Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IJP1

Protein Details
Accession A0A139IJP1    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
429-452SSGSNSPNSKSKSRKKGKRRKQDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-410VKKGSEARKGKGKLKK
438-450KSKSRKKGKRRKQ
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021740  Velvet  
IPR037525  Velvet_dom  
IPR038491  Velvet_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11754  Velvet  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51821  VELVET  
Amino Acid Sequences MSHPRRPSPLQPPPSMSSEPDSMAQIHHHSTIPPPNFLPLASGPQLPPLHSLPAHRSTQEHAASSLQLPPMQVAPPASSEPHASRAPTRSIPVAHLLSSNPPSPPPPSPSQPAVAAQQPVRRRSPTTSAQPTLEPRIEPQHYQAPPQYRYHQLHIPQSQPQPVFHQDPSANAHYSTSHYPAARPTLSTDHTSPSSSLAPSSHSRSQRNQVQQPPPLNYTLSIRQQPAAARACGFGERDRRVIDPPPILELKITDRDGVPECDSTGMLALHCTLLSPDGSDDETELPPAHPEMPSTRRLMGTLVASPYPAKDENNHAGTFFVFPDLSCRSPGKYRLKFKLLRIDPTNIVPGVKFKGDVATIVTEVFSVYTAKDFPGMRASSALLKSLRRQGLNVGVKKGSEARKGKGKLKKEIESSASSDNDTDAGDSDSSGSNSPNSKSKSRKKGKRRKQDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.61
3 0.53
4 0.47
5 0.41
6 0.37
7 0.32
8 0.3
9 0.24
10 0.23
11 0.23
12 0.22
13 0.21
14 0.22
15 0.21
16 0.21
17 0.26
18 0.35
19 0.34
20 0.34
21 0.33
22 0.34
23 0.33
24 0.32
25 0.3
26 0.23
27 0.26
28 0.25
29 0.26
30 0.23
31 0.3
32 0.31
33 0.28
34 0.29
35 0.25
36 0.28
37 0.27
38 0.31
39 0.31
40 0.36
41 0.38
42 0.35
43 0.35
44 0.34
45 0.41
46 0.41
47 0.35
48 0.3
49 0.28
50 0.29
51 0.28
52 0.28
53 0.21
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.2
67 0.2
68 0.24
69 0.25
70 0.24
71 0.27
72 0.31
73 0.35
74 0.34
75 0.34
76 0.33
77 0.33
78 0.33
79 0.34
80 0.31
81 0.26
82 0.24
83 0.23
84 0.24
85 0.26
86 0.25
87 0.19
88 0.19
89 0.21
90 0.24
91 0.27
92 0.28
93 0.31
94 0.34
95 0.39
96 0.41
97 0.41
98 0.39
99 0.37
100 0.34
101 0.31
102 0.3
103 0.27
104 0.3
105 0.34
106 0.36
107 0.38
108 0.38
109 0.38
110 0.4
111 0.45
112 0.47
113 0.51
114 0.55
115 0.53
116 0.52
117 0.51
118 0.49
119 0.47
120 0.41
121 0.32
122 0.26
123 0.31
124 0.31
125 0.29
126 0.3
127 0.33
128 0.32
129 0.35
130 0.37
131 0.37
132 0.38
133 0.42
134 0.42
135 0.42
136 0.45
137 0.46
138 0.47
139 0.44
140 0.49
141 0.49
142 0.48
143 0.46
144 0.45
145 0.47
146 0.42
147 0.38
148 0.35
149 0.35
150 0.36
151 0.3
152 0.32
153 0.26
154 0.28
155 0.32
156 0.3
157 0.26
158 0.21
159 0.22
160 0.17
161 0.2
162 0.19
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.2
168 0.23
169 0.21
170 0.19
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.24
175 0.23
176 0.21
177 0.22
178 0.22
179 0.2
180 0.17
181 0.17
182 0.14
183 0.14
184 0.11
185 0.14
186 0.15
187 0.21
188 0.25
189 0.29
190 0.32
191 0.36
192 0.44
193 0.48
194 0.54
195 0.55
196 0.58
197 0.59
198 0.61
199 0.6
200 0.56
201 0.49
202 0.42
203 0.35
204 0.27
205 0.24
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.21
210 0.21
211 0.22
212 0.22
213 0.25
214 0.23
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.19
223 0.2
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.24
228 0.26
229 0.27
230 0.23
231 0.21
232 0.23
233 0.22
234 0.21
235 0.18
236 0.16
237 0.15
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.14
242 0.17
243 0.19
244 0.2
245 0.18
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.1
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.08
277 0.09
278 0.15
279 0.18
280 0.21
281 0.23
282 0.24
283 0.23
284 0.24
285 0.23
286 0.2
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.13
298 0.21
299 0.27
300 0.3
301 0.3
302 0.27
303 0.26
304 0.25
305 0.24
306 0.17
307 0.12
308 0.08
309 0.08
310 0.12
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.18
315 0.2
316 0.26
317 0.36
318 0.42
319 0.48
320 0.56
321 0.62
322 0.7
323 0.72
324 0.73
325 0.74
326 0.68
327 0.67
328 0.62
329 0.59
330 0.51
331 0.48
332 0.45
333 0.34
334 0.31
335 0.23
336 0.21
337 0.19
338 0.18
339 0.16
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.13
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.21
362 0.22
363 0.21
364 0.22
365 0.23
366 0.25
367 0.25
368 0.28
369 0.23
370 0.25
371 0.3
372 0.37
373 0.42
374 0.37
375 0.37
376 0.38
377 0.46
378 0.52
379 0.52
380 0.47
381 0.43
382 0.41
383 0.42
384 0.45
385 0.41
386 0.41
387 0.42
388 0.44
389 0.52
390 0.59
391 0.66
392 0.67
393 0.69
394 0.69
395 0.73
396 0.75
397 0.71
398 0.72
399 0.69
400 0.64
401 0.59
402 0.54
403 0.46
404 0.39
405 0.34
406 0.27
407 0.22
408 0.18
409 0.15
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.16
420 0.2
421 0.23
422 0.29
423 0.33
424 0.41
425 0.51
426 0.6
427 0.68
428 0.75
429 0.83
430 0.86
431 0.92
432 0.94