FuNGI

A0A139I3W9

Protein Details

Accession

A0A139I3W9

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-31	MAKDKAAKVAQKKDEGKKSKKAAKSASKESG	Hydrophilic
50-79	KVERMSKTSEDKPSKKKRKAPVALPPPREP	Basic
440-466	DKPDLETPKVKKSKKKQRSEDVEMVNG	Hydrophilic
495-516	LSKEERRVRKEESRAKKEAKVR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-27	AAKVAQKKDEGKKSKKAAKSAS
60-71	DKPSKKKRKAPV
187-198	PAAAAKAIPKKP
448-456	KVKKSKKKQ
486-516	AERPGPKDGLSKEERRVRKEESRAKKEAKVR

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAKDKAAKVAQKKDEGKKSKKAAKSASKESGLSAERVVDSESEQEAKDAKVERMSKTSEDKPSKKKRKAPVALPPPREPTPSESSDEEEPDSDEEMPDAPIVPKRPDSIPVKVNGVKRKAENQRSPNDGESSDKEESDESTDLGAKRVKTAAAEEDAGHSSDEEETDSESSEEVKEEKASRTASKAPAAAAKAIPKKPAAPVKEEEKGSDSSTKSSDEEETDAEEEKKQCQEARPASQGTARMARTEAVPVRQFKPPHGHSESSVTGSILPAASMTGKQIWTITAPSNFPIKALKEIAPDSISSGLPVLEHNGINYCLNKNESNGNEIGTAVLPSKNSYDTVLQKISRRLALQRKIDLPDLSAKQADSATGSKAAADVAVPPVSTARPQPKGMRMRYKPPGFGAGDPGLGSDTEDEAPWPTKKDESLRFPKALGAHGGSDKPDLETPKVKKSKKKQRSEDVEMVNGHEPVPPSELKLSKSISKESAERPGPKDGLSKEERRVRKEESRAKKEAKVRSTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.83
3	0.82
4	0.82
5	0.85
6	0.84
7	0.82
8	0.81
9	0.81
10	0.82
11	0.82
12	0.81
13	0.8
14	0.74
15	0.67
16	0.59
17	0.56
18	0.47
19	0.4
20	0.31
21	0.25
22	0.22
23	0.22
24	0.21
25	0.15
26	0.14
27	0.16
28	0.17
29	0.16
30	0.16
31	0.16
32	0.17
33	0.17
34	0.2
35	0.2
36	0.21
37	0.27
38	0.31
39	0.33
40	0.37
41	0.4
42	0.4
43	0.44
44	0.49
45	0.52
46	0.58
47	0.63
48	0.68
49	0.76
50	0.83
51	0.85
52	0.87
53	0.87
54	0.88
55	0.89
56	0.88
57	0.87
58	0.88
59	0.87
60	0.85
61	0.8
62	0.75
63	0.68
64	0.61
65	0.52
66	0.48
67	0.45
68	0.42
69	0.41
70	0.36
71	0.37
72	0.37
73	0.36
74	0.3
75	0.24
76	0.21
77	0.19
78	0.18
79	0.15
80	0.12
81	0.11
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.13
88	0.16
89	0.19
90	0.21
91	0.23
92	0.25
93	0.31
94	0.35
95	0.38
96	0.4
97	0.39
98	0.44
99	0.46
100	0.51
101	0.51
102	0.51
103	0.49
104	0.48
105	0.55
106	0.59
107	0.64
108	0.67
109	0.67
110	0.69
111	0.7
112	0.69
113	0.63
114	0.55
115	0.45
116	0.4
117	0.35
118	0.34
119	0.3
120	0.27
121	0.24
122	0.22
123	0.22
124	0.22
125	0.19
126	0.12
127	0.12
128	0.16
129	0.15
130	0.18
131	0.2
132	0.16
133	0.17
134	0.18
135	0.18
136	0.16
137	0.18
138	0.18
139	0.18
140	0.19
141	0.17
142	0.18
143	0.18
144	0.18
145	0.15
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.08
162	0.11
163	0.13
164	0.14
165	0.17
166	0.2
167	0.2
168	0.24
169	0.29
170	0.29
171	0.3
172	0.29
173	0.26
174	0.27
175	0.27
176	0.24
177	0.2
178	0.24
179	0.28
180	0.29
181	0.3
182	0.27
183	0.28
184	0.32
185	0.38
186	0.33
187	0.32
188	0.34
189	0.37
190	0.42
191	0.41
192	0.36
193	0.31
194	0.3
195	0.27
196	0.28
197	0.23
198	0.19
199	0.2
200	0.21
201	0.18
202	0.18
203	0.18
204	0.14
205	0.15
206	0.13
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.14
212	0.13
213	0.14
214	0.15
215	0.15
216	0.16
217	0.18
218	0.26
219	0.29
220	0.34
221	0.36
222	0.36
223	0.35
224	0.35
225	0.34
226	0.27
227	0.27
228	0.21
229	0.18
230	0.18
231	0.17
232	0.15
233	0.17
234	0.17
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.27
240	0.27
241	0.26
242	0.33
243	0.32
244	0.36
245	0.38
246	0.36
247	0.33
248	0.37
249	0.35
250	0.28
251	0.26
252	0.18
253	0.14
254	0.13
255	0.12
256	0.07
257	0.06
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.12
273	0.13
274	0.16
275	0.15
276	0.15
277	0.16
278	0.14
279	0.16
280	0.18
281	0.19
282	0.19
283	0.2
284	0.2
285	0.18
286	0.17
287	0.15
288	0.14
289	0.12
290	0.09
291	0.09
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.13
303	0.11
304	0.11
305	0.14
306	0.15
307	0.15
308	0.2
309	0.2
310	0.21
311	0.21
312	0.2
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.1
317	0.09
318	0.07
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.12
326	0.15
327	0.19
328	0.23
329	0.27
330	0.28
331	0.31
332	0.35
333	0.35
334	0.33
335	0.31
336	0.35
337	0.4
338	0.46
339	0.48
340	0.49
341	0.5
342	0.5
343	0.52
344	0.44
345	0.36
346	0.35
347	0.31
348	0.28
349	0.24
350	0.21
351	0.19
352	0.19
353	0.17
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.13
358	0.13
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.16
373	0.22
374	0.26
375	0.3
376	0.36
377	0.44
378	0.53
379	0.6
380	0.65
381	0.62
382	0.67
383	0.73
384	0.72
385	0.66
386	0.59
387	0.58
388	0.49
389	0.45
390	0.42
391	0.33
392	0.29
393	0.25
394	0.23
395	0.16
396	0.13
397	0.13
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.11
404	0.15
405	0.16
406	0.18
407	0.18
408	0.2
409	0.24
410	0.32
411	0.39
412	0.45
413	0.54
414	0.57
415	0.57
416	0.55
417	0.54
418	0.47
419	0.41
420	0.35
421	0.27
422	0.24
423	0.25
424	0.26
425	0.24
426	0.23
427	0.21
428	0.19
429	0.21
430	0.21
431	0.23
432	0.31
433	0.35
434	0.44
435	0.53
436	0.57
437	0.64
438	0.72
439	0.78
440	0.8
441	0.87
442	0.87
443	0.88
444	0.92
445	0.91
446	0.89
447	0.82
448	0.77
449	0.66
450	0.59
451	0.5
452	0.4
453	0.31
454	0.24
455	0.2
456	0.17
457	0.2
458	0.17
459	0.18
460	0.25
461	0.28
462	0.28
463	0.32
464	0.35
465	0.37
466	0.41
467	0.43
468	0.4
469	0.41
470	0.45
471	0.44
472	0.5
473	0.52
474	0.55
475	0.53
476	0.57
477	0.54
478	0.5
479	0.52
480	0.45
481	0.46
482	0.47
483	0.5
484	0.51
485	0.59
486	0.64
487	0.63
488	0.66
489	0.66
490	0.68
491	0.73
492	0.74
493	0.76
494	0.78
495	0.81
496	0.81
497	0.8
498	0.79
499	0.78

A0A139I3W9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer