Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139III8

Protein Details
Accession A0A139III8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-363QEEERHRREKEERKRKLAALSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-240KHKPVERLTKKERMRLREEAKQKGSGKGGKAAAADRSRSGTPSDPKAAAKKA
346-372RHRREKEERKRKLAALSKTAAAAKKRY
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 11.833, nucl 10, cyto_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MTAGCPCSYAVGFNFNNLLNSIGKPGSTPSPKPTTGISKPPPGAPSTAKPQAVTNGVTPRTVPANVAAGVKRKSEDQSSGPQAKVVRTEVKVPVRPCQNGQVATAKPAASASTATAASYKGTSRPLNTSQPAKAAAKPAVKPAAAAPKPAGNSAAVNAAPAAPKGFAAILAQAKAAQEASKAAASNTIKHKPVERLTKKERMRLREEAKQKGSGKGGKAAAADRSRSGTPSDPKAAAKKAPDTGYKGTMKKAVVALPTTSYAGTMKKAVPGAAPKKDTKKGLGQDKYGGYASWSDLSAAEDEDEEGYDSYESDDMEAGFDDVEGEEQLALKSARKEDLEALQEEERHRREKEERKRKLAALSKTAAAAKKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.25
4 0.22
5 0.23
6 0.16
7 0.17
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.18
13 0.25
14 0.3
15 0.33
16 0.36
17 0.43
18 0.44
19 0.45
20 0.47
21 0.48
22 0.47
23 0.54
24 0.53
25 0.54
26 0.55
27 0.58
28 0.55
29 0.47
30 0.46
31 0.41
32 0.4
33 0.4
34 0.45
35 0.42
36 0.41
37 0.41
38 0.41
39 0.39
40 0.35
41 0.32
42 0.32
43 0.32
44 0.31
45 0.29
46 0.27
47 0.27
48 0.25
49 0.21
50 0.16
51 0.18
52 0.19
53 0.22
54 0.22
55 0.25
56 0.26
57 0.27
58 0.26
59 0.25
60 0.27
61 0.29
62 0.31
63 0.3
64 0.36
65 0.43
66 0.47
67 0.44
68 0.43
69 0.4
70 0.37
71 0.37
72 0.32
73 0.3
74 0.27
75 0.32
76 0.37
77 0.43
78 0.46
79 0.44
80 0.47
81 0.48
82 0.49
83 0.46
84 0.46
85 0.44
86 0.4
87 0.41
88 0.41
89 0.34
90 0.34
91 0.34
92 0.27
93 0.21
94 0.2
95 0.17
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.24
112 0.29
113 0.34
114 0.38
115 0.4
116 0.36
117 0.36
118 0.38
119 0.34
120 0.31
121 0.28
122 0.3
123 0.31
124 0.3
125 0.33
126 0.32
127 0.3
128 0.29
129 0.28
130 0.33
131 0.28
132 0.28
133 0.24
134 0.24
135 0.25
136 0.25
137 0.22
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.12
171 0.13
172 0.17
173 0.22
174 0.25
175 0.26
176 0.26
177 0.3
178 0.3
179 0.36
180 0.43
181 0.43
182 0.48
183 0.53
184 0.62
185 0.62
186 0.63
187 0.62
188 0.58
189 0.59
190 0.59
191 0.57
192 0.56
193 0.6
194 0.61
195 0.58
196 0.58
197 0.53
198 0.48
199 0.48
200 0.44
201 0.38
202 0.36
203 0.34
204 0.28
205 0.28
206 0.25
207 0.26
208 0.24
209 0.24
210 0.19
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.22
217 0.27
218 0.29
219 0.28
220 0.3
221 0.34
222 0.34
223 0.32
224 0.31
225 0.3
226 0.31
227 0.33
228 0.34
229 0.36
230 0.35
231 0.38
232 0.41
233 0.38
234 0.36
235 0.37
236 0.33
237 0.31
238 0.3
239 0.26
240 0.23
241 0.23
242 0.21
243 0.18
244 0.19
245 0.17
246 0.15
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.18
257 0.26
258 0.32
259 0.35
260 0.39
261 0.41
262 0.48
263 0.53
264 0.53
265 0.49
266 0.51
267 0.52
268 0.58
269 0.59
270 0.54
271 0.54
272 0.52
273 0.5
274 0.41
275 0.33
276 0.24
277 0.19
278 0.18
279 0.14
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.09
316 0.09
317 0.12
318 0.16
319 0.19
320 0.24
321 0.24
322 0.27
323 0.29
324 0.35
325 0.36
326 0.33
327 0.34
328 0.32
329 0.34
330 0.35
331 0.39
332 0.37
333 0.38
334 0.38
335 0.41
336 0.49
337 0.57
338 0.65
339 0.68
340 0.74
341 0.77
342 0.83
343 0.8
344 0.8
345 0.78
346 0.76
347 0.73
348 0.66
349 0.59
350 0.55
351 0.55
352 0.5