FuNGI

A0A139IA33

Protein Details

Accession

A0A139IA33

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
141-168	SSTSKDLLRMRNDKRRKPSLNKEDPINI	Hydrophilic
717-749	SNKEKEERIARRQRRLEKKRRKHKEQSMEDSDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
720-740	EKEERIARRQRRLEKKRRKHK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSQRPGEKVVHQDYIARIRYSNALPPPPNPPKLLDIPGTGLAGGQYTSAGYASRLARDQPLNIEADAELGMPIDLIGIPGIFDGDERAIMARSGPQTLHPTDKKLLTPLNSLGKPNAALGQVSFLRRTEYTSSQQTQHFSSSTSKDLLRMRNDKRRKPSLNKEDPINIMRHIVKGFDIAYPRDAYKGEDNVSNLRGAQVTDAELKAWSNPKHPTNSDLKLLDSYPVLPDLDAIPSLGFYMVMKFQSNPVPAGNTYDERIDTAIVRPVPDEQAGEEFQERLREWQESGSTKAEPIREYDYDYYLPEDPAAVHGLKRKLNVNDPENDDPALYTDDNGEGQPAFRYKRLRTYETYNQHGDSKNMYNDSVALALHDPETDVGVTPGAVQRLQKGAYFYPIIQRTAVRPKRPVMGRRAFDEEQKIDQINVMVGEPSEGVQAAQMEKRAERRQGALTTETLKLFVPYIELGEVQFASNTEVHMEQVCPRRNELARAVHHNTAHHTTPHHATAQHSDQKWLGSNTTTTNRVPGSTRLLDRKMPCFKGLAVSIHTPDGPIAEHSIQKQTRANRISAYIPVPPAKVPPGGGKPEQSTFAISITLLTPGLNVPYSTPKATPEDPYPRPRIVGGLPGYGSERGKYQGSVPPYIPRTTNPNETIAAYIYFDGRAKEEVATLLRRGEETWVNSRWVSVPESEGGGLAEREFLFREVGLERWLNGLDLQGSNKEKEERIARRQRRLEKKRRKHKEQSMEDSDDDAGREPKTPARNGVLRYGGEDGSPVEDLAAEDGLFSSDSDSEDEPPQPEAAGQIKVALFRVLASGEIKRGEYSPQFDAHDDGMEGGGDGGDDDVDHTTSFAKPKTLDPKTISTQTVTGLDPPESPYAVFTFFYRGEKQLKKMGIINDPETPKTQQSSRRKSSGPDFSKFGPLKSEGTIGFSGYRDPANGKRKANAKDKDTDAMDSDADDEDEQRLFDGDDEGDVKQENGNFYLSPEDAKRTNEVAEGVQKIKLKRQHSAEPLSESSATRKSPHLKNEDSPSAGTPQSVNSVAANAGTPPEGLTPLPSEASEAFASPFKRQRASLPGVSGSLFTSEAGFLPSSSLSNPASKPDDSQRAASTPDIKAAPAAKQEESDEEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.49
3	0.41
4	0.35
5	0.33
6	0.38
7	0.37
8	0.39
9	0.38
10	0.42
11	0.43
12	0.45
13	0.54
14	0.57
15	0.58
16	0.53
17	0.49
18	0.47
19	0.5
20	0.53
21	0.46
22	0.39
23	0.39
24	0.38
25	0.35
26	0.28
27	0.22
28	0.16
29	0.14
30	0.11
31	0.07
32	0.06
33	0.05
34	0.06
35	0.06
36	0.07
37	0.07
38	0.12
39	0.14
40	0.18
41	0.2
42	0.21
43	0.28
44	0.31
45	0.33
46	0.32
47	0.33
48	0.32
49	0.3
50	0.29
51	0.22
52	0.2
53	0.17
54	0.12
55	0.09
56	0.07
57	0.07
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.04
62	0.04
63	0.05
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.05
68	0.04
69	0.04
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.1
78	0.14
79	0.15
80	0.17
81	0.17
82	0.21
83	0.26
84	0.3
85	0.39
86	0.36
87	0.4
88	0.43
89	0.47
90	0.45
91	0.44
92	0.47
93	0.41
94	0.43
95	0.44
96	0.48
97	0.46
98	0.46
99	0.41
100	0.38
101	0.34
102	0.31
103	0.28
104	0.19
105	0.17
106	0.16
107	0.2
108	0.21
109	0.22
110	0.22
111	0.19
112	0.22
113	0.22
114	0.26
115	0.27
116	0.29
117	0.34
118	0.41
119	0.45
120	0.46
121	0.49
122	0.47
123	0.44
124	0.41
125	0.35
126	0.29
127	0.31
128	0.3
129	0.3
130	0.3
131	0.28
132	0.31
133	0.37
134	0.41
135	0.45
136	0.51
137	0.57
138	0.64
139	0.74
140	0.78
141	0.81
142	0.84
143	0.85
144	0.86
145	0.88
146	0.89
147	0.89
148	0.85
149	0.8
150	0.75
151	0.7
152	0.63
153	0.53
154	0.43
155	0.37
156	0.34
157	0.31
158	0.26
159	0.22
160	0.19
161	0.19
162	0.19
163	0.17
164	0.19
165	0.18
166	0.21
167	0.22
168	0.22
169	0.22
170	0.21
171	0.21
172	0.24
173	0.27
174	0.26
175	0.27
176	0.29
177	0.31
178	0.31
179	0.28
180	0.22
181	0.19
182	0.17
183	0.14
184	0.13
185	0.11
186	0.12
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.13
191	0.13
192	0.16
193	0.22
194	0.22
195	0.24
196	0.32
197	0.37
198	0.44
199	0.45
200	0.47
201	0.48
202	0.5
203	0.51
204	0.45
205	0.41
206	0.36
207	0.35
208	0.3
209	0.22
210	0.19
211	0.14
212	0.14
213	0.13
214	0.1
215	0.11
216	0.1
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.05
226	0.07
227	0.09
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.15
232	0.21
233	0.22
234	0.21
235	0.2
236	0.22
237	0.21
238	0.26
239	0.26
240	0.21
241	0.21
242	0.21
243	0.2
244	0.18
245	0.18
246	0.14
247	0.12
248	0.12
249	0.16
250	0.15
251	0.16
252	0.16
253	0.17
254	0.18
255	0.18
256	0.16
257	0.12
258	0.15
259	0.15
260	0.16
261	0.15
262	0.14
263	0.14
264	0.17
265	0.17
266	0.16
267	0.18
268	0.18
269	0.18
270	0.21
271	0.25
272	0.24
273	0.27
274	0.26
275	0.24
276	0.24
277	0.27
278	0.26
279	0.21
280	0.22
281	0.24
282	0.22
283	0.27
284	0.27
285	0.27
286	0.25
287	0.25
288	0.24
289	0.2
290	0.19
291	0.14
292	0.13
293	0.1
294	0.11
295	0.13
296	0.1
297	0.11
298	0.17
299	0.21
300	0.23
301	0.26
302	0.31
303	0.32
304	0.4
305	0.46
306	0.45
307	0.46
308	0.5
309	0.51
310	0.46
311	0.42
312	0.34
313	0.26
314	0.23
315	0.2
316	0.13
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.11
321	0.11
322	0.1
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.12
327	0.13
328	0.17
329	0.23
330	0.25
331	0.35
332	0.41
333	0.44
334	0.44
335	0.51
336	0.57
337	0.57
338	0.61
339	0.53
340	0.48
341	0.47
342	0.44
343	0.37
344	0.32
345	0.29
346	0.27
347	0.26
348	0.25
349	0.2
350	0.19
351	0.19
352	0.15
353	0.1
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.1
373	0.13
374	0.14
375	0.15
376	0.16
377	0.16
378	0.18
379	0.19
380	0.18
381	0.23
382	0.24
383	0.24
384	0.22
385	0.22
386	0.23
387	0.33
388	0.39
389	0.36
390	0.38
391	0.4
392	0.47
393	0.53
394	0.55
395	0.54
396	0.56
397	0.54
398	0.53
399	0.59
400	0.51
401	0.48
402	0.46
403	0.39
404	0.32
405	0.31
406	0.28
407	0.2
408	0.2
409	0.17
410	0.12
411	0.1
412	0.08
413	0.06
414	0.05
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.06
424	0.07
425	0.09
426	0.1
427	0.12
428	0.19
429	0.22
430	0.26
431	0.26
432	0.28
433	0.31
434	0.33
435	0.34
436	0.29
437	0.27
438	0.26
439	0.26
440	0.22
441	0.18
442	0.15
443	0.13
444	0.11
445	0.1
446	0.08
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.12
466	0.2
467	0.25
468	0.25
469	0.26
470	0.31
471	0.31
472	0.35
473	0.36
474	0.35
475	0.34
476	0.4
477	0.43
478	0.4
479	0.4
480	0.37
481	0.34
482	0.29
483	0.28
484	0.22
485	0.19
486	0.19
487	0.2
488	0.21
489	0.2
490	0.17
491	0.17
492	0.21
493	0.27
494	0.3
495	0.28
496	0.28
497	0.27
498	0.27
499	0.27
500	0.23
501	0.17
502	0.12
503	0.13
504	0.15
505	0.17
506	0.19
507	0.16
508	0.18
509	0.17
510	0.18
511	0.18
512	0.17
513	0.2
514	0.21
515	0.24
516	0.25
517	0.27
518	0.31
519	0.32
520	0.37
521	0.38
522	0.36
523	0.34
524	0.31
525	0.29
526	0.27
527	0.27
528	0.21
529	0.16
530	0.16
531	0.16
532	0.16
533	0.15
534	0.12
535	0.1
536	0.08
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.09
542	0.1
543	0.17
544	0.17
545	0.2
546	0.23
547	0.25
548	0.32
549	0.33
550	0.33
551	0.27
552	0.29
553	0.28
554	0.26
555	0.24
556	0.17
557	0.16
558	0.17
559	0.16
560	0.14
561	0.14
562	0.13
563	0.12
564	0.11
565	0.14
566	0.17
567	0.2
568	0.21
569	0.22
570	0.22
571	0.23
572	0.23
573	0.2
574	0.17
575	0.13
576	0.13
577	0.11
578	0.09
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.06
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.1
591	0.12
592	0.13
593	0.13
594	0.15
595	0.18
596	0.2
597	0.22
598	0.24
599	0.31
600	0.34
601	0.4
602	0.42
603	0.39
604	0.38
605	0.35
606	0.31
607	0.24
608	0.25
609	0.21
610	0.18
611	0.17
612	0.17
613	0.18
614	0.17
615	0.16
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.11
621	0.13
622	0.15
623	0.18
624	0.2
625	0.2
626	0.23
627	0.25
628	0.26
629	0.24
630	0.21
631	0.25
632	0.27
633	0.33
634	0.29
635	0.29
636	0.29
637	0.28
638	0.28
639	0.21
640	0.18
641	0.11
642	0.1
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.1
653	0.11
654	0.12
655	0.12
656	0.12
657	0.11
658	0.11
659	0.11
660	0.13
661	0.14
662	0.16
663	0.2
664	0.21
665	0.22
666	0.22
667	0.22
668	0.21
669	0.19
670	0.18
671	0.13
672	0.13
673	0.12
674	0.13
675	0.12
676	0.11
677	0.09
678	0.08
679	0.07
680	0.06
681	0.07
682	0.06
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.09
689	0.08
690	0.09
691	0.11
692	0.11
693	0.1
694	0.11
695	0.11
696	0.1
697	0.09
698	0.09
699	0.08
700	0.08
701	0.09
702	0.12
703	0.14
704	0.14
705	0.16
706	0.18
707	0.17
708	0.2
709	0.29
710	0.32
711	0.41
712	0.51
713	0.56
714	0.64
715	0.72
716	0.78
717	0.8
718	0.84
719	0.85
720	0.86
721	0.89
722	0.91
723	0.93
724	0.93
725	0.93
726	0.92
727	0.92
728	0.9
729	0.89
730	0.85
731	0.78
732	0.68
733	0.59
734	0.49
735	0.38
736	0.28
737	0.2
738	0.14
739	0.11
740	0.12
741	0.12
742	0.17
743	0.22
744	0.24
745	0.26
746	0.3
747	0.34
748	0.34
749	0.38
750	0.36
751	0.31
752	0.31
753	0.3
754	0.24
755	0.19
756	0.17
757	0.12
758	0.1
759	0.1
760	0.08
761	0.06
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.08
776	0.09
777	0.11
778	0.13
779	0.15
780	0.15
781	0.15
782	0.15
783	0.13
784	0.12
785	0.12
786	0.13
787	0.13
788	0.12
789	0.13
790	0.14
791	0.14
792	0.15
793	0.12
794	0.09
795	0.08
796	0.09
797	0.07
798	0.08
799	0.09
800	0.09
801	0.11
802	0.12
803	0.12
804	0.12
805	0.13
806	0.16
807	0.18
808	0.21
809	0.21
810	0.23
811	0.24
812	0.24
813	0.25
814	0.22
815	0.19
816	0.15
817	0.13
818	0.1
819	0.08
820	0.07
821	0.05
822	0.04
823	0.03
824	0.03
825	0.03
826	0.03
827	0.03
828	0.03
829	0.04
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.07
834	0.09
835	0.12
836	0.13
837	0.15
838	0.16
839	0.24
840	0.34
841	0.37
842	0.41
843	0.43
844	0.48
845	0.5
846	0.54
847	0.48
848	0.39
849	0.36
850	0.31
851	0.29
852	0.23
853	0.2
854	0.17
855	0.17
856	0.16
857	0.18
858	0.17
859	0.15
860	0.15
861	0.14
862	0.13
863	0.14
864	0.14
865	0.11
866	0.14
867	0.16
868	0.19
869	0.21
870	0.23
871	0.31
872	0.35
873	0.38
874	0.41
875	0.41
876	0.4
877	0.43
878	0.44
879	0.43
880	0.43
881	0.41
882	0.41
883	0.41
884	0.4
885	0.38
886	0.35
887	0.31
888	0.3
889	0.33
890	0.37
891	0.46
892	0.55
893	0.59
894	0.63
895	0.62
896	0.64
897	0.67
898	0.68
899	0.64
900	0.57
901	0.54
902	0.49
903	0.57
904	0.52
905	0.44
906	0.37
907	0.33
908	0.32
909	0.3
910	0.31
911	0.21
912	0.25
913	0.24
914	0.2
915	0.19
916	0.17
917	0.17
918	0.15
919	0.16
920	0.12
921	0.16
922	0.24
923	0.31
924	0.39
925	0.4
926	0.44
927	0.52
928	0.6
929	0.66
930	0.65
931	0.61
932	0.62
933	0.63
934	0.63
935	0.57
936	0.5
937	0.42
938	0.36
939	0.3
940	0.22
941	0.2
942	0.14
943	0.13
944	0.11
945	0.1
946	0.09
947	0.1
948	0.09
949	0.08
950	0.09
951	0.08
952	0.09
953	0.1
954	0.08
955	0.09
956	0.11
957	0.11
958	0.11
959	0.11
960	0.11
961	0.11
962	0.14
963	0.14
964	0.14
965	0.15
966	0.14
967	0.15
968	0.18
969	0.16
970	0.17
971	0.17
972	0.2
973	0.21
974	0.24
975	0.27
976	0.25
977	0.26
978	0.25
979	0.25
980	0.23
981	0.27
982	0.28
983	0.26
984	0.28
985	0.31
986	0.31
987	0.37
988	0.41
989	0.4
990	0.44
991	0.5
992	0.56
993	0.6
994	0.66
995	0.63
996	0.61
997	0.58
998	0.54
999	0.48
1000	0.4
1001	0.36
1002	0.33
1003	0.31
1004	0.27
1005	0.33
1006	0.38
1007	0.44
1008	0.53
1009	0.57
1010	0.58
1011	0.63
1012	0.69
1013	0.68
1014	0.62
1015	0.56
1016	0.49
1017	0.44
1018	0.38
1019	0.32
1020	0.23
1021	0.19
1022	0.2
1023	0.2
1024	0.19
1025	0.15
1026	0.16
1027	0.15
1028	0.15
1029	0.14
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.09
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.12
1039	0.14
1040	0.15
1041	0.16
1042	0.15
1043	0.16
1044	0.15
1045	0.19
1046	0.17
1047	0.15
1048	0.15
1049	0.18
1050	0.2
1051	0.24
1052	0.31
1053	0.32
1054	0.36
1055	0.37
1056	0.42
1057	0.48
1058	0.53
1059	0.52
1060	0.5
1061	0.47
1062	0.44
1063	0.43
1064	0.37
1065	0.28
1066	0.22
1067	0.17
1068	0.12
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.12
1073	0.11
1074	0.1
1075	0.11
1076	0.12
1077	0.12
1078	0.12
1079	0.16
1080	0.15
1081	0.21
1082	0.22
1083	0.26
1084	0.3
1085	0.3
1086	0.35
1087	0.4
1088	0.48
1089	0.45
1090	0.49
1091	0.46
1092	0.44
1093	0.45
1094	0.45
1095	0.42
1096	0.33
1097	0.36
1098	0.32
1099	0.28
1100	0.3
1101	0.3
1102	0.3
1103	0.31
1104	0.34
1105	0.3
1106	0.31
1107	0.33

A0A139IA33

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer