Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139I1U3

Protein Details
Accession A0A139I1U3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-42DSQARLFQNKRRKRRITLINKAHELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-31RRKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
Amino Acid Sequences MKILQLRYGLGQRRAVDDSQARLFQNKRRKRRITLINKAHELATKCEAQVYVLIRYSSLDHPSWPPSPRDISTSHPLPIQLTACDLSEPVHEEPEGVRTCIETSKLLLSVPSPQSDSAFTIPGAKQYCWEDTYAFEHEPLCDPAVVEVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.39
4 0.36
5 0.36
6 0.35
7 0.37
8 0.33
9 0.35
10 0.39
11 0.41
12 0.48
13 0.52
14 0.59
15 0.66
16 0.73
17 0.76
18 0.82
19 0.85
20 0.85
21 0.86
22 0.85
23 0.82
24 0.77
25 0.69
26 0.6
27 0.53
28 0.44
29 0.37
30 0.3
31 0.23
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.16
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.2
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.21
54 0.25
55 0.24
56 0.25
57 0.23
58 0.25
59 0.28
60 0.29
61 0.26
62 0.23
63 0.23
64 0.2
65 0.2
66 0.15
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.16
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.22
104 0.17
105 0.16
106 0.15
107 0.18
108 0.18
109 0.23
110 0.24
111 0.21
112 0.23
113 0.25
114 0.29
115 0.25
116 0.26
117 0.21
118 0.21
119 0.26
120 0.26
121 0.24
122 0.21
123 0.21
124 0.21
125 0.24
126 0.23
127 0.2
128 0.16
129 0.16