Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IND0

Protein Details
Accession A0A139IND0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-379LPPPRKLPFNRKKSAPESVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-269TSRKAGASRGGKRKAN
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MTSNADMGGEHDPRVLQTRIMTSQQKEHILRLRRTDHKSEHLLLKIGKIGRRDLDLKLIGTDQYVAFIGSMAEADVKSLQERNYTGDLEEWKTVLRFALLHEKPDGTLPDFLQGVETVAAISGSTSTITVRRNIGGITQRLGSIKLALDKDKDEEIVPMEWVDVAAATSDDLRDQLATLAASVQTQKDQIAKLSTELDMLVKAKREHEDQLLSKFAALLNAKKLKIRDQQRLLNGAKVDAVAAEEISSTRASRTSRKAGASRGGKRKANSAAPRSPEEQQHGDDDDVETVDGTDDADGASRREQITPKPSDADAATDTDGEDEDMVEKSAAGPAASLRSSTGRSQRAGGTTENMELDEDLPPPRKLPFNRKKSAPESVKMPTPPPTSNTNDVEEDAETDDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.19
4 0.21
5 0.26
6 0.3
7 0.37
8 0.42
9 0.4
10 0.47
11 0.5
12 0.55
13 0.51
14 0.54
15 0.56
16 0.58
17 0.61
18 0.62
19 0.65
20 0.65
21 0.71
22 0.73
23 0.71
24 0.7
25 0.71
26 0.68
27 0.66
28 0.6
29 0.58
30 0.5
31 0.45
32 0.42
33 0.4
34 0.37
35 0.33
36 0.34
37 0.32
38 0.36
39 0.37
40 0.33
41 0.36
42 0.36
43 0.34
44 0.3
45 0.29
46 0.24
47 0.21
48 0.21
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.12
66 0.13
67 0.17
68 0.18
69 0.22
70 0.24
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.26
75 0.25
76 0.24
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.14
82 0.11
83 0.08
84 0.11
85 0.21
86 0.21
87 0.23
88 0.24
89 0.24
90 0.24
91 0.26
92 0.26
93 0.17
94 0.19
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.15
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.08
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.09
115 0.11
116 0.13
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.15
121 0.19
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.17
130 0.12
131 0.12
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.18
137 0.2
138 0.19
139 0.18
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.14
192 0.16
193 0.18
194 0.2
195 0.25
196 0.24
197 0.25
198 0.25
199 0.23
200 0.2
201 0.18
202 0.15
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.17
207 0.22
208 0.22
209 0.24
210 0.26
211 0.29
212 0.37
213 0.43
214 0.46
215 0.48
216 0.54
217 0.55
218 0.62
219 0.54
220 0.49
221 0.42
222 0.32
223 0.26
224 0.19
225 0.16
226 0.08
227 0.08
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.09
238 0.12
239 0.18
240 0.25
241 0.31
242 0.36
243 0.4
244 0.43
245 0.44
246 0.5
247 0.53
248 0.56
249 0.58
250 0.6
251 0.59
252 0.57
253 0.59
254 0.57
255 0.57
256 0.56
257 0.54
258 0.53
259 0.53
260 0.56
261 0.52
262 0.5
263 0.45
264 0.42
265 0.37
266 0.33
267 0.31
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.2
272 0.15
273 0.12
274 0.11
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.09
287 0.12
288 0.13
289 0.17
290 0.2
291 0.25
292 0.34
293 0.37
294 0.38
295 0.38
296 0.37
297 0.36
298 0.34
299 0.3
300 0.23
301 0.2
302 0.18
303 0.15
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.09
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.14
326 0.17
327 0.23
328 0.3
329 0.31
330 0.33
331 0.36
332 0.38
333 0.39
334 0.39
335 0.35
336 0.31
337 0.27
338 0.28
339 0.25
340 0.21
341 0.18
342 0.16
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.14
347 0.18
348 0.18
349 0.19
350 0.22
351 0.29
352 0.36
353 0.46
354 0.53
355 0.59
356 0.68
357 0.74
358 0.8
359 0.78
360 0.81
361 0.77
362 0.71
363 0.67
364 0.63
365 0.63
366 0.57
367 0.53
368 0.51
369 0.49
370 0.47
371 0.44
372 0.46
373 0.45
374 0.5
375 0.51
376 0.47
377 0.43
378 0.41
379 0.4
380 0.33
381 0.28
382 0.23
383 0.19