FuNGI

A0A139IH60

Protein Details

Accession

A0A139IH60

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
435-463	AERERQAEKKRLKKREARKRKVENAADET	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
238-246	RKRELAARR
439-455	RQAEKKRLKKREARKRK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007900 TAF4_C
Gene Ontology	GO:0005669 C:transcription factor TFIID complex GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF05236 TAF4

Amino Acid Sequences

MAYQMSPPAQQPLKPPPQPYAPYQGAGSPGAQSPFAQPPAKRPRLSPDPRSPAGGSPMYAQSPMQYSNPYGPQSASPMPYSPQSYAASPQNSFNTPQPYSPPVQWPAPQQQPQQRPPQISPPPPSSSNSMPPPPRPNKEDKDERMGVEDIGDSLFGSGINLKDEENYLHSTWNNRHSQNESFNTTQTTSFGSSTMSPNNSFNLLTQGTSFGSAGQDGAFAGSMGQPRSQEEIENEQKRKRELAARRRAEKDQFHLNNQFLQTNCLRHRMHQRAAQESVRLNVEGVYVRNPEPDRVQTMLNANGSEGIVAAKPEAMIEQGSVYEHILTLVSLASAERLRGLVDEAYGLARARRYGDHGRVVPPEFADIATGEGEQSQETVIPDSVTGSQWDRPQRNSTDTVNGTSHVNGETSTPTPQPQPTISFQGTLNQRLRDVAERERQAEKKRLKKREARKRKVENAADETPAATPAEEKSAEPLATAAPVKVSKKEQSKKAKEAQASTEAQAFNQSNQTAAMMALGGKKNRYSWMSGGAANMPTNRFAKPNSGTATPKAAEPAKAPIDAVKKDDEKKKLPTWGDWREDDVHGKGIQLRDWILVLERDGREKKALHKAVNKLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.57
3	0.54
4	0.61
5	0.62
6	0.59
7	0.58
8	0.51
9	0.47
10	0.45
11	0.41
12	0.34
13	0.32
14	0.27
15	0.2
16	0.19
17	0.19
18	0.19
19	0.17
20	0.19
21	0.24
22	0.29
23	0.33
24	0.31
25	0.4
26	0.51
27	0.59
28	0.56
29	0.53
30	0.57
31	0.63
32	0.71
33	0.71
34	0.71
35	0.71
36	0.7
37	0.72
38	0.64
39	0.57
40	0.54
41	0.46
42	0.35
43	0.3
44	0.32
45	0.28
46	0.26
47	0.23
48	0.18
49	0.19
50	0.21
51	0.2
52	0.19
53	0.2
54	0.25
55	0.31
56	0.3
57	0.28
58	0.27
59	0.27
60	0.31
61	0.33
62	0.29
63	0.26
64	0.25
65	0.26
66	0.29
67	0.31
68	0.26
69	0.27
70	0.26
71	0.26
72	0.29
73	0.34
74	0.34
75	0.32
76	0.35
77	0.34
78	0.34
79	0.35
80	0.36
81	0.36
82	0.33
83	0.34
84	0.35
85	0.35
86	0.37
87	0.38
88	0.4
89	0.37
90	0.39
91	0.4
92	0.42
93	0.47
94	0.52
95	0.55
96	0.56
97	0.61
98	0.67
99	0.7
100	0.74
101	0.71
102	0.67
103	0.64
104	0.67
105	0.66
106	0.64
107	0.64
108	0.59
109	0.59
110	0.55
111	0.54
112	0.49
113	0.45
114	0.45
115	0.44
116	0.46
117	0.45
118	0.49
119	0.57
120	0.61
121	0.62
122	0.61
123	0.65
124	0.65
125	0.7
126	0.74
127	0.68
128	0.69
129	0.65
130	0.6
131	0.54
132	0.47
133	0.38
134	0.28
135	0.23
136	0.14
137	0.11
138	0.1
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.06
145	0.06
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.09
150	0.1
151	0.11
152	0.13
153	0.16
154	0.15
155	0.17
156	0.18
157	0.22
158	0.26
159	0.33
160	0.37
161	0.34
162	0.38
163	0.4
164	0.45
165	0.48
166	0.48
167	0.45
168	0.4
169	0.4
170	0.38
171	0.35
172	0.29
173	0.22
174	0.2
175	0.16
176	0.15
177	0.14
178	0.13
179	0.14
180	0.16
181	0.19
182	0.19
183	0.18
184	0.19
185	0.2
186	0.2
187	0.18
188	0.16
189	0.17
190	0.15
191	0.14
192	0.13
193	0.13
194	0.12
195	0.13
196	0.12
197	0.08
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.06
202	0.06
203	0.04
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.06
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.1
213	0.12
214	0.16
215	0.16
216	0.15
217	0.16
218	0.24
219	0.32
220	0.39
221	0.4
222	0.4
223	0.42
224	0.43
225	0.42
226	0.37
227	0.37
228	0.4
229	0.48
230	0.56
231	0.61
232	0.65
233	0.68
234	0.69
235	0.66
236	0.6
237	0.54
238	0.54
239	0.49
240	0.47
241	0.47
242	0.43
243	0.4
244	0.37
245	0.34
246	0.24
247	0.25
248	0.22
249	0.23
250	0.24
251	0.29
252	0.28
253	0.31
254	0.41
255	0.45
256	0.48
257	0.47
258	0.49
259	0.46
260	0.5
261	0.46
262	0.38
263	0.31
264	0.27
265	0.23
266	0.2
267	0.15
268	0.11
269	0.11
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.11
275	0.14
276	0.15
277	0.15
278	0.16
279	0.18
280	0.19
281	0.18
282	0.18
283	0.16
284	0.18
285	0.2
286	0.18
287	0.16
288	0.13
289	0.12
290	0.11
291	0.09
292	0.07
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.07
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.08
338	0.08
339	0.14
340	0.21
341	0.25
342	0.3
343	0.32
344	0.34
345	0.35
346	0.36
347	0.31
348	0.25
349	0.21
350	0.15
351	0.13
352	0.11
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.1
374	0.13
375	0.17
376	0.25
377	0.27
378	0.29
379	0.35
380	0.37
381	0.4
382	0.41
383	0.39
384	0.38
385	0.37
386	0.37
387	0.31
388	0.29
389	0.25
390	0.21
391	0.2
392	0.13
393	0.11
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.11
398	0.13
399	0.13
400	0.14
401	0.16
402	0.17
403	0.19
404	0.19
405	0.23
406	0.23
407	0.29
408	0.28
409	0.27
410	0.26
411	0.3
412	0.31
413	0.33
414	0.34
415	0.29
416	0.28
417	0.28
418	0.3
419	0.29
420	0.3
421	0.31
422	0.35
423	0.36
424	0.4
425	0.45
426	0.49
427	0.49
428	0.55
429	0.56
430	0.58
431	0.65
432	0.72
433	0.75
434	0.79
435	0.84
436	0.86
437	0.89
438	0.89
439	0.9
440	0.9
441	0.9
442	0.91
443	0.87
444	0.83
445	0.79
446	0.71
447	0.62
448	0.51
449	0.42
450	0.32
451	0.26
452	0.18
453	0.1
454	0.08
455	0.08
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.14
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.16
464	0.12
465	0.14
466	0.14
467	0.11
468	0.1
469	0.14
470	0.16
471	0.2
472	0.25
473	0.3
474	0.4
475	0.49
476	0.56
477	0.63
478	0.71
479	0.76
480	0.8
481	0.8
482	0.75
483	0.71
484	0.67
485	0.63
486	0.56
487	0.49
488	0.44
489	0.37
490	0.31
491	0.33
492	0.28
493	0.22
494	0.25
495	0.23
496	0.19
497	0.19
498	0.19
499	0.13
500	0.12
501	0.11
502	0.06
503	0.07
504	0.12
505	0.15
506	0.17
507	0.18
508	0.2
509	0.22
510	0.27
511	0.29
512	0.29
513	0.28
514	0.33
515	0.34
516	0.34
517	0.33
518	0.31
519	0.3
520	0.27
521	0.26
522	0.2
523	0.21
524	0.22
525	0.21
526	0.21
527	0.21
528	0.28
529	0.29
530	0.35
531	0.36
532	0.4
533	0.42
534	0.42
535	0.47
536	0.39
537	0.36
538	0.34
539	0.33
540	0.3
541	0.28
542	0.33
543	0.29
544	0.29
545	0.29
546	0.29
547	0.34
548	0.34
549	0.35
550	0.34
551	0.38
552	0.45
553	0.53
554	0.56
555	0.55
556	0.61
557	0.65
558	0.67
559	0.65
560	0.66
561	0.68
562	0.69
563	0.69
564	0.63
565	0.61
566	0.56
567	0.55
568	0.5
569	0.42
570	0.37
571	0.3
572	0.3
573	0.3
574	0.28
575	0.27
576	0.26
577	0.25
578	0.22
579	0.22
580	0.21
581	0.19
582	0.19
583	0.18
584	0.23
585	0.23
586	0.3
587	0.32
588	0.35
589	0.37
590	0.39
591	0.46
592	0.49
593	0.56
594	0.56
595	0.62

A0A139IH60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer