Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IPC8

Protein Details
Accession A0A139IPC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-259QEARKELKEQTHRKKKSAKREMLNEQREKRREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-248QTHRKKKSAKRE
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR018856  Stn1_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF10451  Stn1  
Amino Acid Sequences MTCTFIPSAYQQSPLSSPKSHCQNAMNNARSGELYPAKYYDASPTWYRWNKLSVADVYQLRQEPGFEGQNIWFWLNHPIQYVRLVGLICQVDMVAGGRYVLMTLDDSSGANIEIKLERGAGKVSENGFKEYLPITDLHNVLVRVEMGLPIVTLDRTILELGTIVIAEGQIGSYMHNRQMVLSRLQRVPDTRAEAQHWAKAAVWKGLILSKPWVLSTEKMLELDQNACQEARKELKEQTHRKKKSAKREMLNEQREKRRELEEVQMNKGALPGSEVLKMPWDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.34
4 0.36
5 0.4
6 0.49
7 0.49
8 0.49
9 0.51
10 0.55
11 0.6
12 0.66
13 0.62
14 0.55
15 0.52
16 0.49
17 0.43
18 0.35
19 0.32
20 0.27
21 0.25
22 0.25
23 0.25
24 0.26
25 0.26
26 0.26
27 0.25
28 0.22
29 0.24
30 0.25
31 0.27
32 0.36
33 0.4
34 0.42
35 0.39
36 0.4
37 0.38
38 0.38
39 0.41
40 0.33
41 0.31
42 0.34
43 0.32
44 0.29
45 0.31
46 0.29
47 0.24
48 0.22
49 0.19
50 0.16
51 0.18
52 0.2
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.15
60 0.14
61 0.2
62 0.2
63 0.2
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.22
68 0.21
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.11
73 0.15
74 0.14
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.13
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.18
117 0.15
118 0.14
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.1
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.06
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.17
166 0.19
167 0.23
168 0.26
169 0.29
170 0.29
171 0.3
172 0.32
173 0.3
174 0.31
175 0.29
176 0.32
177 0.29
178 0.31
179 0.32
180 0.36
181 0.36
182 0.34
183 0.3
184 0.24
185 0.23
186 0.24
187 0.23
188 0.19
189 0.17
190 0.15
191 0.15
192 0.18
193 0.18
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.17
201 0.17
202 0.2
203 0.22
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.19
217 0.24
218 0.25
219 0.27
220 0.32
221 0.42
222 0.52
223 0.61
224 0.66
225 0.71
226 0.73
227 0.78
228 0.82
229 0.82
230 0.83
231 0.83
232 0.82
233 0.8
234 0.84
235 0.87
236 0.88
237 0.89
238 0.87
239 0.84
240 0.84
241 0.79
242 0.73
243 0.66
244 0.61
245 0.56
246 0.51
247 0.52
248 0.51
249 0.52
250 0.53
251 0.52
252 0.47
253 0.41
254 0.39
255 0.29
256 0.19
257 0.17
258 0.15
259 0.14
260 0.17
261 0.17
262 0.16