Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IMF5

Protein Details
Accession A0A139IMF5    Localization Confidence Low Confidence Score 5.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-123FLKAVHPHGRKRKIRCHNLIWHSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 22, vacu 2, nucl 1, mito 1, plas 1, mito_nucl 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044846  GH10  
IPR031158  GH10_AS  
IPR001000  GH10_dom  
IPR017853  Glycoside_hydrolase_SF  
Gene Ontology GO:0031176  F:endo-1,4-beta-xylanase activity  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00331  Glyco_hydro_10  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00591  GH10_1  
PS51760  GH10_2  
Amino Acid Sequences MVMHLPSTLLLGALATSSLASPKPPDRHHGLNLAAKAAGKLWFGTAADIPGPAGEQQDPYYMKQLLHYKDFGEVTPGNSMKYLYTEPEQGVFNYSDANTFLKAVHPHGRKRKIRCHNLIWHSEIPDWVTKPATPWTNETLSAALVNHVQNLVEYFGNTCYSWDVVNEALSDSSSDPAYPYRSVGNPWYQYIGPEYIPMAFKAAADTIRKCNLDVKLYYNDYNIENAGNKSTAAQNLVKELQSRGIQIDGMGLESHFTAGDTPSQSAQESNMNAFTALGIDVAVTELDVRIVLPTNATNLKQQAQDYYNTVAACTNVERCVGITVWDFLDTYSWIPIYFKGQGSADIWYQKNGTAGTPLIRKDGIYFALMQALTGRPFSYGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.07
6 0.07
7 0.09
8 0.14
9 0.23
10 0.32
11 0.35
12 0.41
13 0.47
14 0.54
15 0.57
16 0.59
17 0.57
18 0.55
19 0.53
20 0.47
21 0.41
22 0.34
23 0.29
24 0.24
25 0.2
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.09
38 0.1
39 0.08
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.18
45 0.2
46 0.21
47 0.25
48 0.25
49 0.25
50 0.29
51 0.36
52 0.35
53 0.37
54 0.37
55 0.32
56 0.35
57 0.35
58 0.29
59 0.27
60 0.23
61 0.21
62 0.26
63 0.26
64 0.22
65 0.21
66 0.22
67 0.16
68 0.18
69 0.18
70 0.14
71 0.16
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.21
76 0.18
77 0.2
78 0.17
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.27
92 0.32
93 0.4
94 0.5
95 0.6
96 0.64
97 0.71
98 0.77
99 0.79
100 0.83
101 0.83
102 0.81
103 0.81
104 0.81
105 0.76
106 0.71
107 0.63
108 0.54
109 0.47
110 0.38
111 0.3
112 0.26
113 0.22
114 0.18
115 0.16
116 0.14
117 0.15
118 0.2
119 0.22
120 0.21
121 0.23
122 0.26
123 0.27
124 0.27
125 0.26
126 0.21
127 0.17
128 0.16
129 0.13
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.16
171 0.21
172 0.2
173 0.2
174 0.21
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.12
192 0.14
193 0.16
194 0.2
195 0.2
196 0.2
197 0.24
198 0.24
199 0.26
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.29
204 0.29
205 0.25
206 0.24
207 0.2
208 0.2
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.14
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.08
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.11
282 0.15
283 0.16
284 0.18
285 0.2
286 0.24
287 0.26
288 0.26
289 0.29
290 0.28
291 0.29
292 0.29
293 0.29
294 0.28
295 0.25
296 0.24
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.13
305 0.13
306 0.15
307 0.13
308 0.14
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.13
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.16
324 0.2
325 0.19
326 0.21
327 0.22
328 0.24
329 0.24
330 0.26
331 0.25
332 0.27
333 0.27
334 0.26
335 0.26
336 0.25
337 0.27
338 0.24
339 0.22
340 0.18
341 0.19
342 0.23
343 0.27
344 0.27
345 0.27
346 0.27
347 0.26
348 0.26
349 0.28
350 0.24
351 0.21
352 0.21
353 0.18
354 0.23
355 0.22
356 0.19
357 0.17
358 0.18
359 0.17
360 0.17
361 0.17