FuNGI

A0A139IVV4

Protein Details

Accession

A0A139IVV4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
259-283	SEWHEQLKTMRKKQREKQTENQDLV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
329-347	RKRRVEAKERRKAAEKEFR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR038729 Rad50/SbcC_AAA IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF13476 AAA_23

Amino Acid Sequences

MPSSASATPHRRRRDEYEQGTENTGYESATSSPASKRHSRHHDIEDNDDDDDDQSQDAPLLPDSYRRSPKGKGRAIDAYNVSDASQEHSPGAIVRVTMKTFVTYTHAEFLPGPNLNMIIGPNGTGKSTLVCAICLGLGWKPEHLGRAKDLAEFVKHGAKEATIEIELKADTDIHPENPVITCIINRDGGKGDDKKTTFKINGRKSTRKAVQELCKNDYSIQVDNLCQFLPQDRVVEFAALSPVELLVQTQRAAADPYMSEWHEQLKTMRKKQREKQTENQDLVATLKGMESRQRSQAEDVEKFRKKEALRDRLNALEKMKPVAEYSDIRKRRVEAKERRKAAEKEFRALERRMEPNFTSMKTKDAYRKQLDRVVNQRSNLVAQTENRLGGEQGKLRDLGDQIQQCTAELNTEIDRVKKDKATVLRLQPDLNRLRAEKDKPAPEFDFEALSEKIKDLSDRIKEIDKEEDEPTDQMRSLGLQGRQRQEMIKEEQAKRVRLQSQAGKMSSQIQRHSAQSAKLWDWLQDNREQFSGHVFGPAIVECSVKDKRHASMIEAIIGAGDLKAYTVVNKQDFRKLTDHGFKTMRLWDLAVQSVIQPLSDFEHPLSDEQLKSLGLEGWVQDLLEGPEAVLSMLCSNKNLHKIPYGTSDKINDEQFEAIKRAGIMAWVTPTKTWTVARRYGHDSTKVSSFGPAKLLTDAPVNTQAEEEIGRKISELQDEIQQITEEMQGVKARASQLQRQKKELTAERDDLKKEKEEKQKRVAMWEGLDTKIANAEKKIEDAQAAVKSGYAKVSAIKDKELDLLLKKGQQALDYSRLLESLRRLHEQLFEAEIIRIEAESDYEQLKAQNEEERTQLAERQEEVGRLVAVEGQLQRAGEALVERIQQLSSDLTPEEDEVRQEITGKTLEDLNAMIEQQKARLEMAGHTGGQNLLKEYEDRERKIEQKRGELTALESNLEELDANITKIRDRWEPELDELVASISEAFSENFARVQCAGEVAVHKDEDFEQWAIQIKVKFRENESLAVLDSHRQSGGERAVSTIFYLMALQSLARAPFRVVDEINQGMDPRNERLVHSRMVDIACAEHTSQYFLITPKLLNGLKYHKNMKVHCIASGEYMPDSKEENRLGTFEEMAMKALAIRNSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.79
3	0.78
4	0.78
5	0.74
6	0.7
7	0.66
8	0.57
9	0.47
10	0.38
11	0.29
12	0.2
13	0.14
14	0.14
15	0.12
16	0.14
17	0.14
18	0.15
19	0.2
20	0.25
21	0.32
22	0.38
23	0.43
24	0.52
25	0.61
26	0.67
27	0.71
28	0.75
29	0.77
30	0.73
31	0.74
32	0.69
33	0.6
34	0.52
35	0.44
36	0.35
37	0.26
38	0.24
39	0.16
40	0.11
41	0.1
42	0.09
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.11
47	0.13
48	0.13
49	0.2
50	0.26
51	0.35
52	0.42
53	0.45
54	0.48
55	0.55
56	0.64
57	0.68
58	0.7
59	0.64
60	0.63
61	0.68
62	0.66
63	0.64
64	0.57
65	0.5
66	0.43
67	0.39
68	0.32
69	0.24
70	0.22
71	0.19
72	0.18
73	0.15
74	0.14
75	0.14
76	0.14
77	0.14
78	0.16
79	0.13
80	0.11
81	0.14
82	0.17
83	0.18
84	0.2
85	0.19
86	0.19
87	0.18
88	0.19
89	0.21
90	0.2
91	0.22
92	0.25
93	0.24
94	0.24
95	0.24
96	0.25
97	0.27
98	0.25
99	0.23
100	0.19
101	0.19
102	0.17
103	0.17
104	0.15
105	0.1
106	0.09
107	0.1
108	0.11
109	0.12
110	0.12
111	0.12
112	0.12
113	0.11
114	0.12
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.11
123	0.09
124	0.13
125	0.13
126	0.14
127	0.15
128	0.17
129	0.23
130	0.26
131	0.27
132	0.27
133	0.32
134	0.32
135	0.32
136	0.33
137	0.3
138	0.28
139	0.26
140	0.25
141	0.25
142	0.24
143	0.24
144	0.22
145	0.2
146	0.19
147	0.19
148	0.2
149	0.15
150	0.16
151	0.14
152	0.15
153	0.14
154	0.13
155	0.12
156	0.1
157	0.09
158	0.13
159	0.15
160	0.15
161	0.17
162	0.16
163	0.18
164	0.17
165	0.18
166	0.14
167	0.12
168	0.12
169	0.13
170	0.15
171	0.19
172	0.18
173	0.2
174	0.21
175	0.23
176	0.3
177	0.32
178	0.32
179	0.36
180	0.37
181	0.4
182	0.41
183	0.46
184	0.45
185	0.48
186	0.55
187	0.57
188	0.66
189	0.7
190	0.76
191	0.73
192	0.77
193	0.77
194	0.74
195	0.71
196	0.7
197	0.7
198	0.7
199	0.71
200	0.66
201	0.6
202	0.55
203	0.48
204	0.45
205	0.39
206	0.32
207	0.3
208	0.26
209	0.25
210	0.25
211	0.25
212	0.2
213	0.16
214	0.14
215	0.14
216	0.15
217	0.16
218	0.17
219	0.16
220	0.18
221	0.19
222	0.19
223	0.16
224	0.13
225	0.13
226	0.1
227	0.1
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.1
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.1
243	0.12
244	0.15
245	0.16
246	0.16
247	0.15
248	0.19
249	0.18
250	0.19
251	0.22
252	0.29
253	0.38
254	0.47
255	0.54
256	0.59
257	0.69
258	0.76
259	0.83
260	0.83
261	0.83
262	0.83
263	0.86
264	0.86
265	0.78
266	0.7
267	0.59
268	0.49
269	0.41
270	0.31
271	0.2
272	0.11
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.15
277	0.2
278	0.22
279	0.3
280	0.32
281	0.33
282	0.35
283	0.4
284	0.41
285	0.41
286	0.43
287	0.46
288	0.48
289	0.47
290	0.46
291	0.47
292	0.41
293	0.45
294	0.5
295	0.51
296	0.52
297	0.55
298	0.57
299	0.57
300	0.6
301	0.54
302	0.46
303	0.4
304	0.34
305	0.33
306	0.3
307	0.24
308	0.2
309	0.19
310	0.2
311	0.19
312	0.24
313	0.32
314	0.35
315	0.37
316	0.38
317	0.39
318	0.44
319	0.5
320	0.55
321	0.56
322	0.63
323	0.71
324	0.74
325	0.75
326	0.75
327	0.7
328	0.69
329	0.68
330	0.6
331	0.56
332	0.55
333	0.55
334	0.51
335	0.48
336	0.43
337	0.39
338	0.41
339	0.37
340	0.38
341	0.34
342	0.34
343	0.36
344	0.32
345	0.32
346	0.27
347	0.28
348	0.26
349	0.3
350	0.34
351	0.39
352	0.47
353	0.49
354	0.55
355	0.56
356	0.62
357	0.62
358	0.6
359	0.6
360	0.6
361	0.56
362	0.51
363	0.48
364	0.41
365	0.38
366	0.31
367	0.25
368	0.18
369	0.15
370	0.19
371	0.19
372	0.19
373	0.17
374	0.17
375	0.15
376	0.15
377	0.17
378	0.16
379	0.16
380	0.17
381	0.17
382	0.17
383	0.19
384	0.17
385	0.16
386	0.19
387	0.2
388	0.2
389	0.21
390	0.21
391	0.18
392	0.18
393	0.15
394	0.1
395	0.08
396	0.09
397	0.08
398	0.11
399	0.12
400	0.12
401	0.15
402	0.16
403	0.18
404	0.19
405	0.2
406	0.23
407	0.29
408	0.34
409	0.39
410	0.43
411	0.46
412	0.45
413	0.45
414	0.41
415	0.43
416	0.39
417	0.34
418	0.3
419	0.25
420	0.28
421	0.33
422	0.34
423	0.35
424	0.39
425	0.43
426	0.42
427	0.47
428	0.44
429	0.39
430	0.38
431	0.31
432	0.25
433	0.19
434	0.21
435	0.16
436	0.15
437	0.13
438	0.11
439	0.12
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.16
444	0.19
445	0.2
446	0.22
447	0.25
448	0.26
449	0.27
450	0.31
451	0.26
452	0.26
453	0.25
454	0.24
455	0.21
456	0.2
457	0.19
458	0.14
459	0.13
460	0.1
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.14
465	0.16
466	0.21
467	0.26
468	0.29
469	0.31
470	0.31
471	0.3
472	0.27
473	0.29
474	0.29
475	0.3
476	0.35
477	0.36
478	0.43
479	0.46
480	0.46
481	0.42
482	0.44
483	0.41
484	0.35
485	0.39
486	0.37
487	0.39
488	0.41
489	0.4
490	0.34
491	0.31
492	0.35
493	0.34
494	0.31
495	0.26
496	0.26
497	0.27
498	0.28
499	0.3
500	0.25
501	0.22
502	0.22
503	0.24
504	0.21
505	0.22
506	0.22
507	0.21
508	0.21
509	0.23
510	0.22
511	0.23
512	0.24
513	0.21
514	0.22
515	0.2
516	0.17
517	0.17
518	0.17
519	0.12
520	0.12
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.07
527	0.07
528	0.06
529	0.11
530	0.15
531	0.15
532	0.18
533	0.19
534	0.19
535	0.25
536	0.26
537	0.23
538	0.25
539	0.25
540	0.23
541	0.21
542	0.2
543	0.14
544	0.13
545	0.11
546	0.04
547	0.03
548	0.02
549	0.02
550	0.03
551	0.03
552	0.04
553	0.07
554	0.1
555	0.14
556	0.17
557	0.19
558	0.24
559	0.26
560	0.29
561	0.29
562	0.28
563	0.3
564	0.35
565	0.35
566	0.34
567	0.34
568	0.3
569	0.3
570	0.31
571	0.26
572	0.18
573	0.17
574	0.15
575	0.15
576	0.15
577	0.13
578	0.1
579	0.09
580	0.1
581	0.09
582	0.07
583	0.05
584	0.05
585	0.07
586	0.08
587	0.08
588	0.07
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.11
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.11
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.07
601	0.06
602	0.07
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.05
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.03
618	0.04
619	0.05
620	0.06
621	0.07
622	0.08
623	0.12
624	0.18
625	0.19
626	0.2
627	0.23
628	0.25
629	0.26
630	0.33
631	0.35
632	0.3
633	0.31
634	0.31
635	0.29
636	0.31
637	0.3
638	0.22
639	0.18
640	0.17
641	0.16
642	0.15
643	0.14
644	0.11
645	0.11
646	0.1
647	0.09
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.06
652	0.08
653	0.08
654	0.09
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.11
659	0.14
660	0.17
661	0.23
662	0.3
663	0.32
664	0.35
665	0.41
666	0.43
667	0.44
668	0.43
669	0.39
670	0.34
671	0.34
672	0.31
673	0.25
674	0.24
675	0.23
676	0.18
677	0.19
678	0.18
679	0.16
680	0.16
681	0.16
682	0.13
683	0.14
684	0.13
685	0.12
686	0.17
687	0.17
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.12
692	0.13
693	0.12
694	0.08
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.11
699	0.12
700	0.13
701	0.13
702	0.13
703	0.17
704	0.18
705	0.18
706	0.17
707	0.15
708	0.13
709	0.12
710	0.12
711	0.08
712	0.07
713	0.08
714	0.09
715	0.09
716	0.09
717	0.1
718	0.11
719	0.15
720	0.18
721	0.24
722	0.34
723	0.44
724	0.46
725	0.49
726	0.51
727	0.5
728	0.54
729	0.54
730	0.51
731	0.47
732	0.48
733	0.47
734	0.48
735	0.47
736	0.42
737	0.38
738	0.37
739	0.36
740	0.42
741	0.49
742	0.55
743	0.6
744	0.66
745	0.7
746	0.64
747	0.65
748	0.59
749	0.51
750	0.42
751	0.39
752	0.32
753	0.26
754	0.26
755	0.2
756	0.16
757	0.18
758	0.18
759	0.14
760	0.13
761	0.16
762	0.16
763	0.18
764	0.2
765	0.16
766	0.15
767	0.15
768	0.18
769	0.16
770	0.16
771	0.14
772	0.14
773	0.14
774	0.14
775	0.14
776	0.1
777	0.09
778	0.12
779	0.17
780	0.21
781	0.22
782	0.23
783	0.23
784	0.23
785	0.25
786	0.23
787	0.2
788	0.17
789	0.19
790	0.19
791	0.21
792	0.21
793	0.22
794	0.21
795	0.2
796	0.21
797	0.23
798	0.27
799	0.25
800	0.25
801	0.22
802	0.22
803	0.21
804	0.2
805	0.19
806	0.2
807	0.23
808	0.25
809	0.26
810	0.27
811	0.31
812	0.31
813	0.29
814	0.24
815	0.21
816	0.19
817	0.18
818	0.16
819	0.12
820	0.1
821	0.08
822	0.07
823	0.06
824	0.07
825	0.07
826	0.08
827	0.09
828	0.09
829	0.1
830	0.11
831	0.13
832	0.13
833	0.14
834	0.18
835	0.21
836	0.21
837	0.22
838	0.22
839	0.22
840	0.21
841	0.23
842	0.2
843	0.2
844	0.19
845	0.21
846	0.22
847	0.2
848	0.2
849	0.18
850	0.15
851	0.13
852	0.12
853	0.09
854	0.08
855	0.11
856	0.1
857	0.1
858	0.11
859	0.11
860	0.11
861	0.1
862	0.1
863	0.07
864	0.07
865	0.08
866	0.09
867	0.1
868	0.1
869	0.11
870	0.11
871	0.1
872	0.11
873	0.12
874	0.1
875	0.11
876	0.1
877	0.11
878	0.11
879	0.12
880	0.13
881	0.12
882	0.12
883	0.12
884	0.13
885	0.12
886	0.13
887	0.13
888	0.13
889	0.14
890	0.13
891	0.13
892	0.14
893	0.14
894	0.13
895	0.13
896	0.12
897	0.11
898	0.11
899	0.11
900	0.11
901	0.12
902	0.13
903	0.14
904	0.14
905	0.14
906	0.15
907	0.15
908	0.14
909	0.19
910	0.2
911	0.18
912	0.17
913	0.18
914	0.17
915	0.18
916	0.17
917	0.13
918	0.12
919	0.12
920	0.13
921	0.15
922	0.24
923	0.3
924	0.31
925	0.34
926	0.38
927	0.46
928	0.54
929	0.59
930	0.55
931	0.57
932	0.6
933	0.59
934	0.56
935	0.49
936	0.43
937	0.41
938	0.36
939	0.27
940	0.22
941	0.19
942	0.17
943	0.16
944	0.12
945	0.06
946	0.09
947	0.09
948	0.1
949	0.12
950	0.12
951	0.14
952	0.16
953	0.2
954	0.23
955	0.27
956	0.33
957	0.38
958	0.41
959	0.42
960	0.44
961	0.4
962	0.34
963	0.29
964	0.23
965	0.16
966	0.12
967	0.09
968	0.05
969	0.05
970	0.06
971	0.06
972	0.07
973	0.08
974	0.09
975	0.11
976	0.12
977	0.13
978	0.13
979	0.14
980	0.13
981	0.13
982	0.13
983	0.13
984	0.15
985	0.17
986	0.19
987	0.17
988	0.17
989	0.17
990	0.18
991	0.18
992	0.19
993	0.17
994	0.14
995	0.16
996	0.21
997	0.21
998	0.24
999	0.25
1000	0.26
1001	0.32
1002	0.38
1003	0.4
1004	0.39
1005	0.48
1006	0.46
1007	0.46
1008	0.44
1009	0.38
1010	0.32
1011	0.31
1012	0.27
1013	0.23
1014	0.22
1015	0.19
1016	0.17
1017	0.16
1018	0.16
1019	0.21
1020	0.26
1021	0.25
1022	0.24
1023	0.24
1024	0.25
1025	0.25
1026	0.25
1027	0.19
1028	0.13
1029	0.09
1030	0.1
1031	0.08
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.06
1035	0.07
1036	0.1
1037	0.11
1038	0.12
1039	0.13
1040	0.13
1041	0.17
1042	0.2
1043	0.23
1044	0.21
1045	0.23
1046	0.28
1047	0.29
1048	0.29
1049	0.26
1050	0.23
1051	0.22
1052	0.25
1053	0.25
1054	0.23
1055	0.28
1056	0.27
1057	0.3
1058	0.36
1059	0.38
1060	0.38
1061	0.38
1062	0.36
1063	0.34
1064	0.33
1065	0.31
1066	0.24
1067	0.21
1068	0.18
1069	0.17
1070	0.16
1071	0.15
1072	0.15
1073	0.17
1074	0.17
1075	0.17
1076	0.19
1077	0.18
1078	0.21
1079	0.2
1080	0.2
1081	0.18
1082	0.26
1083	0.26
1084	0.25
1085	0.29
1086	0.35
1087	0.41
1088	0.48
1089	0.53
1090	0.52
1091	0.59
1092	0.6
1093	0.63
1094	0.63
1095	0.56
1096	0.52
1097	0.48
1098	0.43
1099	0.4
1100	0.39
1101	0.32
1102	0.24
1103	0.24
1104	0.22
1105	0.2
1106	0.23
1107	0.2
1108	0.25
1109	0.26
1110	0.28
1111	0.29
1112	0.29
1113	0.31
1114	0.3
1115	0.28
1116	0.23
1117	0.25
1118	0.21
1119	0.21
1120	0.2
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.2

A0A139IVV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer