Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IDX9

Protein Details
Accession A0A139IDX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-193QQALKSSKTRQQKRALHARQTPSKHydrophilic
880-906VTGKPSSTPPTRPRKVKQDFNNFQVVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
Amino Acid Sequences MSRNYGESKALEQEVDDDATPTKYTGHIRHFGDGSSHDYARQSALSITTSHDDSPPSSQALHATNLCASPLSCPSEASMHNHVETETPPDTFTTPYSANRSEPTAEGLSRLCLHHVHSRRASLQGRPSPERGRCSHTHNSPAVTTKRSASSELARPECDQPPYPAEPLRQQALKSSKTRQQKRALHARQTPSKLASGDAMNPHRILHGQLPRDSGYESNFPSRHPTHTSFHPPARRSAVQTITGTALPDLAPRCDAEQIHSHSDRPVSNSNKSRFPGLILQPDSSPISQDQLAAEVKGIYAGLVMVEAKCINIDAAQAADSKSHLGPEQWQALIALHRTLLYEHHDFLMATQHPSATQALRGLATKYSMPARMWKHGIHAFLEVLRHRRPDSQEYMLAFIYLAYQMMALLFETVPSFTDTWIECLGDLARYRMAIEEEKESHATWGGVAARWYTMASDRHPAIGRLYHHLGILERPSLRKFCFYAKSLTCVIPFPNARDSLSTLCGPIVQDDQTIQSSRQSAEARIVTFHALLYTGRDQELIDDVGRDALDLLHQQPNKLRDFGAYLAVTNVAAIFELGAPTNSFWQLYSAAINQAMQSSRPSLTSSAHTDEVLSQMMPSTGSSPLLASCTAFFSDCFDFVLRQYNSPGTVKDCLGFVHITLVWIHSLHALRTWLNNSTLLHTFDVPNIVGRLSWGILAKFLNTLASLDSVTDYVLERARQGNFLGSESNEELRPLSEDYTIRGLVWGQFYFSPGWFDGQCEDDGRSIETPSMAKARVERVLWLGLYLAFHTDYLQYDVQNKIFSASDWGHSVVTSVKSAHPAVVAPADVEMEQVSEAVNLSPRSRSSKSHSSSSSGSSEDGFKKIKKPRMTACTYAKAVTGKPSSTPPTRPRKVKQDFNNFQVVDENGTEWTMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.19
4 0.15
5 0.15
6 0.17
7 0.17
8 0.14
9 0.13
10 0.16
11 0.23
12 0.3
13 0.36
14 0.42
15 0.45
16 0.5
17 0.5
18 0.46
19 0.42
20 0.37
21 0.35
22 0.32
23 0.3
24 0.26
25 0.26
26 0.27
27 0.25
28 0.23
29 0.18
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.18
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.2
39 0.2
40 0.21
41 0.25
42 0.24
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.24
47 0.25
48 0.28
49 0.24
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.22
54 0.19
55 0.16
56 0.15
57 0.19
58 0.22
59 0.2
60 0.21
61 0.22
62 0.27
63 0.29
64 0.31
65 0.33
66 0.31
67 0.31
68 0.31
69 0.3
70 0.26
71 0.25
72 0.26
73 0.21
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.19
79 0.19
80 0.18
81 0.2
82 0.24
83 0.3
84 0.31
85 0.33
86 0.33
87 0.35
88 0.32
89 0.3
90 0.31
91 0.27
92 0.25
93 0.24
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.19
99 0.16
100 0.21
101 0.28
102 0.35
103 0.41
104 0.43
105 0.48
106 0.48
107 0.56
108 0.55
109 0.53
110 0.56
111 0.53
112 0.56
113 0.56
114 0.6
115 0.6
116 0.62
117 0.62
118 0.56
119 0.57
120 0.53
121 0.56
122 0.6
123 0.57
124 0.6
125 0.56
126 0.55
127 0.5
128 0.54
129 0.5
130 0.44
131 0.39
132 0.34
133 0.37
134 0.35
135 0.36
136 0.33
137 0.35
138 0.39
139 0.45
140 0.45
141 0.41
142 0.42
143 0.44
144 0.44
145 0.41
146 0.36
147 0.32
148 0.35
149 0.37
150 0.38
151 0.37
152 0.36
153 0.37
154 0.39
155 0.4
156 0.37
157 0.33
158 0.39
159 0.42
160 0.46
161 0.45
162 0.48
163 0.5
164 0.59
165 0.68
166 0.69
167 0.72
168 0.74
169 0.78
170 0.82
171 0.83
172 0.82
173 0.81
174 0.81
175 0.79
176 0.75
177 0.69
178 0.6
179 0.55
180 0.46
181 0.38
182 0.32
183 0.25
184 0.24
185 0.27
186 0.28
187 0.27
188 0.26
189 0.26
190 0.24
191 0.22
192 0.21
193 0.22
194 0.26
195 0.29
196 0.31
197 0.34
198 0.34
199 0.35
200 0.33
201 0.26
202 0.23
203 0.23
204 0.23
205 0.27
206 0.27
207 0.26
208 0.33
209 0.34
210 0.35
211 0.37
212 0.4
213 0.36
214 0.44
215 0.52
216 0.51
217 0.56
218 0.6
219 0.54
220 0.55
221 0.58
222 0.53
223 0.49
224 0.49
225 0.46
226 0.43
227 0.42
228 0.38
229 0.32
230 0.3
231 0.25
232 0.18
233 0.14
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.22
245 0.26
246 0.31
247 0.32
248 0.31
249 0.3
250 0.33
251 0.31
252 0.29
253 0.33
254 0.32
255 0.39
256 0.47
257 0.48
258 0.52
259 0.51
260 0.49
261 0.41
262 0.39
263 0.39
264 0.35
265 0.4
266 0.35
267 0.35
268 0.32
269 0.34
270 0.32
271 0.24
272 0.21
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.03
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.12
314 0.16
315 0.19
316 0.17
317 0.17
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.15
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.19
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.15
342 0.16
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.14
356 0.14
357 0.2
358 0.23
359 0.27
360 0.3
361 0.28
362 0.32
363 0.32
364 0.33
365 0.27
366 0.25
367 0.2
368 0.18
369 0.2
370 0.16
371 0.18
372 0.18
373 0.19
374 0.19
375 0.24
376 0.28
377 0.32
378 0.35
379 0.35
380 0.36
381 0.35
382 0.36
383 0.3
384 0.26
385 0.19
386 0.13
387 0.1
388 0.06
389 0.05
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.1
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.13
424 0.14
425 0.15
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.13
430 0.11
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.14
445 0.15
446 0.17
447 0.18
448 0.18
449 0.15
450 0.17
451 0.17
452 0.18
453 0.2
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.17
458 0.14
459 0.14
460 0.12
461 0.11
462 0.12
463 0.13
464 0.15
465 0.16
466 0.17
467 0.17
468 0.21
469 0.25
470 0.26
471 0.31
472 0.3
473 0.32
474 0.32
475 0.31
476 0.26
477 0.22
478 0.21
479 0.19
480 0.19
481 0.18
482 0.19
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.2
487 0.17
488 0.18
489 0.16
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.1
495 0.1
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.1
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.17
507 0.16
508 0.16
509 0.19
510 0.21
511 0.19
512 0.18
513 0.19
514 0.14
515 0.13
516 0.13
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.09
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.12
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.05
536 0.04
537 0.05
538 0.06
539 0.09
540 0.13
541 0.14
542 0.15
543 0.19
544 0.24
545 0.25
546 0.25
547 0.22
548 0.18
549 0.21
550 0.21
551 0.21
552 0.17
553 0.15
554 0.14
555 0.14
556 0.12
557 0.09
558 0.08
559 0.04
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.05
568 0.05
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.11
580 0.11
581 0.09
582 0.1
583 0.1
584 0.09
585 0.1
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.13
590 0.13
591 0.15
592 0.18
593 0.21
594 0.22
595 0.22
596 0.21
597 0.2
598 0.19
599 0.18
600 0.15
601 0.11
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.09
614 0.09
615 0.08
616 0.07
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.11
622 0.12
623 0.12
624 0.13
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.22
629 0.19
630 0.19
631 0.21
632 0.21
633 0.23
634 0.24
635 0.24
636 0.18
637 0.2
638 0.2
639 0.18
640 0.17
641 0.15
642 0.16
643 0.15
644 0.11
645 0.12
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.1
651 0.1
652 0.1
653 0.11
654 0.11
655 0.11
656 0.13
657 0.14
658 0.14
659 0.17
660 0.19
661 0.18
662 0.19
663 0.21
664 0.2
665 0.22
666 0.24
667 0.23
668 0.22
669 0.21
670 0.2
671 0.18
672 0.19
673 0.16
674 0.14
675 0.12
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.1
680 0.08
681 0.1
682 0.1
683 0.1
684 0.11
685 0.12
686 0.12
687 0.11
688 0.11
689 0.1
690 0.08
691 0.09
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.07
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.11
703 0.11
704 0.12
705 0.16
706 0.17
707 0.18
708 0.18
709 0.21
710 0.2
711 0.2
712 0.2
713 0.17
714 0.19
715 0.2
716 0.21
717 0.17
718 0.16
719 0.15
720 0.14
721 0.16
722 0.13
723 0.13
724 0.15
725 0.15
726 0.18
727 0.21
728 0.21
729 0.18
730 0.17
731 0.17
732 0.16
733 0.19
734 0.16
735 0.14
736 0.14
737 0.16
738 0.17
739 0.16
740 0.17
741 0.14
742 0.16
743 0.15
744 0.16
745 0.16
746 0.17
747 0.17
748 0.16
749 0.16
750 0.15
751 0.16
752 0.17
753 0.16
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.14
758 0.15
759 0.18
760 0.17
761 0.18
762 0.21
763 0.25
764 0.28
765 0.28
766 0.27
767 0.26
768 0.28
769 0.26
770 0.23
771 0.19
772 0.15
773 0.14
774 0.13
775 0.11
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.1
780 0.11
781 0.15
782 0.16
783 0.16
784 0.19
785 0.23
786 0.24
787 0.24
788 0.22
789 0.2
790 0.19
791 0.18
792 0.2
793 0.19
794 0.19
795 0.2
796 0.21
797 0.19
798 0.19
799 0.19
800 0.17
801 0.17
802 0.16
803 0.16
804 0.16
805 0.2
806 0.21
807 0.21
808 0.18
809 0.17
810 0.17
811 0.18
812 0.16
813 0.12
814 0.12
815 0.12
816 0.11
817 0.11
818 0.08
819 0.07
820 0.07
821 0.06
822 0.06
823 0.05
824 0.06
825 0.07
826 0.11
827 0.12
828 0.14
829 0.17
830 0.2
831 0.28
832 0.3
833 0.35
834 0.4
835 0.49
836 0.52
837 0.58
838 0.58
839 0.55
840 0.55
841 0.54
842 0.48
843 0.39
844 0.35
845 0.27
846 0.31
847 0.28
848 0.3
849 0.3
850 0.31
851 0.38
852 0.47
853 0.55
854 0.57
855 0.63
856 0.68
857 0.73
858 0.77
859 0.78
860 0.77
861 0.76
862 0.69
863 0.62
864 0.55
865 0.48
866 0.43
867 0.42
868 0.38
869 0.31
870 0.31
871 0.37
872 0.41
873 0.44
874 0.52
875 0.53
876 0.6
877 0.68
878 0.75
879 0.78
880 0.82
881 0.85
882 0.86
883 0.87
884 0.88
885 0.86
886 0.81
887 0.82
888 0.71
889 0.61
890 0.55
891 0.45
892 0.37
893 0.3
894 0.26
895 0.17