQKKKRKRMRKPKEPKVAITNEQESRSED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.82
3 0.81
4 0.76
5 0.71
6 0.63
7 0.59
8 0.55
9 0.46
10 0.47
11 0.37
12 0.35
13 0.34
14 0.37
15 0.33
16 0.28
17 0.32
18 0.27
19 0.26
20 0.22
21 0.18
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.22
30 0.23
31 0.27
32 0.29
33 0.33
34 0.32
35 0.34
36 0.33
37 0.28
38 0.27
39 0.24
40 0.24
41 0.18
42 0.19
43 0.2
44 0.22
45 0.22
46 0.26
47 0.25
48 0.23
49 0.3
50 0.29
51 0.32
52 0.35
53 0.32
54 0.32
55 0.36
56 0.43
57 0.43
58 0.45
59 0.41
60 0.41
61 0.42
62 0.39
63 0.34
64 0.27
65 0.21
66 0.18
67 0.16
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.18
72 0.17
73 0.22
74 0.28
75 0.34
76 0.35
77 0.37
78 0.42
79 0.44
80 0.49
81 0.49
82 0.5
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.4
87 0.35
88 0.3
89 0.24
90 0.17
91 0.12
92 0.08
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.1
103 0.13
104 0.18
105 0.25
106 0.31
107 0.33
108 0.34
109 0.34
110 0.32
111 0.3
112 0.32
113 0.29
114 0.24
115 0.24
116 0.29
117 0.31
118 0.31
119 0.34
120 0.29
121 0.29
122 0.31
123 0.34
124 0.32
125 0.36
126 0.36
127 0.4
128 0.44
129 0.4
130 0.36
131 0.33
132 0.29
133 0.23
134 0.2
135 0.13
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.06
150 0.09
151 0.09
152 0.12
153 0.13
154 0.15
155 0.19
156 0.25
157 0.27
158 0.27
159 0.27
160 0.24
161 0.24
162 0.26
163 0.26
164 0.26
165 0.3
166 0.35
167 0.35
168 0.35
169 0.35
170 0.36
171 0.42
172 0.47
173 0.49
174 0.52
175 0.59
176 0.62
177 0.67
178 0.67
179 0.62
180 0.58
181 0.53
182 0.51
183 0.47
184 0.47
185 0.43
186 0.39
187 0.35
188 0.29
189 0.24
190 0.16
191 0.12
192 0.12
193 0.16
194 0.26
195 0.28
196 0.34
197 0.38
198 0.44
199 0.53
200 0.55
201 0.61
202 0.62
203 0.7
204 0.72
205 0.79
206 0.81
207 0.82
208 0.81
209 0.78
210 0.75
211 0.71
212 0.67
213 0.67
214 0.65
215 0.6
216 0.67
217 0.68
218 0.7
219 0.74
220 0.8
221 0.81
222 0.85
223 0.91
224 0.9
225 0.92
226 0.92
227 0.91
228 0.9
229 0.86
230 0.83
231 0.82
232 0.8
233 0.78
234 0.77
235 0.72
236 0.72
237 0.72
238 0.72
239 0.67
240 0.68
241 0.66
242 0.63
243 0.65
244 0.57
245 0.51
246 0.44
247 0.41
248 0.34
249 0.29
250 0.21
251 0.14
252 0.11
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.06
257 0.06
258 0.09
259 0.09
260 0.12
261 0.16
262 0.24
263 0.33
264 0.4
265 0.49
266 0.57
267 0.68
268 0.77
269 0.83
270 0.87
271 0.9
272 0.95
273 0.95
274 0.96
275 0.93
276 0.89
277 0.87
278 0.84
279 0.79
280 0.75
281 0.72
282 0.66
283 0.61