Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IID2

Protein Details
Accession A0A139IID2    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-167LPSSALDKKKRTKKADGTSAGHydrophilic
391-417GLTPPMHWARKRRFRKRLNYNENMNIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-180KKKRTKKADGTSAGAGAGAGRGKKRAA
191-214PKRVASGAAPPPPGPARKISLKPP
221-239RPSAPKISIQTRKKSQPKL
243-246RARG
400-406RKRRFRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 10, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MQATVTCSTTRAVPHDPCPCPCPSLSVPVPIHDTAAGTATATATATATLSYSSTTHASAFGVVGGSRCVSPSSPYCTGAVNMLKLKLGRQNSQAFHDGQNQSAQQHAAPSPASSAAPTPAGGFKLKLNLSQPPTPIEQSGSSFPATLPSSALDKKKRTKKADGTSAGAGAGAGRGKKRAADDHDGDSQPAPKRVASGAAPPPPGPARKISLKPPQTSALERPSAPKISIQTRKKSQPKLVDIRARGKIPTRQKGVGYDSEDSDTEKDPAIQQALVLRMEHGEDAQYLRQAIAEGKIGQHPLEGDADVKMRFIEKGFRRAVITIRQRMYAAVLVDLPCIVESMKSFDRKGWWKVADIAQMLLVLGQCRNDDEARAMPLPREVNKDNYQYAHGLTPPMHWARKRRFRKRLNYNENMNIEEEVERLIAADKEREMQGGRTEMHRGDAREQRQASEPRSELEYVDDEDGEGALETIEGDGQQYEFNLDAEGDEDAEGDEDLEAKMQAMFDEDVEEGGISQLVGDSPAPIADQAASMAAVENAMAEDTDATPAATPMADTQGEQSDDEESDEDDEDSPDVIDEDAAAKVAERAQQLEEVADLEKEVERSRQKSNAMTNQLLRQREIQRLNSLLEELATKKRVFGLEDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.5
3 0.54
4 0.54
5 0.54
6 0.51
7 0.47
8 0.42
9 0.41
10 0.34
11 0.39
12 0.38
13 0.43
14 0.42
15 0.41
16 0.46
17 0.39
18 0.37
19 0.28
20 0.26
21 0.18
22 0.18
23 0.15
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.1
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.15
58 0.19
59 0.27
60 0.29
61 0.31
62 0.31
63 0.31
64 0.3
65 0.32
66 0.3
67 0.27
68 0.26
69 0.25
70 0.27
71 0.25
72 0.28
73 0.29
74 0.31
75 0.32
76 0.37
77 0.44
78 0.45
79 0.49
80 0.5
81 0.45
82 0.43
83 0.47
84 0.41
85 0.34
86 0.36
87 0.33
88 0.29
89 0.29
90 0.26
91 0.17
92 0.2
93 0.19
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.21
112 0.22
113 0.24
114 0.25
115 0.3
116 0.35
117 0.38
118 0.38
119 0.34
120 0.37
121 0.35
122 0.33
123 0.28
124 0.24
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.15
135 0.14
136 0.18
137 0.22
138 0.3
139 0.32
140 0.39
141 0.49
142 0.58
143 0.66
144 0.69
145 0.75
146 0.78
147 0.81
148 0.83
149 0.78
150 0.72
151 0.64
152 0.56
153 0.46
154 0.35
155 0.25
156 0.14
157 0.11
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.14
164 0.17
165 0.24
166 0.29
167 0.35
168 0.38
169 0.41
170 0.46
171 0.44
172 0.42
173 0.35
174 0.34
175 0.29
176 0.29
177 0.26
178 0.2
179 0.22
180 0.22
181 0.24
182 0.2
183 0.24
184 0.27
185 0.31
186 0.32
187 0.3
188 0.32
189 0.32
190 0.32
191 0.26
192 0.23
193 0.23
194 0.3
195 0.33
196 0.39
197 0.46
198 0.51
199 0.52
200 0.52
201 0.52
202 0.48
203 0.48
204 0.44
205 0.41
206 0.36
207 0.34
208 0.34
209 0.33
210 0.32
211 0.28
212 0.26
213 0.24
214 0.3
215 0.4
216 0.43
217 0.47
218 0.53
219 0.62
220 0.68
221 0.72
222 0.7
223 0.7
224 0.72
225 0.73
226 0.74
227 0.71
228 0.67
229 0.67
230 0.63
231 0.54
232 0.47
233 0.43
234 0.42
235 0.45
236 0.48
237 0.46
238 0.45
239 0.45
240 0.48
241 0.47
242 0.45
243 0.39
244 0.32
245 0.28
246 0.26
247 0.25
248 0.22
249 0.19
250 0.15
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.15
300 0.16
301 0.24
302 0.25
303 0.26
304 0.27
305 0.27
306 0.29
307 0.3
308 0.34
309 0.33
310 0.33
311 0.32
312 0.32
313 0.31
314 0.29
315 0.22
316 0.15
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.09
329 0.12
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.23
334 0.28
335 0.31
336 0.33
337 0.31
338 0.3
339 0.34
340 0.35
341 0.33
342 0.28
343 0.24
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.11
348 0.08
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.15
361 0.14
362 0.13
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.23
367 0.22
368 0.27
369 0.32
370 0.35
371 0.33
372 0.32
373 0.31
374 0.26
375 0.26
376 0.2
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.12
381 0.15
382 0.18
383 0.21
384 0.23
385 0.31
386 0.4
387 0.5
388 0.6
389 0.66
390 0.74
391 0.8
392 0.88
393 0.9
394 0.92
395 0.91
396 0.88
397 0.83
398 0.8
399 0.72
400 0.62
401 0.51
402 0.4
403 0.31
404 0.23
405 0.17
406 0.1
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.13
420 0.15
421 0.17
422 0.17
423 0.17
424 0.19
425 0.18
426 0.21
427 0.23
428 0.22
429 0.25
430 0.32
431 0.33
432 0.38
433 0.39
434 0.37
435 0.41
436 0.45
437 0.41
438 0.41
439 0.38
440 0.32
441 0.35
442 0.33
443 0.26
444 0.23
445 0.22
446 0.16
447 0.16
448 0.15
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.08
453 0.06
454 0.04
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.03
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.13
543 0.17
544 0.18
545 0.18
546 0.17
547 0.16
548 0.16
549 0.17
550 0.15
551 0.11
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.08
561 0.08
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.06
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.08
571 0.1
572 0.14
573 0.14
574 0.17
575 0.18
576 0.2
577 0.2
578 0.19
579 0.17
580 0.14
581 0.14
582 0.11
583 0.1
584 0.09
585 0.1
586 0.12
587 0.13
588 0.2
589 0.27
590 0.31
591 0.37
592 0.42
593 0.45
594 0.51
595 0.6
596 0.62
597 0.62
598 0.64
599 0.62
600 0.63
601 0.65
602 0.6
603 0.53
604 0.51
605 0.49
606 0.53
607 0.56
608 0.53
609 0.53
610 0.54
611 0.54
612 0.47
613 0.42
614 0.33
615 0.26
616 0.24
617 0.2
618 0.24
619 0.26
620 0.24
621 0.25
622 0.29
623 0.31
624 0.31
625 0.32
626 0.33