Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IWC4

Protein Details
Accession A0A139IWC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-219SSIPPEPPKKRGGRKRKAETQAEPSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-210EPPKKRGGRKRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR019006  Sre1_C  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF09427  DUF2014  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11399  bHLHzip_scHMS1_like  
Amino Acid Sequences MDTSWQGAAGYSQQQSAPFPGQLDGGANNEDWEEWLRWDPAAEPISPDDTFNSGSSKNDSPIQDLAFDAPFGKTDEEPLGPLHIVGNDSLDFGDSHDFNTDFALFGNGDLDAGFAFDQAGSIDNLVPSIPKLDTNTAAWAKPSTGLEEPNVSLSAISNENNQHLHSASSLTATTPSLHQSPQSSSGTQNRRSLSSIPPEPPKKRGGRKRKAETQAEPSPEGLENGDSQDGDEPPIKKTSHNVIEKRYRNNLNDKIVELRNAVPSLRAMGRANSGKETEDLEGLTPAHKLNKATVMAKATEYIRHLEKRNQKMQEEMNALKAQLEKVETTFGNSRDRQESNSPTSASQRSGEASSASQGAVPSFLNVPQDQNRFGQPVVQQQYMQQQRGPTYARPPNPPVEAQNQQPCVNGRGGIMNKVMLGTMAGVMVMEGFTQEQSGDDSSARQLFSVPTALFKRALDSSTHSSSTAISYHAAIPLLKLFLVVGALFYLLTPFLMWAPRRKQKICSSVQLPKAPSLASPVEVRRQAWLTAIQSVWVPKHFLLEVVAVGFKMLQLSIRRLVGAEIFTYITGTSKEEEAARVKAWDIAIDAQLAGGDAQVSYYRLLLTLMESGTLPDSPARLMQKAVHFRVFFWEIANAGYGNILGFKSFTEKVGRIYWNSACRIQKELIHAKVQGRPSEEDEVEVLPDHLAQLVELDCDEVLSDEMIQRAWNLAWNKPSANELAPNAAKDLVVEDHAIRSPLDAVAAWYTNTTIDDTLADALSDTASTMDTEYYLGLALSVAPPASSTHVRALTAKAVLSNTNREANIVVALEALPVICPTGGMNLVSHAPASPDVFTALTLAKLISLCSPSSPKTARSRAFTALNNMSLSPAQFSLLTAVAAYRLLRLLTSNQGRSKDARVGLEDIAGSLRLWAGTQAGRDSGLGQQGRAKMVKLCLVIAKQLGGWEEKDSGYSSARSASSSPVREGIVIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.27
4 0.27
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.19
23 0.2
24 0.19
25 0.2
26 0.19
27 0.23
28 0.24
29 0.22
30 0.21
31 0.23
32 0.27
33 0.26
34 0.26
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.2
39 0.21
40 0.18
41 0.2
42 0.24
43 0.25
44 0.25
45 0.3
46 0.3
47 0.31
48 0.34
49 0.33
50 0.29
51 0.27
52 0.26
53 0.21
54 0.19
55 0.16
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.15
60 0.13
61 0.15
62 0.19
63 0.18
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.17
68 0.17
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.1
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.16
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.1
116 0.09
117 0.11
118 0.15
119 0.18
120 0.21
121 0.22
122 0.29
123 0.29
124 0.29
125 0.28
126 0.26
127 0.23
128 0.24
129 0.23
130 0.2
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.24
136 0.22
137 0.22
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.17
146 0.2
147 0.21
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.2
167 0.23
168 0.28
169 0.3
170 0.28
171 0.3
172 0.39
173 0.45
174 0.48
175 0.5
176 0.46
177 0.45
178 0.47
179 0.45
180 0.43
181 0.44
182 0.44
183 0.43
184 0.5
185 0.57
186 0.58
187 0.59
188 0.62
189 0.62
190 0.67
191 0.73
192 0.74
193 0.76
194 0.83
195 0.88
196 0.9
197 0.9
198 0.87
199 0.83
200 0.8
201 0.77
202 0.7
203 0.61
204 0.51
205 0.44
206 0.35
207 0.29
208 0.21
209 0.15
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.23
222 0.23
223 0.21
224 0.26
225 0.33
226 0.38
227 0.46
228 0.49
229 0.53
230 0.62
231 0.67
232 0.69
233 0.68
234 0.66
235 0.62
236 0.68
237 0.66
238 0.63
239 0.59
240 0.54
241 0.51
242 0.46
243 0.42
244 0.34
245 0.28
246 0.24
247 0.23
248 0.22
249 0.17
250 0.15
251 0.17
252 0.16
253 0.17
254 0.15
255 0.16
256 0.22
257 0.25
258 0.26
259 0.25
260 0.25
261 0.23
262 0.23
263 0.23
264 0.18
265 0.15
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.21
278 0.23
279 0.24
280 0.26
281 0.26
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.19
289 0.21
290 0.25
291 0.28
292 0.34
293 0.43
294 0.5
295 0.56
296 0.59
297 0.55
298 0.56
299 0.56
300 0.55
301 0.51
302 0.43
303 0.39
304 0.34
305 0.33
306 0.29
307 0.26
308 0.19
309 0.14
310 0.15
311 0.11
312 0.11
313 0.14
314 0.12
315 0.15
316 0.19
317 0.2
318 0.25
319 0.26
320 0.29
321 0.31
322 0.32
323 0.32
324 0.35
325 0.39
326 0.38
327 0.39
328 0.37
329 0.33
330 0.37
331 0.35
332 0.3
333 0.25
334 0.2
335 0.19
336 0.19
337 0.18
338 0.14
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.1
353 0.13
354 0.18
355 0.2
356 0.21
357 0.22
358 0.23
359 0.22
360 0.22
361 0.23
362 0.19
363 0.26
364 0.28
365 0.28
366 0.26
367 0.26
368 0.35
369 0.36
370 0.35
371 0.28
372 0.26
373 0.26
374 0.3
375 0.31
376 0.24
377 0.27
378 0.33
379 0.36
380 0.39
381 0.41
382 0.41
383 0.41
384 0.4
385 0.35
386 0.34
387 0.33
388 0.33
389 0.36
390 0.35
391 0.33
392 0.33
393 0.31
394 0.27
395 0.25
396 0.2
397 0.15
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.07
407 0.06
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.02
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.08
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.09
435 0.11
436 0.1
437 0.12
438 0.13
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.14
444 0.15
445 0.13
446 0.16
447 0.2
448 0.21
449 0.22
450 0.19
451 0.19
452 0.18
453 0.18
454 0.14
455 0.1
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.07
483 0.08
484 0.14
485 0.22
486 0.28
487 0.35
488 0.36
489 0.43
490 0.48
491 0.57
492 0.55
493 0.54
494 0.53
495 0.54
496 0.58
497 0.55
498 0.48
499 0.39
500 0.36
501 0.3
502 0.24
503 0.21
504 0.16
505 0.13
506 0.15
507 0.15
508 0.19
509 0.2
510 0.2
511 0.18
512 0.18
513 0.17
514 0.16
515 0.18
516 0.14
517 0.15
518 0.15
519 0.13
520 0.12
521 0.13
522 0.13
523 0.1
524 0.11
525 0.09
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.06
535 0.06
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.03
540 0.06
541 0.07
542 0.1
543 0.13
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.14
548 0.12
549 0.11
550 0.09
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.11
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.14
570 0.13
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.09
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.03
582 0.03
583 0.02
584 0.03
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.1
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.17
610 0.24
611 0.31
612 0.34
613 0.35
614 0.33
615 0.33
616 0.37
617 0.36
618 0.28
619 0.22
620 0.2
621 0.15
622 0.15
623 0.15
624 0.09
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.05
634 0.09
635 0.1
636 0.12
637 0.15
638 0.16
639 0.19
640 0.25
641 0.27
642 0.24
643 0.28
644 0.31
645 0.32
646 0.34
647 0.37
648 0.34
649 0.34
650 0.36
651 0.33
652 0.32
653 0.35
654 0.4
655 0.38
656 0.38
657 0.39
658 0.38
659 0.41
660 0.42
661 0.37
662 0.32
663 0.31
664 0.33
665 0.35
666 0.32
667 0.28
668 0.25
669 0.22
670 0.19
671 0.16
672 0.13
673 0.07
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.07
697 0.07
698 0.13
699 0.14
700 0.17
701 0.21
702 0.23
703 0.23
704 0.23
705 0.25
706 0.21
707 0.21
708 0.21
709 0.18
710 0.23
711 0.23
712 0.22
713 0.21
714 0.19
715 0.17
716 0.14
717 0.15
718 0.09
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.11
723 0.12
724 0.13
725 0.11
726 0.1
727 0.1
728 0.09
729 0.09
730 0.07
731 0.08
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.1
739 0.1
740 0.08
741 0.08
742 0.08
743 0.09
744 0.09
745 0.09
746 0.08
747 0.07
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.05
752 0.04
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.05
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.05
763 0.04
764 0.04
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.04
770 0.05
771 0.06
772 0.11
773 0.13
774 0.15
775 0.2
776 0.22
777 0.23
778 0.24
779 0.26
780 0.25
781 0.24
782 0.22
783 0.19
784 0.18
785 0.21
786 0.23
787 0.26
788 0.26
789 0.29
790 0.28
791 0.27
792 0.27
793 0.23
794 0.22
795 0.16
796 0.13
797 0.09
798 0.09
799 0.08
800 0.07
801 0.06
802 0.05
803 0.04
804 0.05
805 0.04
806 0.04
807 0.04
808 0.07
809 0.08
810 0.09
811 0.09
812 0.1
813 0.11
814 0.11
815 0.11
816 0.09
817 0.09
818 0.1
819 0.12
820 0.11
821 0.1
822 0.12
823 0.12
824 0.11
825 0.12
826 0.11
827 0.09
828 0.09
829 0.08
830 0.09
831 0.09
832 0.09
833 0.1
834 0.12
835 0.12
836 0.15
837 0.19
838 0.2
839 0.28
840 0.3
841 0.34
842 0.42
843 0.51
844 0.54
845 0.56
846 0.59
847 0.57
848 0.6
849 0.56
850 0.54
851 0.49
852 0.46
853 0.41
854 0.36
855 0.32
856 0.27
857 0.24
858 0.18
859 0.14
860 0.12
861 0.11
862 0.12
863 0.12
864 0.12
865 0.11
866 0.09
867 0.09
868 0.09
869 0.1
870 0.09
871 0.08
872 0.08
873 0.09
874 0.09
875 0.11
876 0.14
877 0.23
878 0.3
879 0.36
880 0.4
881 0.43
882 0.46
883 0.47
884 0.49
885 0.47
886 0.43
887 0.4
888 0.39
889 0.39
890 0.37
891 0.35
892 0.29
893 0.22
894 0.19
895 0.16
896 0.12
897 0.09
898 0.09
899 0.07
900 0.07
901 0.07
902 0.1
903 0.12
904 0.14
905 0.15
906 0.16
907 0.16
908 0.16
909 0.17
910 0.17
911 0.23
912 0.21
913 0.21
914 0.25
915 0.28
916 0.32
917 0.32
918 0.3
919 0.27
920 0.31
921 0.35
922 0.31
923 0.31
924 0.31
925 0.32
926 0.33
927 0.3
928 0.27
929 0.22
930 0.23
931 0.23
932 0.2
933 0.19
934 0.18
935 0.19
936 0.19
937 0.2
938 0.2
939 0.2
940 0.2
941 0.2
942 0.19
943 0.21
944 0.22
945 0.22
946 0.21
947 0.27
948 0.32
949 0.35
950 0.36
951 0.34
952 0.34