Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IVF1

Protein Details
Accession A0A139IVF1    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-117VHTVYKRREPIRRDSQKRREALQKGKEGSRRRQRWENDRLLSHydrophilic
242-262AMSDKRKREKQHKHLEKDKLVBasic
408-428RENWWTSPEKRAQRQRFELEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-109KRREPIRRDSQKRREALQKGKEGSRRRQR
188-191LKKS
247-251RKREK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5, mito 7, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025952  R3H-assoc_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR039629  R3HDM4  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13902  R3H-assoc  
CDD cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MAIHPEVSNVRVELPPPAISIERVEAWTISQAADVLAATSLSPHAARGTGMSVTIDIPLDEQVLCEEAPRPRPEAVHTVYKRREPIRRDSQKRREALQKGKEGSRRRQRWENDRLLSNPHAAPPLPSDWQVQPTHPVHSVPYFLAPLWDAEYARKQQERQKRVQASKQHASKEEAAAAKVTQELRAKLKKSRGAKGLLQDLEEEVRGFVQQWEQKQKELESEGLIEPDSSDEEIVFVGRNGAMSDKRKREKQHKHLEKDKLVFQGLVDDHGAAFGRYLVHSIAAYYGLKTYSITTGNPARREAYVGLKIDPKTRRPSLTRAEMPRPLWTVSGVFAVVFAMCQLCGIKNGLARWPKAVEAMKPALELLIENAHEEHEAWKKAGASTPSESLLEVCRLLLTMIESIEEERENWWTSPEKRAQRQRFELEDPKKFTELHKINNALTSDVEAMRTRLGSYARWTLDMRGGLADLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.2
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.17
13 0.17
14 0.19
15 0.17
16 0.14
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.09
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.05
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.13
54 0.17
55 0.24
56 0.26
57 0.29
58 0.29
59 0.31
60 0.35
61 0.39
62 0.39
63 0.42
64 0.44
65 0.51
66 0.54
67 0.58
68 0.6
69 0.59
70 0.63
71 0.58
72 0.64
73 0.66
74 0.72
75 0.77
76 0.81
77 0.84
78 0.85
79 0.83
80 0.79
81 0.77
82 0.75
83 0.75
84 0.73
85 0.71
86 0.67
87 0.7
88 0.72
89 0.7
90 0.71
91 0.72
92 0.71
93 0.7
94 0.75
95 0.77
96 0.79
97 0.82
98 0.81
99 0.76
100 0.72
101 0.66
102 0.62
103 0.55
104 0.49
105 0.39
106 0.31
107 0.27
108 0.23
109 0.23
110 0.2
111 0.22
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.21
116 0.27
117 0.27
118 0.25
119 0.29
120 0.29
121 0.3
122 0.28
123 0.27
124 0.23
125 0.23
126 0.24
127 0.17
128 0.17
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.16
139 0.19
140 0.24
141 0.26
142 0.28
143 0.35
144 0.45
145 0.5
146 0.54
147 0.6
148 0.65
149 0.69
150 0.73
151 0.74
152 0.72
153 0.73
154 0.71
155 0.65
156 0.58
157 0.56
158 0.51
159 0.43
160 0.39
161 0.31
162 0.26
163 0.22
164 0.19
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.17
171 0.24
172 0.3
173 0.32
174 0.35
175 0.42
176 0.45
177 0.48
178 0.53
179 0.51
180 0.51
181 0.51
182 0.5
183 0.5
184 0.44
185 0.38
186 0.31
187 0.26
188 0.22
189 0.19
190 0.14
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.1
197 0.13
198 0.18
199 0.27
200 0.28
201 0.29
202 0.31
203 0.31
204 0.28
205 0.27
206 0.24
207 0.15
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.06
229 0.09
230 0.14
231 0.22
232 0.3
233 0.34
234 0.4
235 0.47
236 0.57
237 0.64
238 0.7
239 0.74
240 0.76
241 0.8
242 0.83
243 0.85
244 0.8
245 0.72
246 0.65
247 0.56
248 0.47
249 0.38
250 0.29
251 0.26
252 0.2
253 0.18
254 0.14
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.1
281 0.14
282 0.21
283 0.25
284 0.27
285 0.27
286 0.26
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.24
291 0.25
292 0.24
293 0.25
294 0.28
295 0.29
296 0.34
297 0.36
298 0.36
299 0.38
300 0.41
301 0.46
302 0.45
303 0.52
304 0.53
305 0.57
306 0.6
307 0.58
308 0.6
309 0.59
310 0.56
311 0.53
312 0.47
313 0.39
314 0.32
315 0.26
316 0.21
317 0.16
318 0.16
319 0.12
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.07
332 0.09
333 0.11
334 0.13
335 0.15
336 0.21
337 0.26
338 0.26
339 0.28
340 0.28
341 0.26
342 0.3
343 0.31
344 0.26
345 0.28
346 0.3
347 0.28
348 0.26
349 0.26
350 0.2
351 0.17
352 0.15
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.14
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.2
366 0.21
367 0.23
368 0.27
369 0.26
370 0.24
371 0.26
372 0.28
373 0.27
374 0.26
375 0.25
376 0.21
377 0.21
378 0.18
379 0.14
380 0.12
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.16
397 0.16
398 0.18
399 0.24
400 0.26
401 0.35
402 0.43
403 0.49
404 0.57
405 0.68
406 0.74
407 0.77
408 0.83
409 0.82
410 0.8
411 0.78
412 0.78
413 0.76
414 0.75
415 0.71
416 0.66
417 0.6
418 0.55
419 0.49
420 0.5
421 0.48
422 0.47
423 0.5
424 0.5
425 0.5
426 0.54
427 0.52
428 0.42
429 0.36
430 0.3
431 0.24
432 0.21
433 0.22
434 0.18
435 0.18
436 0.18
437 0.18
438 0.16
439 0.17
440 0.19
441 0.19
442 0.24
443 0.32
444 0.31
445 0.34
446 0.35
447 0.34
448 0.38
449 0.36
450 0.32
451 0.24