Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139I8M5

Protein Details
Accession A0A139I8M5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49PTARPDSAVKRPNPKPRKSSALRQSFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-39NPKPR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MKKSMSARRVPRKVGGDDEEDVPTARPDSAVKRPNPKPRKSSALRQSFGPSAEDDDEDSEAVVTPKRKNLSRIAVHQNAAKRSSLLATSLPKGETDGEYERPSYCAASLQQLKDSTPSTPQNFSSATTTDVEDVSPETQSLDLSSKFGSSLARYQQSSASSAIPSATEIAEKKARRARLAKEQQAEEYISLDPDDPDLDEEDLDPNVMRDEHGKLVLKPKDKYGMSETRLVHDDEDIMENFDEFTEDGRISLGRKAEAEAERKRRQDMAAQIAEAEGATDDESDDSERERRDAYEATQTKHGSYARNTADSEGPDQRPKTPPIITPLPTLDGAIERLRKQLSDMQTSRMQKLQDMENLQREKIRLAEEEVRIQRALKETAEKFEQLRKDKGISADKEAVPAIEAPAVLKTNGVRGTDTPKNQDMVDADDEEPDRPSFGGAGFGAGLGFASGRSGVGVKTKGTGEDQDDDEEEEEDTGPAFCGLGFAGASCNIEGFGMGFKKASDQDGGDGVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.64
3 0.58
4 0.52
5 0.49
6 0.42
7 0.35
8 0.31
9 0.24
10 0.2
11 0.16
12 0.14
13 0.12
14 0.15
15 0.21
16 0.3
17 0.38
18 0.44
19 0.53
20 0.62
21 0.72
22 0.79
23 0.81
24 0.8
25 0.79
26 0.83
27 0.8
28 0.82
29 0.81
30 0.81
31 0.73
32 0.68
33 0.65
34 0.58
35 0.52
36 0.43
37 0.33
38 0.27
39 0.28
40 0.25
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.13
50 0.16
51 0.19
52 0.25
53 0.31
54 0.35
55 0.4
56 0.48
57 0.54
58 0.57
59 0.63
60 0.66
61 0.66
62 0.63
63 0.62
64 0.59
65 0.54
66 0.48
67 0.4
68 0.31
69 0.27
70 0.27
71 0.23
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.23
76 0.25
77 0.24
78 0.21
79 0.22
80 0.22
81 0.18
82 0.2
83 0.21
84 0.22
85 0.24
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.22
90 0.18
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.21
95 0.27
96 0.28
97 0.31
98 0.32
99 0.32
100 0.31
101 0.31
102 0.24
103 0.25
104 0.3
105 0.29
106 0.32
107 0.32
108 0.33
109 0.32
110 0.33
111 0.29
112 0.23
113 0.22
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.16
118 0.14
119 0.11
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.16
138 0.21
139 0.25
140 0.25
141 0.26
142 0.29
143 0.29
144 0.28
145 0.24
146 0.2
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.13
157 0.19
158 0.19
159 0.25
160 0.3
161 0.33
162 0.37
163 0.43
164 0.45
165 0.5
166 0.6
167 0.61
168 0.61
169 0.59
170 0.54
171 0.49
172 0.44
173 0.33
174 0.24
175 0.17
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.09
198 0.1
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.24
203 0.29
204 0.33
205 0.31
206 0.33
207 0.37
208 0.36
209 0.37
210 0.36
211 0.39
212 0.36
213 0.42
214 0.4
215 0.35
216 0.36
217 0.33
218 0.26
219 0.18
220 0.16
221 0.1
222 0.12
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.15
244 0.18
245 0.24
246 0.28
247 0.37
248 0.42
249 0.43
250 0.44
251 0.4
252 0.38
253 0.37
254 0.36
255 0.35
256 0.3
257 0.29
258 0.27
259 0.25
260 0.24
261 0.18
262 0.12
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.23
282 0.25
283 0.26
284 0.31
285 0.31
286 0.28
287 0.3
288 0.3
289 0.24
290 0.23
291 0.3
292 0.27
293 0.29
294 0.29
295 0.27
296 0.27
297 0.25
298 0.26
299 0.24
300 0.24
301 0.26
302 0.26
303 0.29
304 0.31
305 0.32
306 0.33
307 0.3
308 0.31
309 0.33
310 0.38
311 0.36
312 0.34
313 0.33
314 0.3
315 0.27
316 0.24
317 0.18
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.16
322 0.15
323 0.18
324 0.18
325 0.18
326 0.2
327 0.24
328 0.26
329 0.32
330 0.33
331 0.34
332 0.41
333 0.44
334 0.43
335 0.39
336 0.34
337 0.27
338 0.29
339 0.29
340 0.28
341 0.3
342 0.32
343 0.37
344 0.38
345 0.37
346 0.36
347 0.32
348 0.27
349 0.26
350 0.24
351 0.17
352 0.21
353 0.28
354 0.28
355 0.35
356 0.36
357 0.35
358 0.32
359 0.31
360 0.28
361 0.25
362 0.26
363 0.19
364 0.26
365 0.25
366 0.29
367 0.31
368 0.31
369 0.29
370 0.33
371 0.39
372 0.36
373 0.4
374 0.38
375 0.38
376 0.4
377 0.45
378 0.48
379 0.43
380 0.44
381 0.46
382 0.43
383 0.42
384 0.38
385 0.31
386 0.23
387 0.21
388 0.15
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.14
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.19
402 0.27
403 0.33
404 0.37
405 0.37
406 0.37
407 0.37
408 0.35
409 0.36
410 0.3
411 0.28
412 0.27
413 0.24
414 0.22
415 0.23
416 0.24
417 0.21
418 0.22
419 0.17
420 0.15
421 0.12
422 0.12
423 0.1
424 0.09
425 0.12
426 0.1
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.08
432 0.07
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.07
442 0.13
443 0.15
444 0.15
445 0.18
446 0.19
447 0.21
448 0.23
449 0.26
450 0.25
451 0.28
452 0.29
453 0.28
454 0.28
455 0.27
456 0.25
457 0.21
458 0.17
459 0.13
460 0.12
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.09
477 0.1
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.12
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.13
487 0.18
488 0.2
489 0.23
490 0.21
491 0.21
492 0.23