FuNGI

A0A139HQQ4

Protein Details

Accession

A0A139HQQ4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-44	LFMSAKSKMRRPKLSAKEQKKFDRVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-33	KMRRPKLS

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 10.833, mito 5.5, cyto_mito 5.166, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025574 Nucleoporin_FG_rpt IPR024882 NUP58/p45/49
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0008139 F:nuclear localization sequence binding GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF13634 Nucleoporin_FG

Amino Acid Sequences

MAFGRSNSLSLNTGATNSLFMSAKSKMRRPKLSAKEQKKFDRVSAEEPLFAPMPDDVANNGIGGSTFNNTPASNGLASIMFSASIAAAASSSAPAPVSTNPMHRANNSGNNSAQQQQSQAPAGNSLFGPANNAPSTNQTTSLFGNPSNNAQTSQSANTSSLFGGGNNAQSNTTGTTSNLFGGTGNTQSNTTQPAGGTSLFGNNQPSLFGNNSTSNNLFAKPAQPVPPSNLFGASVNPPTNTPGGASLFGASSSTRPAQQTPSLLGATQHAQLSQPGPFGRLSMGQTAGAQPQAASQVTVDNLRPTTRFEDCADNVKQELEEIDKMIKKQEEFARQIEAFLPKHEENVKSLQPDIELIQDKTEDVEQALASGARGVDAQRQLTEKDKKDFQRIERVATNLQLPQGYQYPNSSLSGFGGMYASQQRLQQPQTAPEGEHPSNYDTDLIGNYFMPMASELQKTMANYAGTLSEIEAHLRVIEDSTVMQAQRLAQQGAGMSDQGSGEDSVGMIASTLRIFEEGILQVAGQVGECREGVTRLVLGRLSANGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.16
3	0.15
4	0.13
5	0.15
6	0.13
7	0.13
8	0.16
9	0.2
10	0.27
11	0.33
12	0.41
13	0.47
14	0.57
15	0.66
16	0.7
17	0.76
18	0.79
19	0.84
20	0.87
21	0.88
22	0.87
23	0.87
24	0.89
25	0.86
26	0.79
27	0.73
28	0.72
29	0.65
30	0.62
31	0.61
32	0.53
33	0.46
34	0.43
35	0.41
36	0.32
37	0.27
38	0.23
39	0.13
40	0.14
41	0.13
42	0.13
43	0.11
44	0.11
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.08
49	0.07
50	0.08
51	0.08
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.13
56	0.13
57	0.14
58	0.14
59	0.16
60	0.14
61	0.14
62	0.13
63	0.12
64	0.12
65	0.12
66	0.1
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.04
74	0.04
75	0.04
76	0.04
77	0.05
78	0.05
79	0.05
80	0.05
81	0.06
82	0.08
83	0.09
84	0.14
85	0.16
86	0.21
87	0.26
88	0.32
89	0.34
90	0.33
91	0.38
92	0.38
93	0.46
94	0.45
95	0.43
96	0.39
97	0.38
98	0.4
99	0.39
100	0.34
101	0.26
102	0.24
103	0.23
104	0.25
105	0.25
106	0.25
107	0.21
108	0.22
109	0.21
110	0.2
111	0.17
112	0.16
113	0.14
114	0.11
115	0.16
116	0.13
117	0.17
118	0.16
119	0.17
120	0.16
121	0.2
122	0.26
123	0.23
124	0.25
125	0.21
126	0.23
127	0.24
128	0.27
129	0.23
130	0.19
131	0.21
132	0.2
133	0.22
134	0.23
135	0.22
136	0.2
137	0.2
138	0.21
139	0.21
140	0.22
141	0.2
142	0.18
143	0.18
144	0.17
145	0.17
146	0.15
147	0.14
148	0.11
149	0.1
150	0.11
151	0.11
152	0.14
153	0.13
154	0.14
155	0.12
156	0.13
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.11
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.1
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.1
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.12
176	0.14
177	0.13
178	0.12
179	0.11
180	0.12
181	0.13
182	0.13
183	0.12
184	0.1
185	0.11
186	0.11
187	0.12
188	0.13
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.17
198	0.18
199	0.2
200	0.2
201	0.19
202	0.19
203	0.19
204	0.17
205	0.14
206	0.15
207	0.15
208	0.17
209	0.2
210	0.21
211	0.21
212	0.25
213	0.29
214	0.28
215	0.26
216	0.24
217	0.2
218	0.18
219	0.19
220	0.16
221	0.14
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.14
226	0.14
227	0.12
228	0.1
229	0.09
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.06
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.09
242	0.1
243	0.12
244	0.15
245	0.17
246	0.18
247	0.17
248	0.19
249	0.17
250	0.16
251	0.15
252	0.13
253	0.12
254	0.13
255	0.11
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.11
270	0.12
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.09
276	0.08
277	0.06
278	0.06
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.07
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.16
293	0.16
294	0.18
295	0.18
296	0.24
297	0.24
298	0.3
299	0.29
300	0.26
301	0.24
302	0.22
303	0.2
304	0.14
305	0.14
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.12
310	0.13
311	0.14
312	0.17
313	0.19
314	0.16
315	0.22
316	0.28
317	0.33
318	0.35
319	0.36
320	0.38
321	0.36
322	0.36
323	0.32
324	0.3
325	0.23
326	0.2
327	0.25
328	0.19
329	0.23
330	0.26
331	0.24
332	0.22
333	0.27
334	0.28
335	0.24
336	0.24
337	0.22
338	0.18
339	0.18
340	0.16
341	0.16
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.15
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.09
350	0.07
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.11
363	0.13
364	0.14
365	0.15
366	0.17
367	0.18
368	0.26
369	0.34
370	0.34
371	0.37
372	0.44
373	0.47
374	0.55
375	0.61
376	0.57
377	0.6
378	0.57
379	0.57
380	0.53
381	0.51
382	0.43
383	0.38
384	0.35
385	0.25
386	0.25
387	0.2
388	0.16
389	0.15
390	0.18
391	0.18
392	0.17
393	0.17
394	0.18
395	0.2
396	0.21
397	0.19
398	0.15
399	0.15
400	0.15
401	0.13
402	0.11
403	0.1
404	0.08
405	0.1
406	0.12
407	0.13
408	0.13
409	0.16
410	0.19
411	0.25
412	0.27
413	0.31
414	0.31
415	0.34
416	0.38
417	0.37
418	0.34
419	0.34
420	0.39
421	0.33
422	0.32
423	0.3
424	0.26
425	0.25
426	0.25
427	0.21
428	0.13
429	0.14
430	0.13
431	0.12
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.09
440	0.12
441	0.13
442	0.13
443	0.15
444	0.17
445	0.17
446	0.17
447	0.19
448	0.16
449	0.15
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.12
469	0.12
470	0.12
471	0.12
472	0.14
473	0.19
474	0.22
475	0.2
476	0.18
477	0.19
478	0.19
479	0.2
480	0.19
481	0.14
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.09
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.12
504	0.11
505	0.13
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.12
511	0.08
512	0.09
513	0.08
514	0.1
515	0.1
516	0.11
517	0.11
518	0.13
519	0.14
520	0.14
521	0.17
522	0.16
523	0.19
524	0.18
525	0.17
526	0.18

A0A139HQQ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer