Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IW13

Protein Details
Accession A0A139IW13    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-40MSNSDSERSPKRQRLNSYSPASTGCPSPKRQRTEQPFIQTHydrophilic
325-351SAPASPRSQIRPDRKGKKRSYDDSSFEHydrophilic
367-395LDDTGRRRDSSKRQKRKDILPQTNSPAFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-342RKGKK
378-381KRQK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSNSDSERSPKRQRLNSYSPASTGCPSPKRQRTEQPFIQTPPPSVRMSPSWQSQSQQVPHQSGGSNFPSPPSTAGYQNRMVEGGGDSGRQTPASQDDGELRRDGDGDAVMRDQREGMGADIHMADSEHRRSDHERLGGSGEVESLPRFKVFAAPIPPSRPHPSQDLIELYGLKRIQANVRRRDPATGAKINTMRKSYANKLKTLGLEGRNKAVPNQGELSGLLDPGWSQEMQPGSGVTLWDNNWSERGKLGDSNADADLLSKLDAALEMEPGHLPGKERESWNNVLGLDDPSIPSKGAAAAMAKAPLASNPALAKTSAAHAMSSSAPASPRSQIRPDRKGKKRSYDDSSFEGYNQGYDDDGYSTGGLDDTGRRRDSSKRQKRKDILPQTNSPAFNAPGAVGVRSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.83
4 0.8
5 0.73
6 0.65
7 0.58
8 0.51
9 0.43
10 0.39
11 0.38
12 0.38
13 0.43
14 0.52
15 0.59
16 0.63
17 0.7
18 0.75
19 0.77
20 0.8
21 0.81
22 0.79
23 0.77
24 0.74
25 0.72
26 0.64
27 0.58
28 0.54
29 0.49
30 0.42
31 0.37
32 0.37
33 0.35
34 0.4
35 0.42
36 0.43
37 0.45
38 0.45
39 0.45
40 0.47
41 0.51
42 0.48
43 0.5
44 0.49
45 0.46
46 0.45
47 0.45
48 0.41
49 0.34
50 0.36
51 0.32
52 0.29
53 0.25
54 0.26
55 0.25
56 0.24
57 0.24
58 0.22
59 0.2
60 0.25
61 0.31
62 0.34
63 0.38
64 0.38
65 0.37
66 0.33
67 0.31
68 0.24
69 0.19
70 0.17
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.14
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.23
84 0.25
85 0.27
86 0.26
87 0.22
88 0.19
89 0.2
90 0.18
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.18
117 0.22
118 0.28
119 0.33
120 0.33
121 0.31
122 0.3
123 0.32
124 0.29
125 0.25
126 0.19
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.12
137 0.12
138 0.18
139 0.21
140 0.24
141 0.27
142 0.31
143 0.32
144 0.32
145 0.37
146 0.34
147 0.32
148 0.32
149 0.32
150 0.3
151 0.31
152 0.28
153 0.23
154 0.22
155 0.2
156 0.16
157 0.17
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.18
163 0.26
164 0.35
165 0.4
166 0.45
167 0.49
168 0.49
169 0.49
170 0.46
171 0.45
172 0.43
173 0.39
174 0.35
175 0.35
176 0.39
177 0.4
178 0.39
179 0.34
180 0.28
181 0.26
182 0.3
183 0.34
184 0.39
185 0.38
186 0.37
187 0.37
188 0.38
189 0.35
190 0.33
191 0.3
192 0.27
193 0.31
194 0.3
195 0.3
196 0.29
197 0.29
198 0.27
199 0.26
200 0.21
201 0.17
202 0.18
203 0.17
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.11
208 0.11
209 0.08
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.12
228 0.13
229 0.12
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.16
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.17
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.16
264 0.19
265 0.22
266 0.26
267 0.32
268 0.34
269 0.34
270 0.34
271 0.29
272 0.25
273 0.24
274 0.21
275 0.16
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.11
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.15
316 0.19
317 0.24
318 0.28
319 0.36
320 0.45
321 0.53
322 0.62
323 0.7
324 0.76
325 0.8
326 0.85
327 0.86
328 0.87
329 0.87
330 0.86
331 0.84
332 0.82
333 0.76
334 0.71
335 0.66
336 0.55
337 0.46
338 0.4
339 0.31
340 0.23
341 0.2
342 0.15
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.13
356 0.18
357 0.25
358 0.26
359 0.28
360 0.3
361 0.4
362 0.5
363 0.55
364 0.61
365 0.66
366 0.74
367 0.84
368 0.9
369 0.91
370 0.91
371 0.91
372 0.91
373 0.87
374 0.85
375 0.82
376 0.8
377 0.7
378 0.61
379 0.54
380 0.44
381 0.37
382 0.3
383 0.22
384 0.2
385 0.2