Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IRW4

Protein Details
Accession A0A139IRW4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-254REQMDKKNGKAKKAKNNHDDQLHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-246AVKKREQMDKKNGKAKKAK
Subcellular Location(s) cyto_mito 8.333, cyto 8, mito 7.5, cyto_nucl 7.333, nucl 5.5, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007667  Hypoxia_induced_domain  
IPR040153  Rcf2  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04588  HIG_1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51503  HIG1  
Amino Acid Sequences MKILTKEEEQEHYNATIKGGIGGGVAGTAAGALGVWAASIRYPAFRSLSLPFRAFLITSSGTFAAIIAADSYSRRFEASRQPDRSYQDEQAQLQEHLDSQKSTKEKITRWCSENRYGLVVGSWVVSISAAMGIVGRNPYLTTQQKIVQARVYAQGFTLAAVIASLAFEGTDRMKGTGRWETVKYLDPNDPTHKNIIEKKIHHERYQGEDQWMDMVAAEEQRMKEREEAVKKREQMDKKNGKAKKAKNNHDDQLHGKPDEGDEKVNAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.22
4 0.19
5 0.19
6 0.16
7 0.13
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.05
12 0.05
13 0.03
14 0.03
15 0.02
16 0.02
17 0.02
18 0.02
19 0.02
20 0.02
21 0.02
22 0.02
23 0.02
24 0.03
25 0.03
26 0.05
27 0.06
28 0.09
29 0.11
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.2
34 0.23
35 0.3
36 0.31
37 0.31
38 0.28
39 0.27
40 0.27
41 0.24
42 0.2
43 0.18
44 0.15
45 0.14
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.04
55 0.04
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.13
64 0.24
65 0.33
66 0.42
67 0.46
68 0.49
69 0.53
70 0.57
71 0.58
72 0.52
73 0.45
74 0.41
75 0.4
76 0.37
77 0.35
78 0.33
79 0.28
80 0.23
81 0.2
82 0.15
83 0.13
84 0.14
85 0.11
86 0.1
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.22
91 0.26
92 0.3
93 0.39
94 0.47
95 0.48
96 0.5
97 0.55
98 0.55
99 0.56
100 0.55
101 0.46
102 0.4
103 0.34
104 0.3
105 0.23
106 0.18
107 0.12
108 0.08
109 0.07
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.02
117 0.02
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.11
127 0.14
128 0.14
129 0.16
130 0.2
131 0.26
132 0.28
133 0.28
134 0.24
135 0.23
136 0.23
137 0.25
138 0.22
139 0.17
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.12
144 0.1
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.04
156 0.04
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.1
161 0.11
162 0.15
163 0.21
164 0.23
165 0.24
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.34
170 0.31
171 0.28
172 0.3
173 0.29
174 0.32
175 0.36
176 0.37
177 0.33
178 0.35
179 0.33
180 0.35
181 0.39
182 0.43
183 0.44
184 0.44
185 0.51
186 0.58
187 0.6
188 0.57
189 0.57
190 0.52
191 0.52
192 0.58
193 0.52
194 0.44
195 0.39
196 0.36
197 0.31
198 0.28
199 0.2
200 0.11
201 0.09
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.16
208 0.17
209 0.19
210 0.21
211 0.26
212 0.35
213 0.43
214 0.5
215 0.51
216 0.58
217 0.6
218 0.63
219 0.66
220 0.65
221 0.65
222 0.68
223 0.73
224 0.74
225 0.79
226 0.77
227 0.77
228 0.79
229 0.79
230 0.78
231 0.79
232 0.8
233 0.81
234 0.86
235 0.84
236 0.8
237 0.75
238 0.7
239 0.68
240 0.64
241 0.55
242 0.47
243 0.4
244 0.38
245 0.39
246 0.35
247 0.29