Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HL21

Protein Details
Accession A0A139HL21    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-360MLTTKEQKKLRRQRRMADMKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-50RKKRETAEKMAALKAKIAANRP
347-354KKLRRQRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MTGKRPHEANGADGDAKRQRMGEETELERKKRETAEKMAALKAKIAANRPNGGGPAPAAMPMRAPPPPAAPADDQAAKQAEAKRKIAELKAKMAVKSGGASTAPAPQSQQMTEQQRQMAEARARAAEIARRKPASPAVAAPPPRTDVRGARGGLGIGLHPSLMGDASADKGKGAQQGPKFSTVKGNREPEKPKLNPYLAEVQPEQQQENEDPSFAPTARRYAERKSRQLLFSQKGKYMAQANALRQQAKLEEMKRRIAAETRKAEIEEASDKSFLVPAPPDIEWWDEGLLPEGQNSYENWETPGRNKIETEDSIITALIQRPVLLQAPQDKFLPGPKPLMLTTKEQKKLRRQRRMADMKEEQAKIRLGLIEPPPPKVKKSNMMRVLGEQAVKDPTAVEARVNREIAQRANDHEKANADRALTAEQRAEKLKQQQAGDEAKGVKVAVFRVDDLSSGKHRYQVDINAKQNGLTGIVILNPTMNLVIVEGGSHSITAYKKLMLKRVKWQENTAPPPDNEPTTFTGFTDGSINDINKGTRGQGSKAQEWCHPLDQDGNLKDLSHNQCLLVWEGDEAARVFKRWGSRACETDGEAKDVLSKTKMENMWTLARNKKPEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.35
4 0.33
5 0.29
6 0.27
7 0.29
8 0.35
9 0.35
10 0.36
11 0.4
12 0.48
13 0.53
14 0.54
15 0.52
16 0.48
17 0.48
18 0.5
19 0.54
20 0.51
21 0.54
22 0.62
23 0.66
24 0.67
25 0.67
26 0.63
27 0.53
28 0.48
29 0.43
30 0.37
31 0.34
32 0.37
33 0.39
34 0.41
35 0.44
36 0.43
37 0.41
38 0.38
39 0.35
40 0.29
41 0.22
42 0.18
43 0.15
44 0.16
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.19
53 0.22
54 0.25
55 0.26
56 0.29
57 0.27
58 0.28
59 0.31
60 0.32
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.24
65 0.27
66 0.32
67 0.36
68 0.39
69 0.42
70 0.4
71 0.43
72 0.48
73 0.5
74 0.53
75 0.48
76 0.49
77 0.53
78 0.54
79 0.5
80 0.47
81 0.41
82 0.32
83 0.29
84 0.23
85 0.18
86 0.15
87 0.16
88 0.14
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.22
95 0.22
96 0.25
97 0.26
98 0.34
99 0.38
100 0.4
101 0.4
102 0.38
103 0.39
104 0.36
105 0.36
106 0.32
107 0.3
108 0.28
109 0.26
110 0.25
111 0.24
112 0.24
113 0.23
114 0.27
115 0.32
116 0.36
117 0.38
118 0.38
119 0.41
120 0.45
121 0.42
122 0.37
123 0.34
124 0.32
125 0.37
126 0.39
127 0.37
128 0.33
129 0.33
130 0.31
131 0.29
132 0.28
133 0.25
134 0.28
135 0.33
136 0.32
137 0.3
138 0.3
139 0.27
140 0.24
141 0.2
142 0.14
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.11
159 0.16
160 0.18
161 0.23
162 0.26
163 0.34
164 0.36
165 0.43
166 0.41
167 0.36
168 0.44
169 0.43
170 0.47
171 0.47
172 0.54
173 0.51
174 0.58
175 0.63
176 0.6
177 0.64
178 0.58
179 0.57
180 0.57
181 0.55
182 0.48
183 0.47
184 0.48
185 0.39
186 0.4
187 0.34
188 0.28
189 0.31
190 0.31
191 0.27
192 0.19
193 0.2
194 0.17
195 0.22
196 0.2
197 0.15
198 0.14
199 0.15
200 0.16
201 0.14
202 0.16
203 0.12
204 0.16
205 0.18
206 0.22
207 0.24
208 0.31
209 0.41
210 0.47
211 0.53
212 0.55
213 0.58
214 0.55
215 0.59
216 0.59
217 0.54
218 0.52
219 0.49
220 0.45
221 0.43
222 0.41
223 0.38
224 0.34
225 0.29
226 0.29
227 0.3
228 0.3
229 0.34
230 0.36
231 0.33
232 0.29
233 0.28
234 0.21
235 0.2
236 0.23
237 0.22
238 0.28
239 0.3
240 0.33
241 0.34
242 0.34
243 0.32
244 0.33
245 0.35
246 0.36
247 0.37
248 0.35
249 0.35
250 0.34
251 0.33
252 0.27
253 0.23
254 0.17
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.24
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.24
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.16
314 0.18
315 0.19
316 0.2
317 0.19
318 0.18
319 0.22
320 0.23
321 0.17
322 0.18
323 0.17
324 0.18
325 0.19
326 0.23
327 0.21
328 0.23
329 0.29
330 0.35
331 0.42
332 0.44
333 0.51
334 0.57
335 0.66
336 0.71
337 0.75
338 0.73
339 0.74
340 0.81
341 0.84
342 0.77
343 0.75
344 0.68
345 0.62
346 0.62
347 0.55
348 0.44
349 0.37
350 0.33
351 0.25
352 0.22
353 0.18
354 0.12
355 0.16
356 0.18
357 0.23
358 0.23
359 0.26
360 0.3
361 0.3
362 0.33
363 0.33
364 0.36
365 0.38
366 0.46
367 0.53
368 0.55
369 0.57
370 0.55
371 0.51
372 0.5
373 0.42
374 0.34
375 0.24
376 0.18
377 0.16
378 0.15
379 0.13
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.14
386 0.18
387 0.22
388 0.22
389 0.22
390 0.24
391 0.26
392 0.26
393 0.26
394 0.24
395 0.25
396 0.31
397 0.33
398 0.3
399 0.29
400 0.3
401 0.29
402 0.31
403 0.29
404 0.22
405 0.19
406 0.19
407 0.22
408 0.19
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.19
413 0.21
414 0.22
415 0.24
416 0.32
417 0.35
418 0.37
419 0.37
420 0.37
421 0.4
422 0.42
423 0.38
424 0.33
425 0.28
426 0.23
427 0.23
428 0.21
429 0.15
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.18
440 0.18
441 0.21
442 0.21
443 0.24
444 0.25
445 0.27
446 0.3
447 0.36
448 0.42
449 0.47
450 0.5
451 0.49
452 0.49
453 0.45
454 0.42
455 0.33
456 0.24
457 0.16
458 0.12
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.08
479 0.09
480 0.13
481 0.14
482 0.17
483 0.22
484 0.26
485 0.35
486 0.4
487 0.44
488 0.51
489 0.61
490 0.66
491 0.65
492 0.68
493 0.69
494 0.71
495 0.73
496 0.68
497 0.63
498 0.54
499 0.55
500 0.52
501 0.45
502 0.36
503 0.33
504 0.31
505 0.31
506 0.31
507 0.26
508 0.27
509 0.23
510 0.23
511 0.22
512 0.18
513 0.15
514 0.18
515 0.19
516 0.17
517 0.19
518 0.19
519 0.17
520 0.18
521 0.18
522 0.21
523 0.23
524 0.24
525 0.3
526 0.37
527 0.42
528 0.46
529 0.47
530 0.45
531 0.47
532 0.48
533 0.46
534 0.4
535 0.35
536 0.34
537 0.36
538 0.4
539 0.36
540 0.33
541 0.29
542 0.28
543 0.28
544 0.32
545 0.34
546 0.3
547 0.3
548 0.28
549 0.3
550 0.31
551 0.33
552 0.25
553 0.2
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.16
563 0.18
564 0.26
565 0.31
566 0.38
567 0.42
568 0.48
569 0.51
570 0.54
571 0.54
572 0.49
573 0.51
574 0.46
575 0.42
576 0.35
577 0.31
578 0.32
579 0.31
580 0.31
581 0.24
582 0.24
583 0.23
584 0.31
585 0.33
586 0.31
587 0.34
588 0.36
589 0.42
590 0.45
591 0.51
592 0.51
593 0.56