Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IUD0

Protein Details
Accession A0A139IUD0    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30GLKGPAKRAPRGPKVPQENAARHydrophilic
334-354ERSRIKAKREAKRKEHMRLREBasic
543-562MSDAPKRGRGRPKQPKEAPEBasic
707-736TGNDRGRGRKGKKPHKSKGKKRSRMGDGTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22RLGGLKGPAKRAPRGPK
335-352RSRIKAKREAKRKEHMRL
548-557KRGRGRPKQP
708-730GNDRGRGRKGKKPHKSKGKKRSR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MPTPRRLGGLKGPAKRAPRGPKVPQENAARTCPSCKGTDLAEDDGQLICKNCYTQVAESNIVSDVTFQDAANGRATVQGGTVADNSRHARTLGAGAYRKVGGGERNTLADIQHAGKKALEALTPKLPIEETVAMQANQIWTLAANINFSAGRKTDEVVAACLYAACRRQKQNKILLMDIAELVKINVFRLGEVYKDMCRELYFNNESVGQQHLVDLEPLIYKYCDKLQFGSKTQDVAADALKIIKRMNRDWIVSGRHPAGLCGACIILAARMNNFQRTVREVVFVSKVADITIAKRVEEFRRTKSAGLTVEQFREYGNRMVYQHDPPSRYAEEERSRIKAKREAKRKEHMRLREERASQQPVVIPDDTTDASSRLSSLEPRTPVPEDGSPPRVSMIPVPPAAPPMLPPPDSTHHSSSAEPGPGQLETPPATQDTGKRKRDDKDDGSVAASPTSGEGTPYDRYEAPKRARLAAPVTEDPSLQPQSEMPTAAKPSQSQSAYQDWRMREDGFIGPPRSQRNDAADSSLRDTRQSSVILDTRESSVMSDAPKRGRGRPKQPKEAPEVDISQEELDVETYLEDQIDRFLADGEVQESKNEVDKLKEEERILQEEKRAAILAEQQRQIDLDKARKDRENRGVQFFGAIPEWNPGDKLDAADLEMEFENDAEVANCLLSPEEVKIKSQIWVAHNEDWLRKQAEKDMLAKVAKATGNDRGRGRKGKKPHKSKGKKRSRMGDGTVITESSTPIETPADAARAMLEKRAPMKSQFVDFSALQRIYGRTPSRASSITPGPSQTPSRQGSVVSERAPSGSPAPSHQEAHSPSGQSDEGDFEITEETLTQAYGNVDGANWNNFQPRNNTQDDEAADDDDDDDELIEDVINNGGGGGVQDEFGGEQDEFGRLDDGYETDGDEYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.66
3 0.66
4 0.66
5 0.68
6 0.71
7 0.74
8 0.78
9 0.82
10 0.82
11 0.81
12 0.8
13 0.78
14 0.73
15 0.69
16 0.63
17 0.55
18 0.53
19 0.5
20 0.44
21 0.37
22 0.35
23 0.32
24 0.3
25 0.35
26 0.36
27 0.35
28 0.33
29 0.31
30 0.3
31 0.28
32 0.26
33 0.2
34 0.17
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.19
40 0.23
41 0.25
42 0.31
43 0.35
44 0.36
45 0.35
46 0.35
47 0.3
48 0.26
49 0.22
50 0.16
51 0.11
52 0.12
53 0.14
54 0.12
55 0.17
56 0.19
57 0.21
58 0.22
59 0.21
60 0.17
61 0.19
62 0.2
63 0.15
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.21
72 0.24
73 0.23
74 0.25
75 0.23
76 0.21
77 0.21
78 0.25
79 0.23
80 0.28
81 0.29
82 0.28
83 0.3
84 0.3
85 0.28
86 0.24
87 0.23
88 0.21
89 0.23
90 0.28
91 0.27
92 0.28
93 0.29
94 0.28
95 0.25
96 0.21
97 0.2
98 0.17
99 0.2
100 0.2
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.2
108 0.23
109 0.28
110 0.29
111 0.28
112 0.26
113 0.24
114 0.21
115 0.24
116 0.22
117 0.17
118 0.2
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.09
127 0.07
128 0.09
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.12
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.22
143 0.22
144 0.21
145 0.21
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.13
150 0.13
151 0.17
152 0.22
153 0.29
154 0.38
155 0.48
156 0.57
157 0.66
158 0.72
159 0.73
160 0.71
161 0.65
162 0.58
163 0.5
164 0.41
165 0.33
166 0.24
167 0.16
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.15
180 0.17
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.24
193 0.23
194 0.22
195 0.24
196 0.16
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.18
211 0.21
212 0.22
213 0.25
214 0.32
215 0.38
216 0.41
217 0.45
218 0.4
219 0.37
220 0.35
221 0.34
222 0.26
223 0.21
224 0.18
225 0.12
226 0.11
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.19
233 0.21
234 0.3
235 0.31
236 0.32
237 0.35
238 0.39
239 0.43
240 0.4
241 0.42
242 0.34
243 0.32
244 0.3
245 0.27
246 0.26
247 0.2
248 0.18
249 0.14
250 0.13
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.14
259 0.16
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.2
264 0.24
265 0.27
266 0.23
267 0.24
268 0.22
269 0.23
270 0.24
271 0.22
272 0.19
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.13
277 0.1
278 0.1
279 0.16
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.2
284 0.24
285 0.32
286 0.34
287 0.33
288 0.4
289 0.42
290 0.42
291 0.4
292 0.41
293 0.34
294 0.32
295 0.32
296 0.27
297 0.27
298 0.26
299 0.24
300 0.19
301 0.18
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.21
308 0.24
309 0.26
310 0.3
311 0.31
312 0.32
313 0.3
314 0.35
315 0.33
316 0.32
317 0.31
318 0.32
319 0.33
320 0.37
321 0.38
322 0.37
323 0.41
324 0.41
325 0.44
326 0.43
327 0.47
328 0.52
329 0.59
330 0.65
331 0.68
332 0.75
333 0.79
334 0.81
335 0.8
336 0.79
337 0.77
338 0.75
339 0.75
340 0.72
341 0.66
342 0.61
343 0.59
344 0.55
345 0.48
346 0.4
347 0.35
348 0.29
349 0.29
350 0.24
351 0.17
352 0.13
353 0.15
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.07
362 0.08
363 0.1
364 0.13
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.22
369 0.22
370 0.23
371 0.22
372 0.21
373 0.2
374 0.23
375 0.26
376 0.24
377 0.22
378 0.22
379 0.2
380 0.18
381 0.18
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.18
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.14
390 0.11
391 0.12
392 0.15
393 0.14
394 0.15
395 0.18
396 0.22
397 0.25
398 0.28
399 0.26
400 0.26
401 0.27
402 0.26
403 0.26
404 0.25
405 0.22
406 0.18
407 0.16
408 0.14
409 0.12
410 0.12
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.16
420 0.25
421 0.33
422 0.38
423 0.41
424 0.46
425 0.5
426 0.56
427 0.59
428 0.53
429 0.49
430 0.46
431 0.43
432 0.39
433 0.35
434 0.28
435 0.19
436 0.15
437 0.08
438 0.06
439 0.07
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.12
447 0.12
448 0.15
449 0.2
450 0.27
451 0.28
452 0.32
453 0.33
454 0.35
455 0.35
456 0.35
457 0.33
458 0.29
459 0.3
460 0.26
461 0.26
462 0.22
463 0.21
464 0.19
465 0.2
466 0.17
467 0.13
468 0.12
469 0.1
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.11
474 0.12
475 0.14
476 0.15
477 0.16
478 0.14
479 0.15
480 0.2
481 0.2
482 0.19
483 0.21
484 0.27
485 0.28
486 0.31
487 0.34
488 0.29
489 0.31
490 0.32
491 0.28
492 0.21
493 0.21
494 0.19
495 0.18
496 0.22
497 0.21
498 0.21
499 0.24
500 0.27
501 0.28
502 0.29
503 0.28
504 0.29
505 0.32
506 0.31
507 0.32
508 0.31
509 0.28
510 0.29
511 0.29
512 0.24
513 0.2
514 0.2
515 0.17
516 0.18
517 0.17
518 0.15
519 0.16
520 0.19
521 0.19
522 0.18
523 0.18
524 0.16
525 0.16
526 0.15
527 0.11
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.14
532 0.16
533 0.18
534 0.24
535 0.26
536 0.33
537 0.42
538 0.49
539 0.57
540 0.65
541 0.72
542 0.76
543 0.8
544 0.78
545 0.76
546 0.71
547 0.63
548 0.55
549 0.47
550 0.38
551 0.32
552 0.27
553 0.19
554 0.14
555 0.11
556 0.08
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.09
576 0.1
577 0.09
578 0.1
579 0.1
580 0.14
581 0.15
582 0.14
583 0.14
584 0.16
585 0.22
586 0.25
587 0.28
588 0.25
589 0.29
590 0.32
591 0.35
592 0.35
593 0.31
594 0.3
595 0.29
596 0.29
597 0.23
598 0.21
599 0.15
600 0.14
601 0.2
602 0.24
603 0.28
604 0.29
605 0.28
606 0.28
607 0.29
608 0.29
609 0.26
610 0.24
611 0.25
612 0.31
613 0.35
614 0.39
615 0.45
616 0.49
617 0.53
618 0.58
619 0.62
620 0.59
621 0.61
622 0.58
623 0.51
624 0.48
625 0.39
626 0.31
627 0.21
628 0.17
629 0.11
630 0.12
631 0.13
632 0.11
633 0.11
634 0.1
635 0.12
636 0.12
637 0.12
638 0.11
639 0.1
640 0.1
641 0.11
642 0.1
643 0.1
644 0.09
645 0.09
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.05
650 0.06
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.07
661 0.13
662 0.14
663 0.15
664 0.18
665 0.19
666 0.21
667 0.23
668 0.27
669 0.24
670 0.3
671 0.34
672 0.34
673 0.36
674 0.36
675 0.36
676 0.32
677 0.35
678 0.31
679 0.28
680 0.26
681 0.3
682 0.34
683 0.35
684 0.37
685 0.35
686 0.38
687 0.37
688 0.36
689 0.29
690 0.27
691 0.25
692 0.23
693 0.22
694 0.26
695 0.3
696 0.35
697 0.39
698 0.41
699 0.47
700 0.56
701 0.59
702 0.57
703 0.64
704 0.7
705 0.76
706 0.8
707 0.83
708 0.85
709 0.9
710 0.93
711 0.94
712 0.94
713 0.93
714 0.91
715 0.91
716 0.88
717 0.85
718 0.79
719 0.77
720 0.67
721 0.6
722 0.51
723 0.41
724 0.32
725 0.24
726 0.2
727 0.12
728 0.12
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.11
734 0.12
735 0.12
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.14
740 0.14
741 0.16
742 0.16
743 0.18
744 0.23
745 0.28
746 0.29
747 0.29
748 0.36
749 0.36
750 0.39
751 0.38
752 0.35
753 0.35
754 0.32
755 0.32
756 0.32
757 0.29
758 0.24
759 0.24
760 0.25
761 0.23
762 0.31
763 0.3
764 0.28
765 0.31
766 0.33
767 0.35
768 0.34
769 0.34
770 0.32
771 0.35
772 0.35
773 0.34
774 0.33
775 0.31
776 0.35
777 0.37
778 0.35
779 0.38
780 0.36
781 0.37
782 0.36
783 0.34
784 0.36
785 0.38
786 0.39
787 0.32
788 0.31
789 0.29
790 0.29
791 0.29
792 0.25
793 0.21
794 0.2
795 0.2
796 0.21
797 0.28
798 0.3
799 0.32
800 0.31
801 0.35
802 0.34
803 0.39
804 0.4
805 0.34
806 0.3
807 0.32
808 0.31
809 0.24
810 0.22
811 0.19
812 0.16
813 0.16
814 0.15
815 0.12
816 0.13
817 0.12
818 0.11
819 0.08
820 0.08
821 0.07
822 0.07
823 0.07
824 0.07
825 0.08
826 0.09
827 0.09
828 0.08
829 0.08
830 0.11
831 0.13
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.22
836 0.24
837 0.27
838 0.32
839 0.36
840 0.4
841 0.44
842 0.45
843 0.41
844 0.45
845 0.43
846 0.4
847 0.35
848 0.3
849 0.24
850 0.22
851 0.2
852 0.15
853 0.13
854 0.08
855 0.07
856 0.06
857 0.06
858 0.06
859 0.06
860 0.05
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.05
865 0.05
866 0.05
867 0.05
868 0.05
869 0.06
870 0.05
871 0.05
872 0.05
873 0.06
874 0.06
875 0.07
876 0.09
877 0.08
878 0.08
879 0.09
880 0.11
881 0.11
882 0.12
883 0.12
884 0.1
885 0.11
886 0.11
887 0.11
888 0.12
889 0.12
890 0.12